84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1070 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1070  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  592  1e-168  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1737  hypothetical protein  70.57 
 
 
318 aa  437  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0033036 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1763  hypothetical protein  70.46 
 
 
300 aa  416  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0148846 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0885  hypothetical protein  89.41 
 
 
183 aa  316  2e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00688729 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0886  transposase and inactivated derivative  43.82 
 
 
310 aa  248  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.615238  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5306  hypothetical protein  42.68 
 
 
308 aa  204  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939469  normal  0.0565222 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0898  hypothetical protein  40.56 
 
 
283 aa  200  3e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148019 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1830  hypothetical protein  37.41 
 
 
290 aa  170  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00791791  hitchhiker  0.0000000000564838 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0749  hypothetical protein  33.68 
 
 
288 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1091  hypothetical protein  38.46 
 
 
322 aa  158  1e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0528026  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0598  hypothetical protein  32.42 
 
 
296 aa  158  1e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0615  hypothetical protein  31.65 
 
 
300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1534  hypothetical protein  35.68 
 
 
233 aa  124  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0296  hypothetical protein  28.8 
 
 
303 aa  108  1e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0337026  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0627  hypothetical protein  28.52 
 
 
298 aa  108  1e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.261327  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0511  hypothetical protein  32.81 
 
 
309 aa  93.6  3e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00971553  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3058  hypothetical protein  24.57 
 
 
289 aa  91.7  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.669677  normal  0.19062 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3057  hypothetical protein  25.61 
 
 
285 aa  92  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.139134 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2497  hypothetical protein  27.31 
 
 
309 aa  84.3  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1941  hypothetical protein  27.27 
 
 
288 aa  83.6  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000016272  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1947  hypothetical protein  26.33 
 
 
299 aa  77.4  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000247154  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4711  hypothetical protein  26.22 
 
 
293 aa  74.3  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0013874  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1261  hypothetical protein  26.73 
 
 
290 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0694  hypothetical protein  28.31 
 
 
242 aa  72.4  0.000000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0058  hypothetical protein  25.41 
 
 
315 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00639651  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0691  hypothetical protein  39.24 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0223479  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0766  hypothetical protein  23.19 
 
 
303 aa  65.5  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3230  hypothetical protein  26.05 
 
 
326 aa  64.3  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593282  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3232  hypothetical protein  26.05 
 
 
382 aa  63.9  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0528  hypothetical protein  26.36 
 
 
311 aa  63.9  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.261127  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3231  hypothetical protein  26.05 
 
 
382 aa  63.2  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0142  hypothetical protein  22.8 
 
 
298 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.836251  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0226  hypothetical protein  39.24 
 
 
147 aa  61.2  0.00000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0403  hypothetical protein  24.91 
 
 
284 aa  60.1  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000003324  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0550  hypothetical protein  35.58 
 
 
109 aa  59.7  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.15726  normal  0.439248 
 
 
-
 
NC_002978  WD0398  hypothetical protein  35.44 
 
 
147 aa  58.9  0.00000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0294  hypothetical protein  23.25 
 
 
315 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0993  hypothetical protein  34.18 
 
 
147 aa  58.5  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2719  hypothetical protein  24.83 
 
 
296 aa  58.2  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0996  hypothetical protein  27.88 
 
 
266 aa  57.8  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0257  hypothetical protein  22.81 
 
 
306 aa  56.6  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0862  hypothetical protein  24.73 
 
 
284 aa  56.2  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0127  hypothetical protein  23.55 
 
 
303 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000393642 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4940  hypothetical protein  25 
 
 
327 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0031  hypothetical protein  23.23 
 
 
307 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0395  hypothetical protein  27.36 
 
 
246 aa  55.1  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4944  hypothetical protein  33.33 
 
 
319 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0536  hypothetical protein  32.91 
 
 
147 aa  54.3  0.000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.392908  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1140  hypothetical protein  31.65 
 
 
147 aa  53.5  0.000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0158  hypothetical protein  22.9 
 
 
307 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.459825  hitchhiker  4.24073e-17 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1744  hypothetical protein  43.24 
 
 
277 aa  53.1  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312138 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2698  hypothetical protein  24.08 
 
 
291 aa  53.1  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2145  hypothetical protein  22.71 
 
 
285 aa  52.4  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.955694  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5077  hypothetical protein  24.58 
 
 
325 aa  52.4  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4715  hypothetical protein  24.58 
 
 
331 aa  52.4  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0539  hypothetical protein  24.58 
 
 
277 aa  51.2  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1137  hypothetical protein  25.45 
 
 
256 aa  51.6  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0807  hypothetical protein  25 
 
 
298 aa  50.8  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.098381  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1344  hypothetical protein  21.95 
 
 
292 aa  49.7  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3010  hypothetical protein  22.13 
 
 
326 aa  50.1  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0413061  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0165  hypothetical protein  23.59 
 
 
284 aa  48.9  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0007  hypothetical protein  31.63 
 
 
284 aa  48.5  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0551  hypothetical protein  26.61 
 
 
166 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298634  normal  0.46051 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2384  hypothetical protein  30.77 
 
 
325 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000252943  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0049  hypothetical protein  20.88 
 
 
296 aa  47.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1976  hypothetical protein  22.38 
 
 
287 aa  48.1  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1766  hypothetical protein  58.97 
 
 
269 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00371107 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1487  hypothetical protein  24.03 
 
 
302 aa  47  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2384  hypothetical protein  23.35 
 
 
314 aa  47.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000288219  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3043  hypothetical protein  30.28 
 
 
187 aa  47  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.190501  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1691  hypothetical protein  22.82 
 
 
288 aa  47  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2707  hypothetical protein  31.63 
 
 
300 aa  47  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2560  hypothetical protein  31.63 
 
 
282 aa  46.6  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0101  hypothetical protein  30.3 
 
 
298 aa  46.6  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24430  hypothetical protein  23.59 
 
 
323 aa  46.2  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2444  hypothetical protein  24.01 
 
 
299 aa  45.8  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.445451  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1931  hypothetical protein  28.85 
 
 
308 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0006  hypothetical protein  23.12 
 
 
313 aa  44.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00155614  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2256  hypothetical protein  28.21 
 
 
315 aa  44.3  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000395592  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2413  hypothetical protein  23.28 
 
 
326 aa  44.3  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000810744  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2607  hypothetical protein  23.84 
 
 
289 aa  44.3  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.989258  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4961  hypothetical protein  29.89 
 
 
101 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28300  hypothetical protein  24.44 
 
 
365 aa  42.4  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.197043 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1131  hypothetical protein  23.32 
 
 
298 aa  42  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>