139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_03263 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03263  predicted transposase  100 
 
 
292 aa  607  1e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.100095  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3608  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  607  1e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03215  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  607  1e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0821559  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0302  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  607  1e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.094929  normal  0.0909002 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3886  hypothetical protein  99.32 
 
 
292 aa  604  9.999999999999999e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3792  hypothetical protein  99.66 
 
 
292 aa  605  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0302  putative transposase YhgA family protein  98.97 
 
 
292 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.78914  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3692  hypothetical protein  99.32 
 
 
292 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4718  hypothetical protein  98.29 
 
 
292 aa  600  1e-170  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02230  hypothetical protein  64.86 
 
 
296 aa  412  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.326611  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1351  putative transposase YhgA family protein  64.86 
 
 
296 aa  411  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0581087  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02190  hypothetical protein  64.86 
 
 
296 aa  412  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.428095  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2599  hypothetical protein  64.86 
 
 
296 aa  412  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00513302  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1347  putative transposase YhgA family protein  64.86 
 
 
296 aa  411  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0644465  normal  0.765955 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2461  hypothetical protein  64.33 
 
 
300 aa  413  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.171355  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3445  hypothetical protein  64.19 
 
 
296 aa  409  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.143681  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3782  hypothetical protein  60.86 
 
 
304 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3816  hypothetical protein  61.18 
 
 
304 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.792275 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3707  hypothetical protein  61.18 
 
 
304 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3710  hypothetical protein  60.86 
 
 
304 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3878  hypothetical protein  60.71 
 
 
308 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2542  hypothetical protein  60.54 
 
 
300 aa  384  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2627  hypothetical protein  60.54 
 
 
300 aa  384  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4045  hypothetical protein  60.13 
 
 
309 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.673826  normal  0.0374243 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3973  hypothetical protein  60.13 
 
 
309 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02170  hypothetical protein  60.2 
 
 
300 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2386  hypothetical protein  60.2 
 
 
300 aa  379  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4096  hypothetical protein  59.35 
 
 
313 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3991  hypothetical protein  59.35 
 
 
313 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4159  hypothetical protein  59.35 
 
 
313 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.241117  normal  0.413105 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4874  hypothetical protein  57.1 
 
 
317 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.702519 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4776  hypothetical protein  57.1 
 
 
317 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3382  hypothetical protein  58.96 
 
 
308 aa  377  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1406  hypothetical protein  59.66 
 
 
299 aa  374  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.286093  normal  0.84386 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4851  hypothetical protein  56.39 
 
 
321 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1415  putative transposase YhgA family protein  58.98 
 
 
299 aa  368  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.571537  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2397  hypothetical protein  65.23 
 
 
319 aa  369  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02129  hypothetical protein  62.59 
 
 
282 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4885  hypothetical protein  55.08 
 
 
318 aa  354  1e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287711  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0086  putative transposase  55.15 
 
 
319 aa  346  3e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.864811  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0084  hypothetical protein  55.15 
 
 
319 aa  346  3e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4129  putative transposase YhgA family protein  55.15 
 
 
319 aa  346  3e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.683023  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4766  hypothetical protein  54.3 
 
 
334 aa  344  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04207  predicted transposase  61.18 
 
 
255 aa  342  5e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4566  hypothetical protein  54.49 
 
 
314 aa  340  2e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0039  transposase  52.7 
 
 
316 aa  338  4e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3726  putative transposase  54.1 
 
 
310 aa  338  7e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0029  transposase  51.88 
 
 
320 aa  335  7e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3724  putative transposase YhgA family protein  53.49 
 
 
314 aa  334  1e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0122  putative transposase  50 
 
 
313 aa  320  1.9999999999999998e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  1.2156300000000001e-29 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0520  hypothetical protein  50.33 
 
 
307 aa  318  7e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0539  hypothetical protein  49.84 
 
 
311 aa  316  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0523  hypothetical protein  49.84 
 
