96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0038 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0038  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  663    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0762  hypothetical protein  76.31 
 
 
317 aa  483  1e-135  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00138696  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1034  hypothetical protein  70.46 
 
 
321 aa  473  1e-132  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.121952  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1509  hypothetical protein  68.83 
 
 
320 aa  457  9.999999999999999e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.055753  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0686  hypothetical protein  72.22 
 
 
312 aa  458  9.999999999999999e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000261491  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0991  hypothetical protein  69 
 
 
324 aa  460  9.999999999999999e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000745042  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1558  hypothetical protein  66.05 
 
 
316 aa  442  1e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1015  hypothetical protein  64.2 
 
 
324 aa  431  1e-120  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1336  hypothetical protein  64.67 
 
 
316 aa  418  1e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1243  hypothetical protein  65.12 
 
 
310 aa  410  1e-113  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000429592  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1916  hypothetical protein  67.07 
 
 
252 aa  348  1e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1248  hypothetical protein  51.57 
 
 
336 aa  315  5e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2183  hypothetical protein  52.77 
 
 
320 aa  305  9.000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1257  hypothetical protein  49.31 
 
 
324 aa  298  1e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0517  conserved hypothetical cytosolic protein  47.62 
 
 
339 aa  294  1e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2379  hypothetical protein  50.92 
 
 
320 aa  294  1e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4593  hypothetical protein  42.04 
 
 
311 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00114736  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0198  hypothetical protein  42.64 
 
 
313 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.202809  hitchhiker  0.00402229 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2950  hypothetical protein  38.61 
 
 
334 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0249458  normal 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4493  hypothetical protein  42.19 
 
 
319 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4532  hypothetical protein  42.19 
 
 
319 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3938  hypothetical protein  38.51 
 
 
311 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2414  hypothetical protein  41.15 
 
 
307 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1962  hypothetical protein  40.74 
 
 
327 aa  209  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1061  hypothetical protein  41.48 
 
 
311 aa  207  1e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000000000109934  normal  0.0587349 
 
 
 
NC_011884  Cyan7425_5125  hypothetical protein  36.89 
 
 
310 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1567a  hypothetical cytosolic protein  37.54 
 
 
335 aa  202  6e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.203402  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2152  hypothetical cytosolic protein  35.95 
 
 
325 aa  194  2e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0026  hypothetical protein  35.62 
 
 
325 aa  189  4e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1739  hypothetical cytosolic protein  38.55 
 
 
312 aa  188  1e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1410  hypothetical protein  44.66 
 
 
235 aa  186  6e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0619  hypothetical protein  34.68 
 
 
341 aa  180  2.9999999999999997e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1399  hypothetical protein  51.37 
 
 
211 aa  159  8e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0266105  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2345  hypothetical protein  41.53 
 
 
206 aa  145  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.387086  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2348  hypothetical protein  45.03 
 
 
201 aa  140  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4692  hypothetical protein  35.21 
 
 
293 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.824863  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3970  hypothetical protein  29.51 
 
 
317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.257716  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0181  hypothetical protein  30 
 
 
325 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000266297  normal  0.396651 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2786  hypothetical protein  30.06 
 
 
340 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0655  hypothetical protein  30.57 
 
 
300 aa  96.3  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1182  hypothetical protein  29.94 
 
 
304 aa  96.3  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0681  hypothetical protein  29.6 
 
 
304 aa  95.5  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000573749  unclonable  0.0000000126403 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0174  hypothetical protein  28.76 
 
 
317 aa  95.5  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.384261  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2274  hypothetical protein  28.83 
 
 
315 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1193  hypothetical protein  30.68 
 
 
317 aa  92.4  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1222  hypothetical protein  30.34 
 
 
313 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1248  hypothetical protein  27.48 
 
 
330 aa  90.1  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.442555 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1221  hypothetical protein  28.98 
 
 
292 aa  88.6  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3368  hypothetical protein  27.42 
 
 
297 aa  86.7  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2793  hypothetical protein  29.03 
 
 
301 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1913  hypothetical protein  58.75 
 
 
79 aa  80.1  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2187  hypothetical protein  30.42 
 
 
290 aa  79  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1348  hypothetical protein  25.87 
 
 
318 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0527396  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1091  hypothetical protein  42.28 
 
 
322 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0528026  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0564  hypothetical protein  31.19 
 
 
302 aa  77  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1306  hypothetical protein  27.65 
 
 
283 aa  77  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1240  hypothetical protein  51.28 
 
 
334 aa  76.3  0.0000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3206  hypothetical protein  29.46 
 
 
284 aa  75.5  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.488157  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0597  hypothetical protein  50 
 
 
330 aa  72.4  0.000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.946017  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1707  hypothetical protein  27.51 
 
 
280 aa  70.5  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.420351  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1534  hypothetical protein  81.4 
 
 
233 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0748  hypothetical protein  31.97 
 
 
134 aa  62.8  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000803284  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0820  hypothetical protein  44.78 
 
 
334 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3426  hypothetical protein  26.88 
 
 
311 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2444  hypothetical protein  49.12 
 
 
299 aa  55.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.445451  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2384  hypothetical protein  25 
 
 
314 aa  53.1  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000288219  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1178  hypothetical protein  40 
 
 
314 aa  52.8  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0354  hypothetical protein  26.03 
 
 
294 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0361  hypothetical protein  26.03 
 
 
294 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.926631  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2294  hypothetical protein  57.14 
 
 
276 aa  50.4  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1236  hypothetical protein  38.57 
 
 
311 aa  50.1  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00145215  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1611  hypothetical protein  36.49 
 
 
318 aa  49.3  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.5466e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0599  putative transposase YhgA family protein  35 
 
 
318 aa  47.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1045  putative transposase  30.69 
 
 
343 aa  48.1  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0831423  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4715  hypothetical protein  43.33 
 
 
331 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4555  hypothetical protein  33.73 
 
 
234 aa  47  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.166025  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5077  hypothetical protein  43.33 
 
 
325 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4962  hypothetical protein  46.43 
 
 
192 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2384  hypothetical protein  41.43 
 
 
325 aa  46.2  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000252943  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0598  hypothetical protein  28.57 
 
 
296 aa  46.2  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4940  hypothetical protein  31.33 
 
 
327 aa  45.8  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4573  hypothetical protein  42.86 
 
 
230 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0464  hypothetical protein  26.56 
 
 
278 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.188518 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0451  hypothetical protein  26.56 
 
 
278 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3726  putative transposase  36.67 
 
 
310 aa  44.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1363  flagellar assembly protein FliH  50 
 
 
316 aa  44.3  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1439  flagellar assembly protein H  43.14 
 
 
338 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02887  flagellar assembly protein H  40.68 
 
 
260 aa  43.5  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2924  flagellar assembly protein H  43.14 
 
 
338 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2934  flagellar assembly protein H  43.14 
 
 
338 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4928  hypothetical protein  23.98 
 
 
315 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.443955 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3066  flagellar assembly protein H  43.14 
 
 
338 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.934094 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4944  hypothetical protein  36.96 
 
 
319 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1608  hypothetical protein  36.21 
 
 
306 aa  42.7  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0539  hypothetical protein  35.82 
 
 
277 aa  42.7  0.008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1487  hypothetical protein  22.71 
 
 
302 aa  42.7  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>