123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0403 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0403  hypothetical protein  100 
 
 
284 aa  580  1e-164  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000003324  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1691  hypothetical protein  87.5 
 
 
288 aa  516  1.0000000000000001e-145  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1976  hypothetical protein  85.76 
 
 
287 aa  506  9.999999999999999e-143  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0049  hypothetical protein  80.41 
 
 
296 aa  483  1e-135  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0862  hypothetical protein  66.2 
 
 
284 aa  392  1e-108  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0007  hypothetical protein  62.68 
 
 
284 aa  374  1e-102  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0165  hypothetical protein  63.03 
 
 
284 aa  372  1e-102  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0669  hypothetical protein  63.36 
 
 
292 aa  371  1e-102  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1344  hypothetical protein  63.7 
 
 
292 aa  372  1e-102  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2719  hypothetical protein  62.5 
 
 
296 aa  370  1e-101  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2707  hypothetical protein  60.67 
 
 
300 aa  365  1e-100  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2560  hypothetical protein  59.64 
 
 
282 aa  345  5e-94  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4711  hypothetical protein  32.39 
 
 
293 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0013874  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3010  hypothetical protein  33.47 
 
 
326 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0413061  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0058  hypothetical protein  28.18 
 
 
315 aa  125  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00639651  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2136  hypothetical protein  85.53 
 
 
89 aa  125  7e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2145  hypothetical protein  32.3 
 
 
285 aa  124  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.955694  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0958  hypothetical protein  31.94 
 
 
285 aa  123  3e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0142  hypothetical protein  27.8 
 
 
298 aa  123  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.836251  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2429  hypothetical protein  32.52 
 
 
306 aa  122  7e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.905832 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0230  hypothetical protein  31.06 
 
 
290 aa  120  3e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00383338  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2698  hypothetical protein  31.42 
 
 
291 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1261  hypothetical protein  28.52 
 
 
290 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0294  hypothetical protein  29.78 
 
 
315 aa  115  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1931  hypothetical protein  29.43 
 
 
308 aa  115  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1487  hypothetical protein  32.2 
 
 
302 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1131  hypothetical protein  30.79 
 
 
298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1941  hypothetical protein  31.25 
 
 
288 aa  114  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000016272  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0257  hypothetical protein  30.65 
 
 
306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4940  hypothetical protein  29.55 
 
 
327 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2607  hypothetical protein  30.26 
 
 
289 aa  113  4.0000000000000004e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.989258  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2384  hypothetical protein  32.79 
 
 
314 aa  112  7.000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000288219  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0807  hypothetical protein  32.65 
 
 
298 aa  112  9e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.098381  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2696  hypothetical protein  29.76 
 
 
291 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.216249 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4715  hypothetical protein  29.17 
 
 
331 aa  109  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0300  hypothetical protein  27.53 
 
 
305 aa  109  6e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000400684  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5077  hypothetical protein  29.17 
 
 
325 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0216  hypothetical protein  32.28 
 
 
312 aa  107  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000115501  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1947  hypothetical protein  31.42 
 
 
299 aa  107  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000247154  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0031  hypothetical protein  32.63 
 
 
307 aa  106  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0158  hypothetical protein  32.63 
 
 
307 aa  106  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.459825  hitchhiker  4.24073e-17 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2384  hypothetical protein  28.48 
 
 
325 aa  105  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000252943  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2413  hypothetical protein  27.18 
 
 
326 aa  105  8e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000810744  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2097  hypothetical protein  58.14 
 
 
87 aa  105  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.607253  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0127  hypothetical protein  29.07 
 
 
303 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000393642 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0397  hypothetical protein  28.57 
 
 
317 aa  103  4e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0101  hypothetical protein  32.2 
 
 
298 aa  99.8  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4944  hypothetical protein  26.86 
 
 
319 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2583  hypothetical protein  27.62 
 
