154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1572 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1572  hypothetical protein  100 
 
 
311 aa  624  1e-178  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0149  hypothetical protein  86.77 
 
 
298 aa  536  1e-151  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00561727  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0492  hypothetical protein  55.16 
 
 
312 aa  348  9e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1121  hypothetical protein  50.78 
 
 
314 aa  321  9.999999999999999e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1000  hypothetical protein  52.26 
 
 
307 aa  318  7e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1606  hypothetical protein  49.05 
 
 
307 aa  309  4e-83  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1543  hypothetical protein  47.84 
 
 
323 aa  307  2.0000000000000002e-82  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1034  hypothetical protein  43.23 
 
 
312 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1422  hypothetical protein  42.86 
 
 
161 aa  122  7e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1250  hypothetical protein  30.17 
 
 
331 aa  110  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3166  putative transposase YhgA family protein  31.99 
 
 
317 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0628  hypothetical protein  29.9 
 
 
327 aa  98.2  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.939458  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2623  hypothetical protein  25.25 
 
 
322 aa  98.2  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0276584  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2698  hypothetical protein  24.92 
 
 
318 aa  95.5  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2863  hypothetical protein  24.31 
 
 
322 aa  93.6  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.113899 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2960  putative transposase  24.6 
 
 
329 aa  89.7  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.26307  normal  0.0520741 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2547  hypothetical protein  24.58 
 
 
314 aa  89.4  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0376053  normal  0.0608447 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2902  putative transposase  25 
 
 
335 aa  89  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2781  hypothetical protein  26.26 
 
 
314 aa  88.2  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.664556  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1089  putative transposase  23.95 
 
 
337 aa  87.8  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.693638  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1059  putative transposase  23.01 
 
 
329 aa  86.3  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1963  putative transposase  22.9 
 
 
331 aa  84.3  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0706346  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0802  putative transposase  23.33 
 
 
333 aa  81.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2785  hypothetical protein  23.9 
 
 
310 aa  80.5  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2289  hypothetical protein  29.36 
 
 
333 aa  80.1  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0492229  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1150  putative transposase  22.7 
 
 
330 aa  79  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6237  putative transposase  23.03 
 
 
345 aa  77.8  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.62735  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1045  putative transposase  22.94 
 
 
343 aa  77.4  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0831423  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0911  putative transposase YhgA family protein  25.28 
 
 
298 aa  77.4  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0643  hypothetical protein  28.99 
 
 
247 aa  75.9  0.0000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.460705  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0990  putative transposase  26.95 
 
 
321 aa  75.5  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.271034  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0523  hypothetical protein  24.52 
 
 
311 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0529  hypothetical protein  24.04 
 
 
311 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0045  hypothetical protein  29.31 
 
 
341 aa  75.1  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.242935 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0878  putative transposase  27.65 
 
 
321 aa  74.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110546  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2727  putative transposase YhgA family protein  24.43 
 
 
310 aa  74.3  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1429  putative transposase YhgA family protein  26.23 
 
 
302 aa  73.2  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0539  hypothetical protein  24.52 
 
 
311 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2880  hypothetical protein  21.28 
 
 
323 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.149752  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1722  hypothetical protein  28.63 
 
 
308 aa  70.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000483242  normal  0.789674 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2673  hypothetical protein  27.8 
 
 
320 aa  70.9  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000356994  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0599  putative transposase YhgA family protein  22.26 
 
 
318 aa  70.9  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2307  hypothetical protein  29.76 
 
 
321 aa  70.1  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000450312  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1108  putative transposase  22.32 
 
 
339 aa  69.7  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0174  hypothetical protein  24.61 
 
 
317 aa  69.7  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.384261  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0181  hypothetical protein  25.23 
 
 
325 aa  68.6  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000266297  normal  0.396651 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0954  hypothetical protein  46.48 
 
 
150 aa  67.8  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372234  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0520  hypothetical protein  24.63 
 
 
307 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0039  transposase  22.95 
 
