143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3724 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A4566  hypothetical protein  98.09 
 
 		 314 aa  636    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3724  putative transposase YhgA family protein  100 
 
 		 314 aa  649    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4885  hypothetical protein  91.82 
 
 		 318 aa  597  1e-170  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4766  hypothetical protein  91.45 
 
 		 334 aa  570  1.0000000000000001e-162  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04207  predicted transposase  95.69 
 
 		 255 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3782  hypothetical protein  64.19 
 
 		 304 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3816  hypothetical protein  64.19 
 
 		 304 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.792275 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3707  hypothetical protein  64.19 
 
 		 304 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3710  hypothetical protein  64.19 
 
 		 304 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3878  hypothetical protein  63.67 
 
 		 308 aa  401  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2461  hypothetical protein  62.42 
 
 		 300 aa  384  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.171355  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02230  hypothetical protein  62.08 
 
 		 296 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.326611  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1351  putative transposase YhgA family protein  61.74 
 
 		 296 aa  378  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0581087  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2599  hypothetical protein  62.08 
 
 		 296 aa  379  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00513302  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3445  hypothetical protein  62.42 
 
 		 296 aa  379  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.143681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1347  putative transposase YhgA family protein  61.74 
 
 		 296 aa  378  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0644465  normal  0.765955 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4045  hypothetical protein  60.26 
 
 		 309 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.673826  normal  0.0374243 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3973  hypothetical protein  60.26 
 
 		 309 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02190  hypothetical protein  62.08 
 
 		 296 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.428095  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4096  hypothetical protein  59.49 
 
 		 313 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4776  hypothetical protein  58.92 
 
 		 317 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3991  hypothetical protein  59.49 
 
 		 313 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4851  hypothetical protein  58.18 
 
 		 321 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4159  hypothetical protein  59.49 
 
 		 313 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.241117  normal  0.413105 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4874  hypothetical protein  58.28 
 
 		 317 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.702519 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2397  hypothetical protein  60.22 
 
 		 319 aa  352  5e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2542  hypothetical protein  55.7 
 
 		 300 aa  350  2e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2627  hypothetical protein  55.7 
 
 		 300 aa  350  2e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3382  hypothetical protein  55.23 
 
 		 308 aa  349  3e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1406  hypothetical protein  56.16 
 
 		 299 aa  346  2e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.286093  normal  0.84386 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02170  hypothetical protein  55.37 
 
 		 300 aa  346  3e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2386  hypothetical protein  55.37 
 
 		 300 aa  346  4e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0302  putative transposase YhgA family protein  54.43 
 
 		 292 aa  344  1e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.78914  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3792  hypothetical protein  54.1 
 
 		 292 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02129  hypothetical protein  57.3 
 
 		 282 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03263  predicted transposase  53.77 
 
 		 292 aa  341  9e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.100095  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03215  hypothetical protein  53.77 
 
 		 292 aa  341  9e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0821559  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3608  hypothetical protein  53.77 
 
 		 292 aa  341  9e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0302  hypothetical protein  53.77 
 
 		 292 aa  341  9e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.094929  normal  0.0909002 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1415  putative transposase YhgA family protein  55.82 
 
 		 299 aa  341  1e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.571537  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3886  hypothetical protein  53.77 
 
 		 292 aa  340  1e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4718  hypothetical protein  53.77 
 
 		 292 aa  339  4e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3692  hypothetical protein  53.44 
 
 		 292 aa  339  4e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3726  putative transposase  51.64 
 
 		 310 aa  322  6e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0086  putative transposase  50.66 
 
 		 319 aa  315  8e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.864811  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0084  hypothetical protein  50.66 
 
 		 319 aa  315  8e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4129  putative transposase YhgA family protein  50.66 
 
 		 319 aa  315  8e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.683023  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0122  putative transposase  50.99 
 
 		 313 aa  313  2.9999999999999996e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.2156300000000001e-29 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0599  putative transposase YhgA family protein  49.68 
 
 		 318 aa  306  3e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0039  transposase  47.62 
 
 		 316 aa  303  4.0000000000000003e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0539  hypothetical protein  48.53 
 
