79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1034 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1034  hypothetical protein  100 
 
 
321 aa  663    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.121952  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0991  hypothetical protein  92.62 
 
 
324 aa  619  1e-176  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000745042  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0762  hypothetical protein  84.74 
 
 
317 aa  555  1e-157  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00138696  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1509  hypothetical protein  72.76 
 
 
320 aa  489  1e-137  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.055753  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1558  hypothetical protein  73.21 
 
 
316 aa  483  1e-135  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1015  hypothetical protein  69.88 
 
 
324 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0038  hypothetical protein  70.46 
 
 
324 aa  464  1e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1336  hypothetical protein  69.21 
 
 
316 aa  456  1e-127  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0686  hypothetical protein  63.84 
 
 
312 aa  414  9.999999999999999e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000261491  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1916  hypothetical protein  72.22 
 
 
252 aa  382  1e-105  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1243  hypothetical protein  60.75 
 
 
310 aa  378  1e-104  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000429592  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1248  hypothetical protein  52.5 
 
 
336 aa  316  4e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0517  conserved hypothetical cytosolic protein  47.44 
 
 
339 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2183  hypothetical protein  55.3 
 
 
320 aa  310  2e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1257  hypothetical protein  48.98 
 
 
324 aa  305  9.000000000000001e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2379  hypothetical protein  53.79 
 
 
320 aa  299  3e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0198  hypothetical protein  46.85 
 
 
313 aa  243  5e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.202809  hitchhiker  0.00402229 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4593  hypothetical protein  44.28 
 
 
311 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00114736  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1962  hypothetical protein  44.91 
 
 
327 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2950  hypothetical protein  41.45 
 
 
334 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0249458  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1061  hypothetical protein  43.63 
 
 
311 aa  210  3e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000000000109934  normal  0.0587349 
 
 
 
NC_011729  PCC7424_2414  hypothetical protein  41.51 
 
 
307 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5125  hypothetical protein  42.06 
 
 
310 aa  209  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3938  hypothetical protein  41.6 
 
 
311 aa  209  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4493  hypothetical protein  41.63 
 
 
319 aa  205  7e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4532  hypothetical protein  41.63 
 
 
319 aa  205  7e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1567a  hypothetical cytosolic protein  39.72 
 
 
335 aa  204  1e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.203402  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2152  hypothetical cytosolic protein  38.28 
 
 
325 aa  204  2e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0026  hypothetical protein  37.95 
 
 
325 aa  200  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1739  hypothetical cytosolic protein  36.03 
 
 
312 aa  192  8e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0619  hypothetical protein  39.01 
 
 
341 aa  188  1e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1410  hypothetical protein  50.29 
 
 
235 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2345  hypothetical protein  49.66 
 
 
206 aa  157  3e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.387086  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1399  hypothetical protein  48.03 
 
 
211 aa  154  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0266105  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2348  hypothetical protein  47.62 
 
 
201 aa  149  8e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3970  hypothetical protein  32.13 
 
 
317 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.257716  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4692  hypothetical protein  34.33 
 
 
293 aa  124  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.824863  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1913  hypothetical protein  65.79 
 
 
79 aa  94  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0181  hypothetical protein  28.82 
 
 
325 aa  91.3  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000266297  normal  0.396651 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3368  hypothetical protein  27.8 
 
 
297 aa  90.5  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1182  hypothetical protein  28.26 
 
 
304 aa  89.4  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2786  hypothetical protein  26.58 
 
 
340 aa  86.3  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0174  hypothetical protein  28.04 
 
 
317 aa  84.3  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.384261  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0655  hypothetical protein  27.39 
 
 
300 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0681  hypothetical protein  29.92 
 
 
304 aa  80.9  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000573749  unclonable  0.0000000126403 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1193  hypothetical protein  27.68 
 
 
317 aa  79.7  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1240  hypothetical protein  59.09 
 
 
334 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1222  hypothetical protein  27.96 
 
 
313 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2274  hypothetical protein  24.58 
 
 
315 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1221  hypothetical protein  25.8 
 
 
292 aa  75.5  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2793  hypothetical protein  26.4 
 
 
301 aa  73.2  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0564  hypothetical protein  32.16 
 
 
302 aa  73.2  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1534  hypothetical protein  80.95 
 
 
233 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3206  hypothetical protein  30.08 
 
 
284 aa  70.1  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.488157  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1091  hypothetical protein  51.35 
 
 
322 aa  69.3  0.00000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0528026  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2187  hypothetical protein  27.64 
 
 
290 aa  69.3  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1248  hypothetical protein  26 
 
 
330 aa  69.3  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.442555 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1306  hypothetical protein  28.52 
 
 
283 aa  67.8  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0820  hypothetical protein  48.53 
 
 
334 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0597  hypothetical protein  48.61 
 
 
330 aa  62.4  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.946017  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1348  hypothetical protein  23.83 
 
 
318 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0527396  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0748  hypothetical protein  31.82 
 
 
134 aa  53.9  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000803284  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2444  hypothetical protein  49.12 
 
 
299 aa  53.5  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.445451  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1707  hypothetical protein  26.29 
 
 
280 aa  52  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.420351  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2294  hypothetical protein  55.81 
 
 
276 aa  50.8  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1236  hypothetical protein  37.88 
 
 
311 aa  48.5  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00145215  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3426  hypothetical protein  25.74 
 
 
311 aa  45.8  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2285  hypothetical protein  26.36 
 
 
288 aa  45.4  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3726  putative transposase  38.18 
 
 
310 aa  45.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1178  hypothetical protein  38.57 
 
 
314 aa  44.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1611  hypothetical protein  37.84 
 
 
318 aa  45.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.5466e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4940  hypothetical protein  46.67 
 
 
327 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0599  putative transposase YhgA family protein  24.37 
 
 
318 aa  44.3  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0397  hypothetical protein  36.36 
 
 
317 aa  44.3  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1045  putative transposase  28.32 
 
 
343 aa  44.3  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0831423  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1946  hypothetical protein  30.59 
 
 
138 aa  43.5  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000308535  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0248  hypothetical cytosolic protein  30.59 
 
 
138 aa  43.5  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02887  flagellar assembly protein H  36.14 
 
 
260 aa  43.5  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2384  hypothetical protein  21.45 
 
 
314 aa  43.1  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000288219  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>