92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1558 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1558  hypothetical protein  100 
 
 
316 aa  653    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1509  hypothetical protein  85.19 
 
 
320 aa  558  1e-158  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.055753  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1015  hypothetical protein  84.98 
 
 
324 aa  551  1e-156  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1336  hypothetical protein  78.03 
 
 
316 aa  498  1e-140  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0991  hypothetical protein  73.52 
 
 
324 aa  486  1e-136  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000745042  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1034  hypothetical protein  73.21 
 
 
321 aa  483  1e-135  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.121952  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0762  hypothetical protein  70.66 
 
 
317 aa  455  1e-127  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00138696  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1916  hypothetical protein  85.94 
 
 
252 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0038  hypothetical protein  66.05 
 
 
324 aa  431  1e-120  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0686  hypothetical protein  64.08 
 
 
312 aa  404  1.0000000000000001e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000261491  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1243  hypothetical protein  60.76 
 
 
310 aa  382  1e-105  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000429592  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1248  hypothetical protein  49.82 
 
 
336 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2183  hypothetical protein  53.61 
 
 
320 aa  301  1e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1257  hypothetical protein  51.09 
 
 
324 aa  298  1e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0517  conserved hypothetical cytosolic protein  48.76 
 
 
339 aa  291  1e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2379  hypothetical protein  52.47 
 
 
320 aa  290  2e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2950  hypothetical protein  42.65 
 
 
334 aa  238  8e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0249458  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5125  hypothetical protein  44.53 
 
 
310 aa  231  9e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0198  hypothetical protein  44.18 
 
 
313 aa  229  6e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.202809  hitchhiker  0.00402229 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4593  hypothetical protein  42.48 
 
 
311 aa  229  6e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00114736  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2152  hypothetical cytosolic protein  42.11 
 
 
325 aa  221  9.999999999999999e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0026  hypothetical protein  41.73 
 
 
325 aa  217  2e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1962  hypothetical protein  43.08 
 
 
327 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1567a  hypothetical cytosolic protein  40.73 
 
 
335 aa  215  8e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.203402  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4532  hypothetical protein  43.28 
 
 
319 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4493  hypothetical protein  43.28 
 
 
319 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3938  hypothetical protein  39.46 
 
 
311 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2414  hypothetical protein  41.47 
 
 
307 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1739  hypothetical cytosolic protein  42.91 
 
 
312 aa  204  1e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1061  hypothetical protein  43.93 
 
 
311 aa  202  6e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000000000109934  normal  0.0587349 
 
 
 
NC_010117  COXBURSA331_A0619  hypothetical protein  37.72 
 
 
341 aa  193  3e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1410  hypothetical protein  48.54 
 
 
235 aa  181  1e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1399  hypothetical protein  45.39 
 
 
211 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0266105  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2345  hypothetical protein  44 
 
 
206 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.387086  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2348  hypothetical protein  43.67 
 
 
201 aa  140  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4692  hypothetical protein  35.21 
 
 
293 aa  122  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.824863  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3970  hypothetical protein  30.59 
 
 
317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.257716  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2786  hypothetical protein  27.78 
 
 
340 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1182  hypothetical protein  29.02 
 
 
304 aa  99  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1913  hypothetical protein  72.22 
 
 
79 aa  95.9  9e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0181  hypothetical protein  28.91 
 
 
325 aa  94.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000266297  normal  0.396651 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0174  hypothetical protein  27.15 
 
 
317 aa  89.7  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.384261  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3368  hypothetical protein  26.47 
 
 
297 aa  88.6  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0681  hypothetical protein  28.95 
 
 
304 aa  88.2  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000573749  unclonable  0.0000000126403 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0655  hypothetical protein  28.03 
 
 
300 aa  88.2  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1221  hypothetical protein  26.28 
 
 
292 aa  87.4  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1248  hypothetical protein  27.8 
 
 
330 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.442555 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1193  hypothetical protein  27.51 
 
 
317 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2274  hypothetical protein  28.04 
 
 
315 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1222  hypothetical protein  27.31 
 
 
313 aa  79.3  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1091  hypothetical protein  58.21 
 
 
322 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0528026  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2793  hypothetical protein  26.94 
 
 
301 aa  75.1  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0820  hypothetical protein  46.07 
 
 
334 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1348  hypothetical protein  25.9 
 
 
318 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0527396  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3206  hypothetical protein  26.21 
 
 
284 aa  70.5  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.488157  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1306  hypothetical protein  27 
 
 
283 aa  69.3  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2187  hypothetical protein  26.6 
 
 
290 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1240  hypothetical protein  27.87 
 
 
334 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1534  hypothetical protein  37.84 
 
 
233 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1707  hypothetical protein  26.77 
 
 
280 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.420351  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0564  hypothetical protein  29.84 
 
 
302 aa  65.1  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0748  hypothetical protein  30.83 
 
 
134 aa  58.9  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000803284  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2444  hypothetical protein  54.9 
 
 
299 aa  58.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.445451  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0597  hypothetical protein  41.94 
 
 
330 aa  57.4  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.946017  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2294  hypothetical protein  28.26 
 
 
276 aa  55.8  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2384  hypothetical protein  23.51 
 
 
314 aa  55.1  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000288219  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0807  hypothetical protein  20.34 
 
 
298 aa  49.7  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.098381  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0658  putative transposase  31.03 
 
 
332 aa  49.3  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000193277 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3426  hypothetical protein  24 
 
 
311 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0248  hypothetical cytosolic protein  38.57 
 
 
138 aa  48.9  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1946  hypothetical protein  38.57 
 
 
138 aa  48.9  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000308535  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0599  putative transposase YhgA family protein  36.36 
 
 
318 aa  48.9  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0354  hypothetical protein  24.11 
 
 
294 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0361  hypothetical protein  24.11 
 
 
294 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.926631  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1487  hypothetical protein  19.47 
 
 
302 aa  46.2  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1045  putative transposase  27.08 
 
 
343 aa  45.8  0.0009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0831423  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2430  hypothetical protein  25.23 
 
 
291 aa  45.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.91793 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2677  hypothetical protein  37.84 
 
 
331 aa  45.4  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1504  flagellar assembly protein H  46.15 
 
 
262 aa  45.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1349  hypothetical protein  29.73 
 
 
166 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072063  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0598  hypothetical protein  27.43 
 
 
296 aa  44.3  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0464  hypothetical protein  22.54 
 
 
278 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.188518 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0451  hypothetical protein  22.54 
 
 
278 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0238  hypothetical protein  36.36 
 
 
344 aa  43.5  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.447255  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2934  flagellar assembly protein H  46.51 
 
 
338 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2924  flagellar assembly protein H  46.51 
 
 
338 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1439  flagellar assembly protein H  46.51 
 
 
338 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0885  hypothetical protein  33.85 
 
 
313 aa  43.1  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3066  flagellar assembly protein H  46.51 
 
 
338 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.934094 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2285  hypothetical protein  24.17 
 
 
288 aa  42.7  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1611  hypothetical protein  39.22 
 
 
318 aa  42.7  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.5466e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3226  flagellar assembly protein H  46.51 
 
 
316 aa  42.4  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>