 		 311 aa  299  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0520  hypothetical protein  47.85 
 
 		 307 aa  299  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0068  putative transposase  50.66 
 
 		 296 aa  296  3e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.565138  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0523  hypothetical protein  48.21 
 
 		 311 aa  296  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0029  transposase  45.11 
 
 		 320 aa  295  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0529  hypothetical protein  48.21 
 
 		 311 aa  295  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0135  hypothetical protein  50.17 
 
 		 300 aa  290  2e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0125  hypothetical protein  48.98 
 
 		 298 aa  290  2e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0141  hypothetical protein  48.64 
 
 		 298 aa  290  2e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00131  predicted transposase  48.18 
 
 		 300 aa  288  7e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3470  putative transposase YhgA family protein  48.18 
 
 		 300 aa  288  7e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3527  putative transposase YhgA family protein  48.18 
 
 		 300 aa  288  7e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.653665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00130  hypothetical protein  48.18 
 
 		 300 aa  288  7e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.969091  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04729  hypothetical protein  43.89 
 
 		 309 aa  285  5e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0065  hypothetical protein  56.8 
 
 		 313 aa  285  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0980043  hitchhiker  0.0000000385113 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1429  putative transposase YhgA family protein  49.32 
 
 		 302 aa  282  5.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0142  ISNCY family transposase  50.92 
 
 		 306 aa  278  6e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0911  putative transposase YhgA family protein  47.77 
 
 		 298 aa  278  1e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2727  putative transposase YhgA family protein  48.96 
 
 		 310 aa  271  1e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04171  hypothetical protein  95.56 
 
 		 135 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3046  transposase  46.24 
 
 		 282 aa  269  5e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131132  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1547  putative transposase YhgA family protein  44.62 
 
 		 288 aa  248  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.738107  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04170  hypothetical protein  96.12 
 
 		 103 aa  206  3e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.858892  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0136  hypothetical protein  46.49 
 
 		 238 aa  205  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3432  putative transposase YhgA family protein  47.2 
 
 		 218 aa  204  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0894  hypothetical protein  32.46 
 
 		 308 aa  163  3e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.284853 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3166  putative transposase YhgA family protein  27.71 
 
 		 317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1250  hypothetical protein  29.47 
 
 		 331 aa  105  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1306  hypothetical protein  27.5 
 
 		 275 aa  101  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2785  hypothetical protein  28.85 
 
 		 310 aa  97.8  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2880  hypothetical protein  30.45 
 
 		 323 aa  96.7  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.149752  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0628  hypothetical protein  28.05 
 
 		 327 aa  95.9  8e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.939458  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2781  hypothetical protein  27.78 
 
 		 314 aa  95.5  9e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.664556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1089  putative transposase  28.16 
 
 		 337 aa  95.5  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.693638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2698  hypothetical protein  27.74 
 
 		 318 aa  93.2  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4924  hypothetical protein  38.93 
 
 		 170 aa  93.2  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.414279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2547  hypothetical protein  28.43 
 
 		 314 aa  92.8  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0376053  normal  0.0608447 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2623  hypothetical protein  27.71 
 
 		 322 aa  92.8  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0276584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2863  hypothetical protein  28.26 
 
 		 322 aa  92  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113899 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2960  putative transposase  28.21 
 
 		 329 aa  90.9  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.26307  normal  0.0520741 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0147  hypothetical protein  32.56 
 
 		 141 aa  90.1  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.320665  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0492  hypothetical protein  26.8 
 
 		 312 aa  89  9e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1059  putative transposase  28.21 
 
 		 329 aa  89  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0802  putative transposase  28.37 
 
 		 333 aa  87.4  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0990  putative transposase  34.97 
 
 		 321 aa  85.9  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.271034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0878  putative transposase  34.13 
 
 		 321 aa  85.5  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6237  putative transposase  26.58 
 
 		 345 aa  85.5  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.62735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2902  putative transposase  27.53 
 
 		 335 aa  84.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1722  hypothetical protein  24.91 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000483242  normal  0.789674 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1247  hypothetical protein  24.73 
 
 		 336 aa  81.6  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>