148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3470 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00131  predicted transposase  100 
 
 
300 aa  621  1e-177  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3470  putative transposase YhgA family protein  100 
 
 
300 aa  621  1e-177  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3527  putative transposase YhgA family protein  100 
 
 
300 aa  621  1e-177  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.653665  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00130  hypothetical protein  100 
 
 
300 aa  621  1e-177  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.969091  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0135  hypothetical protein  98 
 
 
300 aa  608  1e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0125  hypothetical protein  97.32 
 
 
298 aa  604  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0141  hypothetical protein  96.98 
 
 
298 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0142  ISNCY family transposase  92.16 
 
 
306 aa  580  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0136  hypothetical protein  97.9 
 
 
238 aa  483  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3782  hypothetical protein  53.04 
 
 
304 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3816  hypothetical protein  53.04 
 
 
304 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.792275 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3707  hypothetical protein  52.7 
 
 
304 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3710  hypothetical protein  53.04 
 
 
304 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3878  hypothetical protein  52.67 
 
 
308 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2461  hypothetical protein  53.33 
 
 
300 aa  318  5e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.171355  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3726  putative transposase  52.86 
 
 
310 aa  316  3e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02230  hypothetical protein  53.33 
 
 
296 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.326611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2599  hypothetical protein  53.33 
 
 
296 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00513302  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02190  hypothetical protein  53.33 
 
 
296 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.428095  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0086  putative transposase  53.16 
 
 
319 aa  313  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.864811  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0084  hypothetical protein  53.16 
 
 
319 aa  313  2.9999999999999996e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4129  putative transposase YhgA family protein  53.16 
 
 
319 aa  313  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.683023  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1351  putative transposase YhgA family protein  53.33 
 
 
296 aa  312  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0581087  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1347  putative transposase YhgA family protein  53.33 
 
 
296 aa  312  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0644465  normal  0.765955 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4776  hypothetical protein  50 
 
 
317 aa  312  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4874  hypothetical protein  50 
 
 
317 aa  311  6.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.702519 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3445  hypothetical protein  52.61 
 
 
296 aa  311  1e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.143681  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0122  putative transposase  52.19 
 
 
313 aa  308  6.999999999999999e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  1.2156300000000001e-29 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4851  hypothetical protein  49.68 
 
 
321 aa  308  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2542  hypothetical protein  50.67 
 
 
300 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2627  hypothetical protein  50.67 
 
 
300 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02170  hypothetical protein  50.67 
 
 
300 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1406  hypothetical protein  51.19 
 
 
299 aa  305  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.286093  normal  0.84386 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0599  putative transposase YhgA family protein  50 
 
 
318 aa  303  2.0000000000000002e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4045  hypothetical protein  51.83 
 
 
309 aa  302  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.673826  normal  0.0374243 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2386  hypothetical protein  50.34 
 
 
300 aa  302  6.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3973  hypothetical protein  51.83 
 
 
309 aa  301  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0539  hypothetical protein  47.25 
 
 
311 aa  301  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3382  hypothetical protein  50 
 
 
308 aa  301  9e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02129  hypothetical protein  51.79 
 
 
282 aa  301  1e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0520  hypothetical protein  47.21 
 
 
307 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1415  putative transposase YhgA family protein  50.51 
 
 
299 aa  299  3e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.571537  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0523  hypothetical protein  46.93 
 
 
311 aa  298  7e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0529  hypothetical protein  46.93 
 
 
311 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2397  hypothetical protein  48.56 
 
 
319 aa  296  3e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4096  hypothetical protein  50.82 
 
 
313 aa  295  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3991  hypothetical protein  50.82 
 
 
313 aa  295  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4159  hypothetical protein  50.82 
 
 
313 aa  295  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.241117  normal  0.413105 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03263  predicted transposase  50.18 
 
 
292 aa  287  1e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.100095  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0302  putative transposase YhgA family protein  48.62 
 
 
292 aa  287  1e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.78914  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3608  hypothetical protein  50.18 
 
