153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1034 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1034  hypothetical protein  100 
 
 
312 aa  618  1e-176  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0492  hypothetical protein  51.28 
 
 
312 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1000  hypothetical protein  52.46 
 
 
307 aa  297  1e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1121  hypothetical protein  45.22 
 
 
314 aa  270  2e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1543  hypothetical protein  42.24 
 
 
323 aa  266  2.9999999999999995e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1606  hypothetical protein  44.44 
 
 
307 aa  266  2.9999999999999995e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0149  hypothetical protein  44.15 
 
 
298 aa  246  3e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00561727  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1572  hypothetical protein  43.23 
 
 
311 aa  236  3e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6237  putative transposase  25.87 
 
 
345 aa  115  6.9999999999999995e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.62735  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0878  putative transposase  25.55 
 
 
321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110546  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2902  putative transposase  25.41 
 
 
335 aa  113  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2960  putative transposase  25.08 
 
 
329 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.26307  normal  0.0520741 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1150  putative transposase  25.16 
 
 
330 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1059  putative transposase  24 
 
 
329 aa  110  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0990  putative transposase  25.24 
 
 
321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.271034  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0628  hypothetical protein  31.82 
 
 
327 aa  108  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.939458  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1250  hypothetical protein  31.21 
 
 
331 aa  107  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0802  putative transposase  22.94 
 
 
333 aa  103  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1089  putative transposase  23.81 
 
 
337 aa  103  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.693638  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3166  putative transposase YhgA family protein  31.46 
 
 
317 aa  102  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1247  hypothetical protein  30.82 
 
 
336 aa  101  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4045  hypothetical protein  24.36 
 
 
309 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.673826  normal  0.0374243 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3973  hypothetical protein  24.36 
 
 
309 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2880  hypothetical protein  23.73 
 
 
323 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.149752  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4159  hypothetical protein  24.54 
 
 
313 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.241117  normal  0.413105 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4096  hypothetical protein  24.54 
 
 
313 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3991  hypothetical protein  24.54 
 
 
313 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3382  hypothetical protein  25.81 
 
 
308 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3726  putative transposase  26.56 
 
 
310 aa  93.6  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02170  hypothetical protein  25.36 
 
 
300 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02129  hypothetical protein  25.36 
 
 
282 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4851  hypothetical protein  22.47 
 
 
321 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2386  hypothetical protein  25.36 
 
 
300 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4776  hypothetical protein  22.47 
 
 
317 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1415  putative transposase YhgA family protein  25.36 
 
 
299 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.571537  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2542  hypothetical protein  25.36 
 
 
300 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1406  hypothetical protein  25.36 
 
 
299 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.286093  normal  0.84386 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2627  hypothetical protein  25.36 
 
 
300 aa  90.5  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4874  hypothetical protein  22.47 
 
 
317 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.702519 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2785  hypothetical protein  25.24 
 
 
310 aa  90.5  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2863  hypothetical protein  26.14 
 
 
322 aa  89.4  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.113899 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1364  hypothetical protein  65.08 
 
 
63 aa  88.6  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2397  hypothetical protein  25.18 
 
 
319 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2698  hypothetical protein  26.32 
 
 
318 aa  87.4  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0045  hypothetical protein  28.08 
 
 
341 aa  87  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.242935 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2547  hypothetical protein  26.67 
 
 
314 aa  87  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0376053  normal  0.0608447 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2623  hypothetical protein  26.3 
 
 
322 aa  87  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0276584  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2781  hypothetical protein  26.33 
 
 
314 aa  87  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.664556  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3782  hypothetical protein  24.62 
 
 
304 aa  86.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3816  hypothetical protein  24.33 
 
 
304 aa  86.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.792275 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2289  hypothetical protein  34.55 
 
 
333 aa  85.1  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0492229  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0142  ISNCY family transposase  25.45 
 
 
306 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00131  predicted transposase  24.26 
 
 
300 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3470  putative transposase YhgA family protein  24.26 
 
 
300 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00130  hypothetical protein  24.26 
 
 
300 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.969091  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0135  hypothetical protein  24.92 
 
 
300 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3527  putative transposase YhgA family protein  24.26 
 
 
300 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.653665  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3707  hypothetical protein  23.95 
 
 
304 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3710  hypothetical protein  24.24 
 
 
304 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0086  putative transposase  24.52 
 
 
319 aa  84  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.864811  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0084  hypothetical protein  24.52 
 
 
319 aa  84  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4129  putative transposase YhgA family protein  24.52 
 
 
319 aa  84  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.683023  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0068  putative transposase  23.28 
 
 
296 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.565138  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2307  hypothetical protein  32.16 
 
 
321 aa  83.6  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000450312  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3878  hypothetical protein  23.57 
 
 
308 aa  83.2  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0125  hypothetical protein  24.59 
 
 
298 aa  83.6  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0141  hypothetical protein  24.76 
 
 
298 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0122  putative transposase  24.09 
 
 
313 aa  83.2  0.000000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  1.2156300000000001e-29 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02230  hypothetical protein  24.81 
 
 
296 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.326611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2599  hypothetical protein  24.81 
 
 
296 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00513302  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1309  hypothetical protein  33.14 
 
 
328 aa  81.3  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02190  hypothetical protein  24.81 
 
 
296 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.428095  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1351  putative transposase YhgA family protein  24.44 
 
 
296 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0581087  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0643  hypothetical protein  32.63 
 
 
247 aa  80.9  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.460705  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1347  putative transposase YhgA family protein  24.44 
 
 
296 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0644465  normal  0.765955 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3445  hypothetical protein  24.44 
 
 
296 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.143681  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04207  predicted transposase  23.46 
 
 
255 aa  79.3  0.00000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2461  hypothetical protein  24.19 
 
 
300 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.171355  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4766  hypothetical protein  23.4 
 
 
334 aa  79  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0523  hypothetical protein  23.83 
 
 
311 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4566  hypothetical protein  23.48 
 
 
314 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2285  hypothetical protein  29.69 
 
 
288 aa  78.2  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1722  hypothetical protein  30.73 
 
 
308 aa  77.4  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000483242  normal  0.789674 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0911  putative transposase YhgA family protein  28.65 
 
 
298 aa  77.4  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0529  hypothetical protein  23.83 
 
 
311 aa  77.4  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3724  putative transposase YhgA family protein  23.48 
 
 
314 aa  76.6  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0539  hypothetical protein  23.83 
 
 
311 aa  76.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0147  hypothetical protein  37.5 
 
 
141 aa  75.9  0.0000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.320665  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0065  hypothetical protein  23.05 
 
 
313 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0980043  hitchhiker  0.0000000385113 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4885  hypothetical protein  22.64 
 
 
318 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287711  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0520  hypothetical protein  23.05 
 
 
307 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1702  hypothetical protein  21.47 
 
 
326 aa  73.2  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.412934  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2630  hypothetical protein  26.43 
 
 
317 aa  71.2  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04729  hypothetical protein  23.77 
 
 
309 aa  69.7  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0894  hypothetical protein  24.71 
 
 
308 aa  69.7  0.00000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.284853 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1504  putative transposase  24.39 
 
 
350 aa  69.7  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1963  putative transposase  21.14 
 
 
331 aa  68.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0706346  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1429  putative transposase YhgA family protein  26.92 
 
 
302 aa  68.9  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0599  putative transposase YhgA family protein  23.1 
 
 
318 aa  67.8  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2727  putative transposase YhgA family protein  22.53 
 
 
310 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>