95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2444 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2444  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  605  9.999999999999999e-173  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.445451  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0597  hypothetical protein  75.78 
 
 		 330 aa  489  1e-137  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.946017  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2294  hypothetical protein  85.61 
 
 		 276 aa  486  1e-136  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0596  hypothetical protein  83.03 
 
 		 401 aa  457  9.999999999999999e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.320961  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0616  hypothetical protein  84.47 
 
 		 384 aa  455  1e-127  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.618084  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0599  hypothetical protein  82.53 
 
 		 319 aa  454  1e-127  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1240  hypothetical protein  64.52 
 
 		 334 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0820  hypothetical protein  59.94 
 
 		 334 aa  382  1e-105  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4711  hypothetical protein  26.8 
 
 		 293 aa  91.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0013874  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1091  hypothetical protein  27.24 
 
 		 322 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0528026  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2565  hypothetical protein  28.03 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136363  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2719  hypothetical protein  26.26 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0049  hypothetical protein  25.96 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0669  hypothetical protein  25.84 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1344  hypothetical protein  25.93 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0885  hypothetical protein  25.71 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1947  hypothetical protein  26.4 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000247154  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2583  hypothetical protein  25.61 
 
 		 317 aa  70.5  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.21441e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0598  hypothetical protein  26 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1941  hypothetical protein  26.07 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000016272  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2560  hypothetical protein  24.58 
 
 		 282 aa  68.9  0.00000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0058  hypothetical protein  24.92 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00639651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1534  hypothetical protein  28.46 
 
 		 233 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0165  hypothetical protein  23.47 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2707  hypothetical protein  26.02 
 
 		 300 aa  67  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0615  hypothetical protein  25.41 
 
 		 300 aa  67  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0007  hypothetical protein  23.79 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3010  hypothetical protein  25.88 
 
 		 326 aa  65.9  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0413061  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1608  hypothetical protein  25.89 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0403  hypothetical protein  27.17 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000003324  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1178  hypothetical protein  23.97 
 
 		 314 aa  63.5  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5306  hypothetical protein  25.24 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939469  normal  0.0565222 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1691  hypothetical protein  25.27 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0294  hypothetical protein  24.73 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0142  hypothetical protein  22.52 
 
 		 298 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.836251  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1487  hypothetical protein  25.93 
 
 		 302 aa  62  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1236  hypothetical protein  26.21 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00145215  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0511  hypothetical protein  23.13 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00971553  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2384  hypothetical protein  28.36 
 
 		 314 aa  61.2  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000288219  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0749  hypothetical protein  25.26 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1976  hypothetical protein  23.26 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1931  hypothetical protein  25.32 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4940  hypothetical protein  24.13 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4715  hypothetical protein  22.95 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5077  hypothetical protein  22.95 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1336  hypothetical protein  50.85 
 
 		 316 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1611  hypothetical protein  25.8 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.5466e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4944  hypothetical protein  24.35 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0686  hypothetical protein  48.39 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000261491  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1558  hypothetical protein  54.9 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0862  hypothetical protein  23.81 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0807  hypothetical protein  26.85 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.098381  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0762  hypothetical protein  52.63 
 
 		 317 aa  57  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00138696  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1509  hypothetical protein  55.56 
 
 		 320 aa  57  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.055753  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1261  hypothetical protein  23.2 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0038  hypothetical protein  49.12 
 
 		 324 aa  55.1  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1114  hypothetical protein  23.32 
 
 		 310 aa  55.1  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2145  hypothetical protein  22.85 
 
 		 285 aa  55.5  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.955694  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1131  hypothetical protein  22.64 
 
 		 298 aa  54.7  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0991  hypothetical protein  50.82 
 
 		 324 aa  53.5  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000745042  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2384  hypothetical protein  28.97 
 
 		 325 aa  53.1  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000252943  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1034  hypothetical protein  49.12 
 
 		 321 aa  53.5  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.121952  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0122  putative transposase  53.33 
 
 		 313 aa  53.1  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.2156300000000001e-29 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0397  hypothetical protein  23.93 
 
 		 317 aa  52.8  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0958  hypothetical protein  24.75 
 
 		 285 aa  52.4  0.000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1913  hypothetical protein  47.37 
 
 		 79 aa  52  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0006  hypothetical protein  22.9 
 
 		 313 aa  52  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00155614  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0627  hypothetical protein  22.11 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.261327  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1221  hypothetical protein  24.43 
 
 		 292 aa  50.4  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0175  hypothetical protein  23.97 
 
 		 256 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2695  hypothetical protein  25.1 
 
 		 304 aa  49.3  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0536722 
 
 
-
 
NC_002978  WD0296  hypothetical protein  25.08 
 
 		 303 aa  49.3  0.00008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0337026  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0127  hypothetical protein  24.67 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000393642 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2696  hypothetical protein  27.24 
 
 		 291 aa  48.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.216249 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1015  hypothetical protein  50 
 
 		 324 aa  48.1  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1737  hypothetical protein  26.26 
 
 		 318 aa  47.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033036 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0300  hypothetical protein  23 
 
 		 305 aa  47.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000400684  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1243  hypothetical protein  51.06 
 
 		 310 aa  47.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000429592  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0101  hypothetical protein  25.97 
 
 		 298 aa  46.6  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0031  hypothetical protein  29.46 
 
 		 307 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0158  hypothetical protein  29.46 
 
 		 307 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.459825  hitchhiker  4.24073e-17 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0257  hypothetical protein  24.07 
 
 		 306 aa  46.2  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1070  hypothetical protein  24.01 
 
 		 287 aa  45.8  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2607  hypothetical protein  21.93 
 
 		 289 aa  45.8  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.989258  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2698  hypothetical protein  24.9 
 
 		 291 aa  45.8  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0451  hypothetical protein  33.33 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0464  hypothetical protein  33.33 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.188518 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1830  hypothetical protein  24.23 
 
 		 290 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00791791  hitchhiker  0.0000000000564838 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2786  hypothetical protein  33.33 
 
 		 340 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1182  hypothetical protein  23.84 
 
 		 304 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3455  hypothetical protein  44 
 
 		 283 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0230  hypothetical protein  20.5 
 
 		 290 aa  43.5  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00383338  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3726  putative transposase  42.22 
 
 		 310 aa  43.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0216  hypothetical protein  23.6 
 
 		 312 aa  43.1  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000115501  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0655  hypothetical protein  23.47 
 
 		 300 aa  42.7  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>