84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0954 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0954  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  272  1.0000000000000001e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372234  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1543  hypothetical protein  43.75 
 
 
323 aa  61.6  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1128  hypothetical protein  33.1 
 
 
328 aa  58.9  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1422  hypothetical protein  39.56 
 
 
161 aa  57  0.00000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4928  hypothetical protein  29.79 
 
 
315 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.443955 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1108  putative transposase  33.64 
 
 
339 aa  56.2  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1611  hypothetical protein  35.48 
 
 
318 aa  53.9  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.5466e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1045  putative transposase  33.72 
 
 
343 aa  52.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0831423  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0155  hypothetical protein  34.75 
 
 
300 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1178  hypothetical protein  32.56 
 
 
314 aa  50.8  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1567a  hypothetical cytosolic protein  33.85 
 
 
335 aa  50.1  0.000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.203402  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0397  hypothetical protein  38.33 
 
 
317 aa  49.7  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1184  flagellar assembly protein H  43.14 
 
 
403 aa  48.9  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4715  hypothetical protein  35.85 
 
 
331 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5077  hypothetical protein  35.85 
 
 
325 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0517  conserved hypothetical cytosolic protein  33.33 
 
 
339 aa  48.9  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4940  hypothetical protein  37.5 
 
 
327 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0149  hypothetical protein  37.68 
 
 
298 aa  47.4  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00561727  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0597  hypothetical protein  36.07 
 
 
330 aa  47  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.946017  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2934  flagellar assembly protein H  38.6 
 
 
338 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1368  flagellar assembly protein FliH  37.68 
 
 
339 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2924  flagellar assembly protein H  38.6 
 
 
338 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2227  hypothetical protein  38.18 
 
 
92 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.32475  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15060  predicted protein  41.18 
 
 
191 aa  46.6  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1963  putative transposase  33.78 
 
 
331 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0706346  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3066  flagellar assembly protein H  38.6 
 
 
338 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.934094 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1439  flagellar assembly protein H  38.6 
 
 
338 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1572  hypothetical protein  45.1 
 
 
311 aa  45.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1121  hypothetical protein  38.03 
 
 
314 aa  46.2  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2574  flagellar assembly protein H  38.71 
 
 
318 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.412103  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4555  hypothetical protein  40.91 
 
 
234 aa  45.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.166025  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0181  hypothetical protein  35.53 
 
 
325 aa  46.2  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000266297  normal  0.396651 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0252  flagellar assembly protein H  31.88 
 
 
236 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1620  flagellar assembly protein FliH  37.5 
 
 
324 aa  45.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4944  hypothetical protein  45 
 
 
319 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0174  hypothetical protein  35.71 
 
 
317 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.384261  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1363  flagellar assembly protein FliH  39.66 
 
 
316 aa  44.3  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2414  hypothetical protein  39.29 
 
 
307 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2040  flagellar assembly protein H  25.35 
 
 
228 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2173  flagellar assembly protein H  25.35 
 
 
228 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.125202  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3289  hypothetical protein  34.48 
 
 
324 aa  44.3  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00577897 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1715  flagellar assembly protein H  31.17 
 
 
270 aa  44.3  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2786  hypothetical protein  35.38 
 
 
340 aa  43.9  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1351  flagellar assembly protein H  36.84 
 
 
316 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.143361  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1344  flagellar assembly protein H  36.84 
 
 
320 aa  43.5  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.388859 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001188  flagellar assembly protein FliH  34.69 
 
 
251 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3045  flagellar assembly protein H  40 
 
 
266 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1091  hypothetical protein  35.62 
 
 
322 aa  43.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0528026  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1708  flagellar assembly protein FliH  25.35 
 
 
228 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.246476  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3380  flagellar assembly protein H  30.43 
 
 
236 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.972464  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2716  flagellar assembly protein H  25.35 
 
 
228 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.353539 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04975  flagellar assembly protein H  34.69 
 
 
224 aa  42.7  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4593  hypothetical protein  44.07 
 
 
311 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00114736  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2531  flagellar assembly protein H  24.39 
 
 
236 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4962  hypothetical protein  42.5 
 
 
192 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1236  hypothetical protein  29.49 
 
 
311 aa  42.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00145215  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4981  hypothetical protein  46.81 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1244  flagellar assembly protein H  23.94 
 
 
228 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1702  flagellar assembly protein H  23.94 
 
 
228 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0145817 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4573  hypothetical protein  45.45 
 
 
230 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1284  flagellar assembly protein H  36.84 
 
 
316 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3226  flagellar assembly protein H  36.84 
 
 
316 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0038  hypothetical protein  47.73 
 
 
324 aa  42  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2448  hypothetical protein  38.24 
 
 
142 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0764645  unclonable  0.000000000290629 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1193  hypothetical protein  26.83 
 
 
317 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2295  flagellar assembly protein H  38 
 
 
300 aa  42  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02887  flagellar assembly protein H  33.87 
 
 
260 aa  41.6  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1182  hypothetical protein  39.62 
 
 
304 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1542  flagellar assembly protein FliH  31.71 
 
 
231 aa  41.2  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2950  hypothetical protein  36.84 
 
 
334 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0249458  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3064  flagellar assembly protein FliH  29.82 
 
 
334 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2274  hypothetical protein  25.41 
 
 
315 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2152  hypothetical cytosolic protein  40.35 
 
 
325 aa  41.2  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3657  flagellar assembly protein H  37.5 
 
 
235 aa  41.2  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0026  hypothetical protein  40.35 
 
 
325 aa  41.2  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1509  hypothetical protein  45 
 
 
320 aa  40.8  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.055753  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4509  hypothetical protein  35.29 
 
 
303 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3446  flagellar assembly protein FliH  35.71 
 
 
268 aa  40.4  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1326  flagellar assembly protein H  34.69 
 
 
375 aa  40.4  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0232  flagellar assembly protein H  27.63 
 
 
238 aa  40.4  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.310336 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0713  flagellar assembly protein H  27.63 
 
 
238 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0633  flagellar assembly protein H  27.63 
 
 
238 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0684  hypothetical protein  43.75 
 
 
303 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.92177 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1248  hypothetical protein  27.13 
 
 
330 aa  40  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.442555 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>