134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1348 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1348  hypothetical protein  100 
 
 
318 aa  627  1e-179  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0527396  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1248  hypothetical protein  94.22 
 
 
330 aa  607  9.999999999999999e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.442555 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1349  hypothetical protein  94.58 
 
 
166 aa  292  4e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072063  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1249  hypothetical protein  93.63 
 
 
154 aa  281  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3426  hypothetical protein  46.41 
 
 
311 aa  278  8e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2274  hypothetical protein  43.09 
 
 
315 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1193  hypothetical protein  40.32 
 
 
317 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1222  hypothetical protein  40.72 
 
 
313 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0681  hypothetical protein  37.82 
 
 
304 aa  202  4e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000573749  unclonable  0.0000000126403 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0564  hypothetical protein  32.26 
 
 
302 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0174  hypothetical protein  32.62 
 
 
317 aa  179  5.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.384261  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0181  hypothetical protein  31.25 
 
 
325 aa  178  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000266297  normal  0.396651 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3368  hypothetical protein  36.36 
 
 
297 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3206  hypothetical protein  34.2 
 
 
284 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.488157  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1306  hypothetical protein  33.73 
 
 
283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0655  hypothetical protein  33.33 
 
 
300 aa  145  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2187  hypothetical protein  34.09 
 
 
290 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1182  hypothetical protein  32.17 
 
 
304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1221  hypothetical protein  31.85 
 
 
292 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2786  hypothetical protein  32.39 
 
 
340 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1707  hypothetical protein  35.09 
 
 
280 aa  138  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.420351  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2793  hypothetical protein  33.98 
 
 
301 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5125  hypothetical protein  29.28 
 
 
310 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1739  hypothetical cytosolic protein  30.38 
 
 
312 aa  100  3e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2379  hypothetical protein  29.21 
 
 
320 aa  100  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1257  hypothetical protein  29.85 
 
 
324 aa  96.7  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2950  hypothetical protein  29.7 
 
 
334 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0249458  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1061  hypothetical protein  30.28 
 
 
311 aa  91.7  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000000000109934  normal  0.0587349 
 
 
 
NC_008346  Swol_0748  hypothetical protein  36.44 
 
 
134 aa  90.5  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000803284  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2152  hypothetical cytosolic protein  29.32 
 
 
325 aa  89  9e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0026  hypothetical protein  28.66 
 
 
325 aa  88.6  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0517  conserved hypothetical cytosolic protein  29.62 
 
 
339 aa  87.4  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2183  hypothetical protein  28.84 
 
 
320 aa  82.8  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1336  hypothetical protein  26.79 
 
 
316 aa  80.1  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1248  hypothetical protein  28.02 
 
 
336 aa  79.3  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4873  hypothetical protein  29.27 
 
 
286 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3060  hypothetical protein  25.39 
 
 
280 aa  77.8  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3938  hypothetical protein  29.25 
 
 
311 aa  76.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4532  hypothetical protein  29.11 
 
 
319 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4493  hypothetical protein  29.11 
 
 
319 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1962  hypothetical protein  23.38 
 
 
327 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0038  hypothetical protein  25.87 
 
 
324 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4509  hypothetical protein  42.11 
 
 
303 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2698  hypothetical protein  26.96 
 
 
318 aa  73.9  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0198  hypothetical protein  25.78 
 
 
313 aa  73.6  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.202809  hitchhiker  0.00402229 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1015  hypothetical protein  25.53 
 
 
324 aa  72.8  0.000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2414  hypothetical protein  26.56 
 
 
307 aa  72.4  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1509  hypothetical protein  25.93 
 
 
320 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.055753  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2623  hypothetical protein  26.6 
 
 
322 aa  72  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0276584  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3564  hypothetical protein  36.19 
 
 
94 aa  70.9  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0951658  normal  0.295077 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1558  hypothetical protein  25.9 
 
 
316 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0368  hypothetical protein  25.42 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.730391  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1243  hypothetical protein  27.12 
 
