93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2379 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2379  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  660    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1257  hypothetical protein  89.2 
 
 		 324 aa  592  1e-168  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2183  hypothetical protein  91.25 
 
 		 320 aa  585  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1248  hypothetical protein  77.08 
 
 		 336 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2348  hypothetical protein  88.29 
 
 		 201 aa  366  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2345  hypothetical protein  84.73 
 
 		 206 aa  347  2e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.387086  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1410  hypothetical protein  68.49 
 
 		 235 aa  340  1e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0517  conserved hypothetical cytosolic protein  49.4 
 
 		 339 aa  335  3.9999999999999995e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1336  hypothetical protein  54.35 
 
 		 316 aa  312  3.9999999999999997e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0991  hypothetical protein  52.3 
 
 		 324 aa  307  1.0000000000000001e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000745042  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1399  hypothetical protein  67.89 
 
 		 211 aa  301  1e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0266105  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1034  hypothetical protein  53.79 
 
 		 321 aa  299  3e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.121952  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0762  hypothetical protein  54.23 
 
 		 317 aa  293  2e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00138696  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1509  hypothetical protein  47.45 
 
 		 320 aa  292  6e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.055753  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1015  hypothetical protein  48.26 
 
 		 324 aa  291  1e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1558  hypothetical protein  52.47 
 
 		 316 aa  290  2e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0038  hypothetical protein  50.92 
 
 		 324 aa  281  1e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0686  hypothetical protein  50.18 
 
 		 312 aa  278  1e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000261491  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1243  hypothetical protein  50.57 
 
 		 310 aa  264  1e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000429592  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1916  hypothetical protein  53.62 
 
 		 252 aa  261  1e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4593  hypothetical protein  44.11 
 
 		 311 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00114736  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2950  hypothetical protein  44.71 
 
 		 334 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0249458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4532  hypothetical protein  44.26 
 
 		 319 aa  250  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4493  hypothetical protein  44.26 
 
 		 319 aa  250  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5125  hypothetical protein  41.94 
 
 		 310 aa  248  7e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1061  hypothetical protein  42.9 
 
 		 311 aa  230  2e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000000000109934  normal  0.0587349 
 
 
 
NC_007412  Ava_C0198  hypothetical protein  41.8 
 
 		 313 aa  226  4e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.202809  hitchhiker  0.00402229 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1962  hypothetical protein  36.91 
 
 		 327 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3938  hypothetical protein  43.87 
 
 		 311 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2152  hypothetical cytosolic protein  37.14 
 
 		 325 aa  221  9.999999999999999e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1739  hypothetical cytosolic protein  39.09 
 
 		 312 aa  220  3e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0026  hypothetical protein  36.22 
 
 		 325 aa  218  1e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0619  hypothetical protein  36.18 
 
 		 341 aa  215  5.9999999999999996e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2414  hypothetical protein  41.9 
 
 		 307 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1567a  hypothetical cytosolic protein  36.31 
 
 		 335 aa  207  2e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.203402  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4692  hypothetical protein  33.62 
 
 		 293 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.824863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0174  hypothetical protein  32.08 
 
 		 317 aa  116  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.384261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3970  hypothetical protein  29.23 
 
 		 317 aa  116  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.257716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0181  hypothetical protein  31.58 
 
 		 325 aa  110  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000266297  normal  0.396651 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0564  hypothetical protein  30.91 
 
 		 302 aa  105  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1348  hypothetical protein  29.21 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0527396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0681  hypothetical protein  28.8 
 
 		 304 aa  99.8  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000573749  unclonable  0.0000000126403 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2274  hypothetical protein  28.04 
 
 		 315 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1248  hypothetical protein  29.05 
 
 		 330 aa  93.2  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442555 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0624  hypothetical protein  58.75 
 
 		 130 aa  89.7  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0436757  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1193  hypothetical protein  25.95 
 
 		 317 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1222  hypothetical protein  25.88 
 
 		 313 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3368  hypothetical protein  31.11 
 
 		 297 aa  85.9  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2781  hypothetical protein  28.39 
 
 		 314 aa  85.9  9e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.664556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1221  hypothetical protein  28.57 
 
 		 292 aa  82  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0599  hypothetical protein  67.65 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2698  hypothetical protein  28.39 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2623  hypothetical protein  27.42 
 
 		 322 aa  80.1  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0276584  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3206  hypothetical protein  31.44 
 
 		 284 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.488157  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0596  hypothetical protein  65.15 
 
 		 401 aa  73.6  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.320961  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0616  hypothetical protein  55.7 
 
 		 384 aa  72.4  0.000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.618084  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1306  hypothetical protein  29.68 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1946  hypothetical protein  37.96 
 
 		 138 aa  70.5  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000308535  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2187  hypothetical protein  28.8 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0248  hypothetical cytosolic protein  37.96 
 
 		 138 aa  70.5  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2793  hypothetical protein  28.92 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2785  hypothetical protein  26.86 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2547  hypothetical protein  28.87 
 
 		 314 aa  68.9  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0376053  normal  0.0608447 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3426  hypothetical protein  25.87 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1182  hypothetical protein  29.93 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0655  hypothetical protein  28.62 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1089  putative transposase  46.97 
 
 		 337 aa  65.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.693638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2863  hypothetical protein  27.1 
 
 		 322 aa  65.5  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113899 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0748  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  64.7  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000803284  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2880  hypothetical protein  29.45 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.149752  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6237  putative transposase  40.91 
 
 		 345 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.62735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2786  hypothetical protein  28.83 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0802  putative transposase  36.47 
 
 		 333 aa  59.3  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1059  putative transposase  40 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1963  putative transposase  43.94 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0706346  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0990  putative transposase  37.18 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.271034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1108  putative transposase  48.48 
 
 		 339 aa  53.9  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1707  hypothetical protein  27.01 
 
 		 280 aa  53.1  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.420351  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1994  putative transposase  26.79 
 
 		 319 aa  53.1  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.735151 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1504  putative transposase  54.17 
 
 		 350 aa  52.4  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1045  putative transposase  31.06 
 
 		 343 aa  52  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0831423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2960  putative transposase  34.57 
 
 		 329 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.26307  normal  0.0520741 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0878  putative transposase  37.18 
 
 		 321 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1150  putative transposase  34.88 
 
 		 330 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1349  hypothetical protein  30.14 
 
 		 166 aa  49.7  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0749  hypothetical protein  39.66 
 
 		 122 aa  48.5  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000564338  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1249  hypothetical protein  29.41 
 
 		 154 aa  47  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0599  putative transposase YhgA family protein  24.18 
 
 		 318 aa  46.2  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1063  hypothetical protein  41.54 
 
 		 82 aa  45.4  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000000299029  normal  0.0436362 
 
 
 
NC_011126  HY04AAS1_1128  hypothetical protein  25.94 
 
 		 328 aa  45.1  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2902  putative transposase  32.94 
 
 		 335 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0257  hypothetical protein  34.55 
 
 		 306 aa  43.9  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1243  hypothetical protein  25.21 
 
 		 288 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>