187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0523 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A0539  hypothetical protein  99.36 
 
 
311 aa  634    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0523  hypothetical protein  100 
 
 
311 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0529  hypothetical protein  98.39 
 
 
311 aa  624  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0520  hypothetical protein  96.78 
 
 
307 aa  611  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3726  putative transposase  56.72 
 
 
310 aa  358  7e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3878  hypothetical protein  55.23 
 
 
308 aa  352  5e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0599  putative transposase YhgA family protein  54.19 
 
 
318 aa  351  8e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3710  hypothetical protein  54.58 
 
 
304 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3782  hypothetical protein  54.58 
 
 
304 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0039  transposase  52.26 
 
 
316 aa  342  4e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3816  hypothetical protein  54.25 
 
 
304 aa  342  5e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.792275 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3707  hypothetical protein  54.25 
 
 
304 aa  342  7e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0086  putative transposase  54.1 
 
 
319 aa  341  1e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.864811  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0084  hypothetical protein  54.1 
 
 
319 aa  341  1e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4129  putative transposase YhgA family protein  54.1 
 
 
319 aa  341  1e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.683023  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3973  hypothetical protein  52.72 
 
 
309 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0122  putative transposase  52.4 
 
 
313 aa  332  6e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  1.2156300000000001e-29 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4045  hypothetical protein  52.4 
 
 
309 aa  331  9e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.673826  normal  0.0374243 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4851  hypothetical protein  51.75 
 
 
321 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4776  hypothetical protein  52.09 
 
 
317 aa  326  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4874  hypothetical protein  52.09 
 
 
317 aa  326  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.702519 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4096  hypothetical protein  53.04 
 
 
313 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3991  hypothetical protein  53.04 
 
 
313 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0029  transposase  50.96 
 
 
320 aa  322  3e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4159  hypothetical protein  53.04 
 
 
313 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.241117  normal  0.413105 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2461  hypothetical protein  50.65 
 
 
300 aa  322  6e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.171355  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3382  hypothetical protein  49.35 
 
 
308 aa  317  2e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2397  hypothetical protein  48.24 
 
 
319 aa  317  2e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04729  hypothetical protein  50.16 
 
 
309 aa  316  3e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3692  hypothetical protein  49.84 
 
 
292 aa  316  3e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03263  predicted transposase  49.84 
 
 
292 aa  316  4e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.100095  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3608  hypothetical protein  49.84 
 
 
292 aa  316  4e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03215  hypothetical protein  49.84 
 
 
292 aa  316  4e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0821559  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0302  hypothetical protein  49.84 
 
 
292 aa  316  4e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.094929  normal  0.0909002 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3046  transposase  52.98 
 
 
282 aa  316  4e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131132  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02230  hypothetical protein  50 
 
 
296 aa  315  6e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.326611  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02190  hypothetical protein  50 
 
 
296 aa  315  6e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.428095  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2599  hypothetical protein  50 
 
 
296 aa  315  6e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00513302  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0302  putative transposase YhgA family protein  49.51 
 
 
292 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.78914  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1351  putative transposase YhgA family protein  50 
 
 
296 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0581087  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1347  putative transposase YhgA family protein  50 
 
 
296 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0644465  normal  0.765955 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3792  hypothetical protein  49.51 
 
 
292 aa  314  9.999999999999999e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4718  hypothetical protein  49.18 
 
 
292 aa  312  5.999999999999999e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3886  hypothetical protein  49.18 
 
 
292 aa  312  5.999999999999999e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3445  hypothetical protein  48.69 
 
 
296 aa  309  4e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.143681  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1406  hypothetical protein  48.85 
 
 
299 aa  305  8.000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.286093  normal  0.84386 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2542  hypothetical protein  48.06 
 
 
300 aa  305  9.000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2627  hypothetical protein  48.06 
 
 
300 aa  305  9.000000000000001e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0141  hypothetical protein  47.57 
 
 
298 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1415  putative transposase YhgA family protein  48.52 
 