 
316 aa  66.6  0.0000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2153  hypothetical protein  24.4 
 
 
332 aa  65.9  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.101261 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0409  hypothetical protein  25.09 
 
 
336 aa  65.1  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.650641  hitchhiker  0.00708611 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1399  putative transposase  25.29 
 
 
293 aa  64.3  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.213871 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0238  hypothetical protein  24.62 
 
 
344 aa  63.9  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.447255  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1702  hypothetical protein  20.5 
 
 
326 aa  63.9  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.412934  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3878  hypothetical protein  23.05 
 
 
308 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1398  putative transposase  27.63 
 
 
289 aa  63.9  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1400  putative transposase  27.63 
 
 
301 aa  63.9  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0429556  normal  0.22922 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1247  hypothetical protein  27 
 
 
336 aa  63.5  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4766  hypothetical protein  21.81 
 
 
334 aa  63.2  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0135  hypothetical protein  21.52 
 
 
300 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3707  hypothetical protein  23.05 
 
 
304 aa  63.2  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0086  putative transposase  22.71 
 
 
319 aa  62.4  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.864811  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4566  hypothetical protein  21.97 
 
 
314 aa  62.4  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0084  hypothetical protein  22.71 
 
 
319 aa  62.4  0.000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4129  putative transposase YhgA family protein  22.71 
 
 
319 aa  62.4  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.683023  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2630  hypothetical protein  24.06 
 
 
317 aa  62.4  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00131  predicted transposase  21.84 
 
 
300 aa  62  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2474  hypothetical protein  31.01 
 
 
309 aa  61.6  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000139417  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3470  putative transposase YhgA family protein  21.84 
 
 
300 aa  62  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00130  hypothetical protein  21.84 
 
 
300 aa  62  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.969091  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0147  hypothetical protein  31.93 
 
 
141 aa  62  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.320665  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3527  putative transposase YhgA family protein  21.84 
 
 
300 aa  62  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.653665  normal 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0068  putative transposase  22.95 
 
 
296 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.565138  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0122  putative transposase  21.95 
 
 
313 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  1.2156300000000001e-29 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0142  ISNCY family transposase  22.15 
 
 
306 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0125  hypothetical protein  21.07 
 
 
298 aa  61.6  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3782  hypothetical protein  22.68 
 
 
304 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3816  hypothetical protein  22.68 
 
 
304 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.792275 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3710  hypothetical protein  22.68 
 
 
304 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1994  putative transposase  21.01 
 
 
319 aa  60.5  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.735151 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1547  putative transposase YhgA family protein  20.74 
 
 
288 aa  59.7  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.738107  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3724  putative transposase YhgA family protein  21.59 
 
 
314 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3726  putative transposase  23.02 
 
 
310 aa  59.7  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0141  hypothetical protein  21.07 
 
 
298 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4059  putative transposase  22.73 
 
 
332 aa  59.3  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.860661 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4072  putative transposase  22.54 
 
 
340 aa  59.3  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4014  putative transposase  22.73 
 
 
332 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.456112  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4028  putative transposase  22.54 
 
 
340 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4045  hypothetical protein  20.65 
 
 
309 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.673826  normal  0.0374243 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3973  hypothetical protein  20.65 
 
 
309 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1309  hypothetical protein  28.14 
 
 
328 aa  57.4  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0029  transposase  22.11 
 
 
320 aa  57.8  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04207  predicted transposase  22.84 
 
 
255 aa  57  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4776  hypothetical protein  18.09 
 
 
317 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4874  hypothetical protein  18.09 
 
 
317 aa  56.6  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.702519 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0658  putative transposase  22.74 
 
 
332 aa  56.6  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000193277 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3382  hypothetical protein  21.94 
 
 
308 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4851  hypothetical protein  17.85 
 
 
321 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4885  hypothetical protein  19.55 
 
 
318 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287711  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1411  hypothetical protein  25.32 
 
 
312 aa  55.8  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.27197 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>