 
311 aa  316  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0599  putative transposase YhgA family protein  50.48 
 
 
318 aa  315  5e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0529  hypothetical protein  49.51 
 
 
311 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04729  hypothetical protein  47.51 
 
 
309 aa  303  2.0000000000000002e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0068  putative transposase  51.86 
 
 
296 aa  302  5.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.565138  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3046  transposase  52.31 
 
 
282 aa  298  8e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131132  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0125  hypothetical protein  49.31 
 
 
298 aa  291  1e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0135  hypothetical protein  49.31 
 
 
300 aa  290  2e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0141  hypothetical protein  48.97 
 
 
298 aa  290  2e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0065  hypothetical protein  48.87 
 
 
313 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0980043  hitchhiker  0.0000000385113 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00131  predicted transposase  50.18 
 
 
300 aa  287  1e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3470  putative transposase YhgA family protein  50.18 
 
 
300 aa  287  1e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0911  putative transposase YhgA family protein  50.35 
 
 
298 aa  288  1e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3527  putative transposase YhgA family protein  50.18 
 
 
300 aa  287  1e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.653665  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00130  hypothetical protein  50.18 
 
 
300 aa  287  1e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.969091  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0142  ISNCY family transposase  52.96 
 
 
306 aa  285  8e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1429  putative transposase YhgA family protein  47.93 
 
 
302 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2727  putative transposase YhgA family protein  55.1 
 
 
310 aa  275  7e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1547  putative transposase YhgA family protein  48.56 
 
 
288 aa  253  3e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.738107  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0136  hypothetical protein  47.96 
 
 
238 aa  216  4e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3432  putative transposase YhgA family protein  47.66 
 
 
218 aa  210  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04171  hypothetical protein  66.67 
 
 
135 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0894  hypothetical protein  30.63 
 
 
308 aa  151  1e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.284853 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04170  hypothetical protein  58.25 
 
 
103 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.858892  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1306  hypothetical protein  30.68 
 
 
275 aa  122  7e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3166  putative transposase YhgA family protein  29.45 
 
 
317 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2880  hypothetical protein  31.18 
 
 
323 aa  102  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.149752  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1250  hypothetical protein  26.74 
 
 
331 aa  101  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2547  hypothetical protein  30 
 
 
314 aa  99.8  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0376053  normal  0.0608447 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2781  hypothetical protein  29.62 
 
 
314 aa  99  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.664556  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2623  hypothetical protein  29.62 
 
 
322 aa  98.6  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0276584  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2698  hypothetical protein  29.62 
 
 
318 aa  98.6  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2863  hypothetical protein  34.09 
 
 
322 aa  98.2  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.113899 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0628  hypothetical protein  36.67 
 
 
327 aa  95.1  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.939458  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0045  hypothetical protein  29.08 
 
 
341 aa  94  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.242935 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0147  hypothetical protein  38.66 
 
 
141 aa  92  9e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.320665  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2785  hypothetical protein  28.68 
 
 
310 aa  92  9e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4924  hypothetical protein  41.04 
 
 
170 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.414279  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2902  putative transposase  28.52 
 
 
335 aa  90.5  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1089  putative transposase  28.21 
 
 
337 aa  87  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.693638  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2960  putative transposase  28.21 
 
 
329 aa  85.5  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.26307  normal  0.0520741 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6237  putative transposase  28.68 
 
 
345 aa  84.7  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.62735  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1504  putative transposase  36.67 
 
 
350 aa  82.4  0.000000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0802  putative transposase  28.83 
 
 
333 aa  80.5  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1059  putative transposase  27.11 
 
 
329 aa  79  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0878  putative transposase  29.34 
 
 
321 aa  78.2  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110546  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1722  hypothetical protein  24.58 
 
 
308 aa  75.1  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000483242  normal  0.789674 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0990  putative transposase  32 
 
 
321 aa  74.7  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.271034  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>