 
299 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.571537  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0125  hypothetical protein  47.57 
 
 
298 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02170  hypothetical protein  47.74 
 
 
300 aa  301  1e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0135  hypothetical protein  47.25 
 
 
300 aa  301  1e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2386  hypothetical protein  47.74 
 
 
300 aa  300  2e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00131  predicted transposase  46.93 
 
 
300 aa  298  7e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3470  putative transposase YhgA family protein  46.93 
 
 
300 aa  298  7e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00130  hypothetical protein  46.93 
 
 
300 aa  298  7e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.969091  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3527  putative transposase YhgA family protein  46.93 
 
 
300 aa  298  7e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.653665  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4766  hypothetical protein  47.23 
 
 
334 aa  298  8e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02129  hypothetical protein  50 
 
 
282 aa  296  4e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1429  putative transposase YhgA family protein  47.84 
 
 
302 aa  295  5e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0142  ISNCY family transposase  47.25 
 
 
306 aa  293  3e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4885  hypothetical protein  46.58 
 
 
318 aa  291  7e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287711  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4566  hypothetical protein  46.91 
 
 
314 aa  291  1e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2727  putative transposase YhgA family protein  49.48 
 
 
310 aa  290  2e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3724  putative transposase YhgA family protein  47.23 
 
 
314 aa  290  2e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1547  putative transposase YhgA family protein  47.54 
 
 
288 aa  281  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.738107  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0068  putative transposase  47.71 
 
 
296 aa  280  2e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.565138  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04207  predicted transposase  51.79 
 
 
255 aa  277  2e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0911  putative transposase YhgA family protein  45.36 
 
 
298 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0065  hypothetical protein  47.71 
 
 
313 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0980043  hitchhiker  0.0000000385113 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0136  hypothetical protein  44.53 
 
 
238 aa  223  3e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3432  putative transposase YhgA family protein  49.1 
 
 
218 aa  223  3e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0894  hypothetical protein  30.38 
 
 
308 aa  143  3e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.284853 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04171  hypothetical protein  47.41 
 
 
135 aa  143  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3166  putative transposase YhgA family protein  28.57 
 
 
317 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1306  hypothetical protein  32.5 
 
 
275 aa  137  2e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1089  putative transposase  33.56 
 
 
337 aa  133  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.693638  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04170  hypothetical protein  57.73 
 
 
103 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.858892  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2902  putative transposase  31 
 
 
335 aa  119  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6237  putative transposase  31.6 
 
 
345 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.62735  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2880  hypothetical protein  32.97 
 
 
323 aa  116  5e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.149752  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0802  putative transposase  32.52 
 
 
333 aa  116  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2960  putative transposase  32.86 
 
 
329 aa  116  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.26307  normal  0.0520741 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1059  putative transposase  32.16 
 
 
329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1250  hypothetical protein  27.45 
 
 
331 aa  112  7.000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0878  putative transposase  32.63 
 
 
321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110546  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0990  putative transposase  32.28 
 
 
321 aa  109  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.271034  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1963  putative transposase  27.91 
 
 
331 aa  104  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0706346  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0628  hypothetical protein  25.44 
 
 
327 aa  102  8e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.939458  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1045  putative transposase  26.75 
 
 
343 aa  102  9e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0831423  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1108  putative transposase  28.42 
 
 
339 aa  100  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2153  hypothetical protein  26.4 
 
 
332 aa  100  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.101261 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4072  putative transposase  23.1 
 
 
340 aa  99.4  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0409  hypothetical protein  26.87 
 
 
336 aa  99  9e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.650641  hitchhiker  0.00708611 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4028  putative transposase  23.1 
 
 
340 aa  98.6  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2623  hypothetical protein  28.11 
 
 
322 aa  98.6  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0276584  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2698  hypothetical protein  28.16 
 
 
318 aa  96.7  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2863  hypothetical protein  27.76 
 
 
322 aa  96.7  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.113899 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1150  putative transposase  31.69 
 
 
330 aa  96.3  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>