79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2294 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2294  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  559  1e-158  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2444  hypothetical protein  85.61 
 
 
299 aa  486  1e-136  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.445451  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0597  hypothetical protein  73.94 
 
 
330 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.946017  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0596  hypothetical protein  82.94 
 
 
401 aa  426  1e-118  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.320961  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0599  hypothetical protein  82.54 
 
 
319 aa  426  1e-118  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0616  hypothetical protein  83.47 
 
 
384 aa  426  1e-118  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.618084  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1240  hypothetical protein  64.09 
 
 
334 aa  373  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0820  hypothetical protein  57.23 
 
 
334 aa  344  7e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0049  hypothetical protein  27.4 
 
 
296 aa  80.9  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1534  hypothetical protein  30.38 
 
 
233 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0403  hypothetical protein  26.04 
 
 
284 aa  73.2  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000003324  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2560  hypothetical protein  25.45 
 
 
282 aa  73.2  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1091  hypothetical protein  27.22 
 
 
322 aa  72.8  0.000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0528026  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0669  hypothetical protein  26.12 
 
 
292 aa  71.6  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2707  hypothetical protein  25.68 
 
 
300 aa  71.2  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1691  hypothetical protein  27.11 
 
 
288 aa  70.1  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0007  hypothetical protein  25.61 
 
 
284 aa  70.1  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2719  hypothetical protein  26.74 
 
 
296 aa  68.9  0.00000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1344  hypothetical protein  24.14 
 
 
292 aa  67  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1947  hypothetical protein  26.3 
 
 
299 aa  66.6  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000247154  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1976  hypothetical protein  23.21 
 
 
287 aa  65.1  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1941  hypothetical protein  25.7 
 
 
288 aa  64.7  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000016272  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2695  hypothetical protein  26.64 
 
 
304 aa  64.3  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0536722 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0165  hypothetical protein  24.38 
 
 
284 aa  63.5  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1931  hypothetical protein  25.66 
 
 
308 aa  61.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0142  hypothetical protein  24.13 
 
 
298 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.836251  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0511  hypothetical protein  24.6 
 
 
309 aa  60.5  0.00000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00971553  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4711  hypothetical protein  24.1 
 
 
293 aa  59.7  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0013874  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0862  hypothetical protein  24.56 
 
 
284 aa  58.5  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0807  hypothetical protein  26.8 
 
 
298 aa  58.5  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.098381  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0257  hypothetical protein  26.8 
 
 
306 aa  58.5  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0749  hypothetical protein  23.34 
 
 
288 aa  58.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2384  hypothetical protein  28.1 
 
 
314 aa  57.4  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000288219  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0058  hypothetical protein  22.68 
 
 
315 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00639651  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3010  hypothetical protein  23.94 
 
 
326 aa  55.8  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0413061  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1558  hypothetical protein  28.26 
 
 
316 aa  55.8  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2145  hypothetical protein  23.57 
 
 
285 aa  55.8  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.955694  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0598  hypothetical protein  23.73 
 
 
296 aa  55.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0627  hypothetical protein  23.47 
 
 
298 aa  55.5  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.261327  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2565  hypothetical protein  24.45 
 
 
313 aa  54.3  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136363  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2696  hypothetical protein  27.4 
 
 
291 aa  54.7  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.216249 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1608  hypothetical protein  24.33 
 
 
306 aa  53.9  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2607  hypothetical protein  31.68 
 
 
289 aa  53.1  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.989258  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1261  hypothetical protein  23.37 
 
 
290 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1178  hypothetical protein  23.93 
 
 
314 aa  52.4  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1487  hypothetical protein  31.71 
 
 
302 aa  52.4  0.000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2698  hypothetical protein  24.5 
 
 
291 aa  52  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2384  hypothetical protein  32.41 
 
 
325 aa  51.6  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000252943  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0991  hypothetical protein  57.14 
 
 
324 aa  51.6  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000745042  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0686  hypothetical protein  57.14 
 
 
312 aa  50.8  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000261491  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0762  hypothetical protein  55.81 
 
 
317 aa  51.2  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00138696  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1034  hypothetical protein  55.81 
 
 
321 aa  50.8  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.121952  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0886  transposase and inactivated derivative  23.94 
 
 
310 aa  50.4  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.615238  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0127  hypothetical protein  23.08 
 
 
303 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000393642 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0038  hypothetical protein  57.14 
 
 
324 aa  50.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2583  hypothetical protein  23.02 
 
 
317 aa  49.7  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.21441e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1114  hypothetical protein  26.8 
 
 
310 aa  49.3  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0615  hypothetical protein  23.43 
 
 
300 aa  48.9  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0294  hypothetical protein  21.24 
 
 
315 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1236  hypothetical protein  24.6 
 
 
311 aa  48.9  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00145215  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4940  hypothetical protein  27.03 
 
 
327 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5306  hypothetical protein  23.96 
 
 
308 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939469  normal  0.0565222 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4944  hypothetical protein  27.93 
 
 
319 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0101  hypothetical protein  30.17 
 
 
298 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0885  hypothetical protein  21.94 
 
 
313 aa  48.1  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1509  hypothetical protein  54.76 
 
 
320 aa  47  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.055753  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1913  hypothetical protein  54.76 
 
 
79 aa  46.6  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0958  hypothetical protein  33.33 
 
 
285 aa  46.2  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0031  hypothetical protein  30.97 
 
 
307 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0158  hypothetical protein  30.97 
 
 
307 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.459825  hitchhiker  4.24073e-17 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1611  hypothetical protein  24.77 
 
 
318 aa  45.4  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.5466e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2630  hypothetical protein  40.43 
 
 
317 aa  44.3  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4715  hypothetical protein  26.13 
 
 
331 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0175  hypothetical protein  21.54 
 
 
256 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5077  hypothetical protein  26.13 
 
 
325 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1131  hypothetical protein  31.03 
 
 
298 aa  43.5  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0898  hypothetical protein  24.55 
 
 
283 aa  43.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148019 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0006  hypothetical protein  23.81 
 
 
313 aa  42.7  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00155614  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1411  hypothetical protein  41.86 
 
 
312 aa  42  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.27197 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>