172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2785 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2785  hypothetical protein  100 
 
 
310 aa  635    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2781  hypothetical protein  80.25 
 
 
314 aa  525  1e-148  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.664556  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2623  hypothetical protein  77.95 
 
 
322 aa  521  1e-147  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0276584  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2698  hypothetical protein  78.93 
 
 
318 aa  523  1e-147  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2863  hypothetical protein  78.26 
 
 
322 aa  507  1e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.113899 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2547  hypothetical protein  79.94 
 
 
314 aa  506  9.999999999999999e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0376053  normal  0.0608447 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1089  putative transposase  30.36 
 
 
337 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.693638  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2880  hypothetical protein  31.71 
 
 
323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.149752  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1059  putative transposase  30.46 
 
 
329 aa  136  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0878  putative transposase  30.5 
 
 
321 aa  136  6.0000000000000005e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110546  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0990  putative transposase  29.56 
 
 
321 aa  134  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.271034  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2960  putative transposase  29.17 
 
 
329 aa  133  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.26307  normal  0.0520741 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0802  putative transposase  29.88 
 
 
333 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6237  putative transposase  29.03 
 
 
345 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.62735  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1150  putative transposase  29.69 
 
 
330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3166  putative transposase YhgA family protein  31.77 
 
 
317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2902  putative transposase  30.59 
 
 
335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1250  hypothetical protein  30.03 
 
 
331 aa  124  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0628  hypothetical protein  27.83 
 
 
327 aa  119  7.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.939458  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1994  putative transposase  29.54 
 
 
319 aa  115  8.999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.735151 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1543  hypothetical protein  28.71 
 
 
323 aa  114  3e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1606  hypothetical protein  29.29 
 
 
307 aa  109  6e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1963  putative transposase  28.82 
 
 
331 aa  108  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0706346  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1121  hypothetical protein  29.18 
 
 
314 aa  105  8e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0045  hypothetical protein  35.2 
 
 
341 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.242935 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1045  putative transposase  27.64 
 
 
343 aa  103  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0831423  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1108  putative transposase  28.95 
 
 
339 aa  103  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4885  hypothetical protein  29.43 
 
 
318 aa  101  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287711  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0492  hypothetical protein  26.98 
 
 
312 aa  102  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0147  hypothetical protein  45.6 
 
 
141 aa  101  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.320665  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2461  hypothetical protein  28.09 
 
 
300 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.171355  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04207  predicted transposase  35.8 
 
 
255 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4766  hypothetical protein  28.62 
 
 
334 aa  97.8  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3816  hypothetical protein  28.21 
 
 
304 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.792275 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3878  hypothetical protein  27.8 
 
 
308 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3782  hypothetical protein  28.21 
 
 
304 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3710  hypothetical protein  28.21 
 
 
304 aa  96.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4566  hypothetical protein  34.04 
 
 
314 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3707  hypothetical protein  27.84 
 
 
304 aa  95.9  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02230  hypothetical protein  27.37 
 
 
296 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.326611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2599  hypothetical protein  27.37 
 
 
296 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00513302  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02190  hypothetical protein  27.37 
 
 
296 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.428095  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0911  putative transposase YhgA family protein  32.04 
 
 
298 aa  94.7  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1351  putative transposase YhgA family protein  27.37 
 
 
296 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0581087  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1347  putative transposase YhgA family protein  27.37 
 
 
296 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0644465  normal  0.765955 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3724  putative transposase YhgA family protein  33.51 
 
 
314 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0302  putative transposase YhgA family protein  29.07 
 
 
292 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.78914  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3445  hypothetical protein  27.01 
 
 
296 aa  94  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.143681  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3792  hypothetical protein  29.07 
 
 
292 aa  94  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3886  hypothetical protein  28.46 
 
 
292 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03263  predicted transposase  28.68 
 
 
292 aa  92  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.100095  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3608  hypothetical protein  28.68 
 
 
292 aa  92  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0039  transposase  24.91 
 
 
316 aa  92  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03215  hypothetical protein  28.68 
 
 
292 aa  92  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0821559  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0302  hypothetical protein  28.68 
 
 
292 aa  92  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.094929  normal  0.0909002 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3692  hypothetical protein  28.68 
 
 
292 aa  92  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0068  putative transposase  25.56 
 
 
296 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.565138  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4718  hypothetical protein  28.68 
 
 
292 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0740  hypothetical protein  24.36 
 
 
323 aa  90.5  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.559811  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1000  hypothetical protein  26.18 
 
 
307 aa  90.5  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1034  hypothetical protein  25.24 
 
 
312 aa  90.5  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0122  putative transposase  26.69 
 
 
313 aa  90.1  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  1.2156300000000001e-29 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0029  transposase  36.07 
 
 
320 aa  89.4  8e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0065  hypothetical protein  25.43 
 
 
313 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0980043  hitchhiker  0.0000000385113 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1429  putative transposase YhgA family protein  30.51 
 
 
302 aa  87.4  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4874  hypothetical protein  28.15 
 
 
317 aa  85.9  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.702519 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2397  hypothetical protein  27.72 
 
 
319 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4776  hypothetical protein  28.15 
 
 
317 aa  85.9  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0409  hypothetical protein  28.65 
 
 
336 aa  85.5  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.650641  hitchhiker  0.00708611 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2153  hypothetical protein  28.65 
 
 
332 aa  85.5  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.101261 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0599  putative transposase YhgA family protein  31.2 
 
 
318 aa  85.1  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4851  hypothetical protein  28.15 
 
 
321 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0238  hypothetical protein  28.34 
 
 
344 aa  84.7  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.447255  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0539  hypothetical protein  25.38 
 
 
311 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4096  hypothetical protein  27.65 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4159  hypothetical protein  27.65 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.241117  normal  0.413105 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0086  putative transposase  33.87 
 
 
319 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.864811  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3991  hypothetical protein  27.65 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0520  hypothetical protein  25.38 
 
 
307 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0084  hypothetical protein  33.87 
 
 
319 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4129  putative transposase YhgA family protein  33.87 
 
 
319 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.683023  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3973  hypothetical protein  27.65 
 
 
309 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1722  hypothetical protein  26.37 
 
 
308 aa  84.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000483242  normal  0.789674 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0529  hypothetical protein  25.77 
 
 
311 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4045  hypothetical protein  27.65 
 
 
309 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.673826  normal  0.0374243 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4059  putative transposase  26.2 
 
 
332 aa  84  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.860661 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0523  hypothetical protein  25.38 
 
 
311 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0643  hypothetical protein  26.91 
 
 
247 aa  84  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.460705  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0149  hypothetical protein  24.76 
 
 
298 aa  84  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00561727  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3382  hypothetical protein  26.91 
 
 
308 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3726  putative transposase  25.27 
 
 
310 aa  83.2  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1406  hypothetical protein  26.43 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.286093  normal  0.84386 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4014  putative transposase  28.12 
 
 
332 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.456112  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2542  hypothetical protein  26.52 
 
 
300 aa  82.8  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2627  hypothetical protein  26.52 
 
 
300 aa  82.8  0.000000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4072  putative transposase  27.6 
 
 
340 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4028  putative transposase  27.6 
 
 
340 aa  82  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2386  hypothetical protein  26.43 
 
 
300 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1415  putative transposase YhgA family protein  26.52 
 
 
299 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.571537  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2307  hypothetical protein  27.66 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000450312  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>