 
310 aa  69.7  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000429592  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4879  hypothetical protein  40.96 
 
 
196 aa  69.3  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0686  hypothetical protein  26.64 
 
 
312 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000261491  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1567a  hypothetical cytosolic protein  27.1 
 
 
335 aa  68.6  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.203402  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0619  hypothetical protein  25.66 
 
 
341 aa  68.6  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2781  hypothetical protein  25.94 
 
 
314 aa  67.8  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.664556  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2863  hypothetical protein  27.27 
 
 
322 aa  67  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.113899 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4593  hypothetical protein  26.99 
 
 
311 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00114736  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3228  hypothetical protein  33.57 
 
 
152 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000432911  normal  0.0886646 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2442  hypothetical protein  25.16 
 
 
296 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.888337  hitchhiker  0.000000122281 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4928  hypothetical protein  26.82 
 
 
315 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.443955 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0762  hypothetical protein  25.09 
 
 
317 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00138696  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2559  hypothetical protein  26.61 
 
 
276 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.789765  normal  0.602087 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3554  hypothetical protein  26.61 
 
 
276 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1410  hypothetical protein  24.89 
 
 
235 aa  59.3  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2072  hypothetical protein  22.26 
 
 
306 aa  59.3  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.166176 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3230  hypothetical protein  36.84 
 
 
326 aa  59.3  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593282  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0749  hypothetical protein  28.46 
 
 
122 aa  59.3  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000564338  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1034  hypothetical protein  23.83 
 
 
321 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.121952  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1543  hypothetical protein  21.7 
 
 
323 aa  58.5  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1916  hypothetical protein  25.11 
 
 
252 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4692  hypothetical protein  24.62 
 
 
293 aa  57.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.824863  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2285  hypothetical protein  23.49 
 
 
288 aa  58.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5118  hypothetical protein  24.71 
 
 
291 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.469414  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1818  hypothetical protein  27.63 
 
 
280 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0320519  normal  0.937622 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3231  hypothetical protein  36.84 
 
 
382 aa  57.4  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2074  hypothetical protein  22.43 
 
 
310 aa  57  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.236799 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3232  hypothetical protein  36.84 
 
 
382 aa  57  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0991  hypothetical protein  22.26 
 
 
324 aa  56.2  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000745042  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1045  putative transposase  21.93 
 
 
343 aa  55.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0831423  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1121  hypothetical protein  21.09 
 
 
314 aa  55.5  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1963  putative transposase  24.16 
 
 
331 aa  54.7  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0706346  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2547  hypothetical protein  25.94 
 
 
314 aa  54.7  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0376053  normal  0.0608447 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6237  putative transposase  46.97 
 
 
345 aa  53.5  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.62735  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1071  hypothetical protein  50.88 
 
 
294 aa  53.1  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.05102 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5391  hypothetical protein  38.75 
 
 
70 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.566383  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0257  hypothetical protein  33.33 
 
 
306 aa  52.8  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0492  hypothetical protein  19.86 
 
 
312 aa  53.1  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2785  hypothetical protein  24.41 
 
 
310 aa  52.4  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1063  hypothetical protein  39.24 
 
 
82 aa  52  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000000299029  normal  0.0436362 
 
 
 
NC_009727  CBUD_0248  hypothetical cytosolic protein  35.44 
 
 
138 aa  52.4  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1946  hypothetical protein  35.44 
 
 
138 aa  52.4  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000308535  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0520  hypothetical protein  23.2 
 
 
307 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4405  hypothetical protein  30.05 
 
 
305 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1542  hypothetical protein  34.92 
 
 
275 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.966764  normal  0.0160527 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1062  hypothetical protein  41.77 
 
 
75 aa  50.4  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144683  normal  0.0450083 
 
 
 
NC_010003  Pmob_1250  hypothetical protein  23.22 
 
 
331 aa  50.4  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1515  hypothetical protein  34.92 
 
 
275 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>