158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1250 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1250  hypothetical protein  100 
 
 
331 aa  668    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0628  hypothetical protein  88.22 
 
 
327 aa  564  1e-160  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.939458  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0643  hypothetical protein  95.38 
 
 
247 aa  434  1e-120  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.460705  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3166  putative transposase YhgA family protein  39.52 
 
 
317 aa  228  9e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1309  hypothetical protein  39.18 
 
 
328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2623  hypothetical protein  28.72 
 
 
322 aa  134  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0276584  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1247  hypothetical protein  31.87 
 
 
336 aa  134  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2698  hypothetical protein  28.42 
 
 
318 aa  133  3.9999999999999996e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0147  hypothetical protein  47.15 
 
 
141 aa  131  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.320665  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2781  hypothetical protein  28.87 
 
 
314 aa  130  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.664556  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2863  hypothetical protein  28.81 
 
 
322 aa  126  5e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.113899 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2547  hypothetical protein  29.55 
 
 
314 aa  125  7e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0376053  normal  0.0608447 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2785  hypothetical protein  30.03 
 
 
310 aa  124  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0045  hypothetical protein  30.5 
 
 
341 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.242935 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6237  putative transposase  26.84 
 
 
345 aa  117  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.62735  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4766  hypothetical protein  28.91 
 
 
334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0539  hypothetical protein  27.78 
 
 
311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2902  putative transposase  26.77 
 
 
335 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3878  hypothetical protein  26.37 
 
 
308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0599  putative transposase YhgA family protein  29.82 
 
 
318 aa  113  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2397  hypothetical protein  30.85 
 
 
319 aa  113  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0122  putative transposase  29.18 
 
 
313 aa  113  6e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  1.2156300000000001e-29 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0520  hypothetical protein  27.33 
 
 
307 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0523  hypothetical protein  27.45 
 
 
311 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0086  putative transposase  26.55 
 
 
319 aa  112  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.864811  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0084  hypothetical protein  26.55 
 
 
319 aa  112  9e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4129  putative transposase YhgA family protein  26.55 
 
 
319 aa  112  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.683023  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3382  hypothetical protein  30.42 
 
 
308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0529  hypothetical protein  27.45 
 
 
311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3726  putative transposase  27.8 
 
 
310 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4885  hypothetical protein  28.81 
 
 
318 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287711  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4566  hypothetical protein  30.04 
 
 
314 aa  110  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2880  hypothetical protein  26.01 
 
 
323 aa  109  7.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.149752  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1089  putative transposase  26.5 
 
 
337 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.693638  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3710  hypothetical protein  26.03 
 
 
304 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0039  transposase  26.88 
 
 
316 aa  108  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2289  hypothetical protein  30.9 
 
 
333 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0492229  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1034  hypothetical protein  31.21 
 
 
312 aa  107  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0492  hypothetical protein  31.85 
 
 
312 aa  107  4e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3782  hypothetical protein  25.68 
 
 
304 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3816  hypothetical protein  25.68 
 
 
304 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.792275 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3707  hypothetical protein  25.68 
 
 
304 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1121  hypothetical protein  30 
 
 
314 aa  104  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1406  hypothetical protein  28.87 
 
 
299 aa  103  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.286093  normal  0.84386 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3724  putative transposase YhgA family protein  29.76 
 
 
314 aa  103  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0911  putative transposase YhgA family protein  25.85 
 
 
298 aa  103  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1543  hypothetical protein  29.43 
 
 
323 aa  103  3e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2461  hypothetical protein  27.96 
 
 
300 aa  103  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.171355  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2386  hypothetical protein  28.87 
 
 
300 aa  103  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1415  putative transposase YhgA family protein  28.87 
 
 
299 aa  102  8e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.571537  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0068  putative transposase  27.47 
 
 
296 aa  102  8e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.565138  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2960  putative transposase  24.68 
 
 
329 aa  102  8e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.26307  normal  0.0520741 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1429  putative transposase YhgA family protein  27.04 
 
 
302 aa  102  9e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03263  predicted transposase  26.71 
 
 
292 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.100095  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04207  predicted transposase  28.52 
 
 
255 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03215  hypothetical protein  26.71 
 
 
292 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0821559  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3608  hypothetical protein  26.71 
 
 
292 aa  101  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2542  hypothetical protein  29.63 
 
 
300 aa  102  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0302  hypothetical protein  26.71 
 
 
292 aa  101  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.094929  normal  0.0909002 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3692  hypothetical protein  26.74 
 
 
292 aa  102  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2627  hypothetical protein  29.63 
 
 
300 aa  102  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4718  hypothetical protein  28.08 
 
 
292 aa  101  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3886  hypothetical protein  27.69 
 
 
292 aa  101  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1606  hypothetical protein  30.03 
 
 
307 aa  100  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0302  putative transposase YhgA family protein  26.37 
 
 
292 aa  100  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.78914  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0658  putative transposase  24.76 
 
 
332 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000193277 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4851  hypothetical protein  37.29 
 
 
321 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0802  putative transposase  30.86 
 
 
333 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3792  hypothetical protein  26.37 
 
 
292 aa  100  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1000  hypothetical protein  30.34 
 
 
307 aa  100  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1531  hypothetical protein  51.85 
 
 
167 aa  100  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02129  hypothetical protein  28.52 
 
 
282 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4874  hypothetical protein  37.29 
 
 
317 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.702519 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4776  hypothetical protein  37.29 
 
 
317 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02170  hypothetical protein  28.52 
 
 
300 aa  100  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0238  hypothetical protein  26.69 
 
 
344 aa  100  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.447255  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02230  hypothetical protein  28.17 
 
 
296 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.326611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2599  hypothetical protein  28.17 
 
 
296 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00513302  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02190  hypothetical protein  28.17 
 
 
296 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.428095  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0990  putative transposase  30.25 
 
 
321 aa  99.8  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.271034  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0409  hypothetical protein  26.14 
 
 
336 aa  99.4  8e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.650641  hitchhiker  0.00708611 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1351  putative transposase YhgA family protein  27.82 
 
 
296 aa  99  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0581087  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0740  hypothetical protein  25.25 
 
 
323 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.559811  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1347  putative transposase YhgA family protein  27.82 
 
 
296 aa  99  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0644465  normal  0.765955 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1547  putative transposase YhgA family protein  38.98 
 
 
288 aa  98.6  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.738107  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0878  putative transposase  30.86 
 
 
321 aa  98.6  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110546  normal 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0065  hypothetical protein  27.76 
 
 
313 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0980043  hitchhiker  0.0000000385113 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3445  hypothetical protein  27.82 
 
 
296 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.143681  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1722  hypothetical protein  27.71 
 
 
308 aa  97.4  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000483242  normal  0.789674 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2153  hypothetical protein  25.58 
 
 
332 aa  97.4  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.101261 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4072  putative transposase  23.99 
 
 
340 aa  97.4  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2727  putative transposase YhgA family protein  38.46 
 
 
310 aa  97.4  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0149  hypothetical protein  28.21 
 
 
298 aa  97.1  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00561727  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1059  putative transposase  29.63 
 
 
329 aa  97.1  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0029  transposase  25.25 
 
 
320 aa  96.7  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4059  putative transposase  23.83 
 
 
332 aa  96.7  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.860661 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4014  putative transposase  23.83 
 
 
332 aa  96.7  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.456112  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00131  predicted transposase  25.81 
 
 
300 aa  96.3  7e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3470  putative transposase YhgA family protein  25.81 
 
 
300 aa  96.3  7e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00130  hypothetical protein  25.81 
 
 
300 aa  96.3  7e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.969091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>