 
292 aa  287  1e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0302  hypothetical protein  50.18 
 
 
292 aa  287  1e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.094929  normal  0.0909002 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3692  hypothetical protein  50.18 
 
 
292 aa  287  1e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03215  hypothetical protein  50.18 
 
 
292 aa  287  1e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0821559  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3792  hypothetical protein  49.82 
 
 
292 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4718  hypothetical protein  48.97 
 
 
292 aa  286  4e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4885  hypothetical protein  50.55 
 
 
318 aa  285  8e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287711  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4566  hypothetical protein  49.65 
 
 
314 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4766  hypothetical protein  51.29 
 
 
334 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3886  hypothetical protein  49.46 
 
 
292 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3724  putative transposase YhgA family protein  49.65 
 
 
314 aa  281  8.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04207  predicted transposase  53.97 
 
 
255 aa  281  1e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0029  transposase  43.77 
 
 
320 aa  277  2e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04729  hypothetical protein  45.36 
 
 
309 aa  273  3e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2727  putative transposase YhgA family protein  47.39 
 
 
310 aa  271  7e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0039  transposase  42.35 
 
 
316 aa  269  4e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1429  putative transposase YhgA family protein  43.73 
 
 
302 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1547  putative transposase YhgA family protein  45.21 
 
 
288 aa  261  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.738107  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0911  putative transposase YhgA family protein  43.15 
 
 
298 aa  252  6e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3046  transposase  44.44 
 
 
282 aa  251  9.000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131132  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0068  putative transposase  43.62 
 
 
296 aa  251  9.000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.565138  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0065  hypothetical protein  40.58 
 
 
313 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0980043  hitchhiker  0.0000000385113 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3432  putative transposase YhgA family protein  48.56 
 
 
218 aa  206  5e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04171  hypothetical protein  48.89 
 
 
135 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0894  hypothetical protein  30.13 
 
 
308 aa  135  8e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.284853 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04170  hypothetical protein  60.2 
 
 
103 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.858892  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3166  putative transposase YhgA family protein  27.56 
 
 
317 aa  106  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2902  putative transposase  28.12 
 
 
335 aa  96.7  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1250  hypothetical protein  25.81 
 
 
331 aa  96.3  6e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2960  putative transposase  27.68 
 
 
329 aa  94.4  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.26307  normal  0.0520741 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1306  hypothetical protein  30.3 
 
 
275 aa  92.8  7e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1059  putative transposase  28.52 
 
 
329 aa  90.9  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2880  hypothetical protein  27.14 
 
 
323 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.149752  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1089  putative transposase  27.15 
 
 
337 aa  90.5  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.693638  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0878  putative transposase  28.62 
 
 
321 aa  90.1  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110546  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0628  hypothetical protein  32.26 
 
 
327 aa  89.4  7e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.939458  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6237  putative transposase  28 
 
 
345 aa  88.2  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.62735  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0802  putative transposase  28.57 
 
 
333 aa  87  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2698  hypothetical protein  28.33 
 
 
318 aa  86.7  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2781  hypothetical protein  28.14 
 
 
314 aa  86.3  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.664556  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0990  putative transposase  28.27 
 
 
321 aa  85.5  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.271034  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0045  hypothetical protein  25.75 
 
 
341 aa  85.1  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.242935 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2547  hypothetical protein  28.78 
 
 
314 aa  84.3  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0376053  normal  0.0608447 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2623  hypothetical protein  28.36 
 
 
322 aa  84.7  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0276584  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1034  hypothetical protein  24.26 
 
 
312 aa  84.7  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0147  hypothetical protein  31.15 
 
 
141 aa  82.8  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.320665  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2863  hypothetical protein  27.96 
 
 
322 aa  82.8  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.113899 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0143  hypothetical protein  65.15 
 
 
71 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2785  hypothetical protein  27.48 
 
 
310 aa  79  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1150  putative transposase  27.46 
 
 
330 aa  77.4  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>