 
317 aa  98.2  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.21441e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0006  hypothetical protein  26.69 
 
 
313 aa  95.9  6e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00155614  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2565  hypothetical protein  26.69 
 
 
313 aa  94.7  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136363  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0885  hypothetical protein  26.69 
 
 
313 aa  90.5  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0175  hypothetical protein  26.92 
 
 
256 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1608  hypothetical protein  25.74 
 
 
306 aa  87.4  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1114  hypothetical protein  24.76 
 
 
310 aa  86.7  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2695  hypothetical protein  28.62 
 
 
304 aa  86.7  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0536722 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1611  hypothetical protein  25.4 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.5466e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2694  hypothetical protein  30.9 
 
 
293 aa  84.7  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_002978  WD0627  hypothetical protein  28.57 
 
 
298 aa  83.6  0.000000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.261327  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2432  hypothetical protein  26.95 
 
 
259 aa  83.2  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.870937 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0749  hypothetical protein  25.18 
 
 
288 aa  80.9  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1236  hypothetical protein  25.08 
 
 
311 aa  80.9  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00145215  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1178  hypothetical protein  25.08 
 
 
314 aa  80.1  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2425  hypothetical protein  26.72 
 
 
276 aa  78.2  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2294  hypothetical protein  26.04 
 
 
276 aa  73.2  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2098  hypothetical protein  91.89 
 
 
44 aa  73.2  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2711  hypothetical protein  25.57 
 
 
299 aa  72.8  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0116861  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0598  hypothetical protein  25.43 
 
 
296 aa  72  0.000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0597  hypothetical protein  27.27 
 
 
330 aa  71.2  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.946017  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0511  hypothetical protein  25.68 
 
 
309 aa  70.5  0.00000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00971553  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0616  hypothetical protein  27.67 
 
 
384 aa  70.1  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.618084  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0596  hypothetical protein  27.67 
 
 
401 aa  70.1  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.320961  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0599  hypothetical protein  27.27 
 
 
319 aa  70.1  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0296  hypothetical protein  26.6 
 
 
303 aa  69.7  0.00000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0337026  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0886  transposase and inactivated derivative  26.46 
 
 
310 aa  69.7  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.615238  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2771  hypothetical protein  25.26 
 
 
283 aa  68.9  0.00000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0615  hypothetical protein  24.83 
 
 
300 aa  67  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1938  hypothetical protein  55.77 
 
 
288 aa  66.6  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1240  hypothetical protein  24.75 
 
 
334 aa  65.9  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0820  hypothetical protein  25.98 
 
 
334 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0766  hypothetical protein  24.56 
 
 
303 aa  65.1  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1032  hypothetical protein  24.23 
 
 
287 aa  64.7  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.15202  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2444  hypothetical protein  27.17 
 
 
299 aa  64.7  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.445451  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4555  hypothetical protein  26.29 
 
 
234 aa  63.9  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.166025  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4573  hypothetical protein  24.89 
 
 
230 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1091  hypothetical protein  25.1 
 
 
322 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0528026  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1737  hypothetical protein  25.5 
 
 
318 aa  62  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0033036 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1070  hypothetical protein  24.91 
 
 
287 aa  60.1  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2419  hypothetical protein  28.66 
 
 
245 aa  59.7  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2497  hypothetical protein  25.17 
 
 
309 aa  59.3  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2556  hypothetical protein  24.13 
 
 
281 aa  58.9  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3230  hypothetical protein  25.82 
 
 
326 aa  57.4  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593282  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4961  hypothetical protein  32.97 
 
 
101 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1891  hypothetical protein  24.31 
 
 
254 aa  56.6  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000150124  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2436  hypothetical protein  23.93 
 
 
254 aa  55.1  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1137  hypothetical protein  27.36 
 
 
256 aa  55.1  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1906  hypothetical protein  25.18 
 
 
254 aa  54.7  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0528  hypothetical protein  26.13 
 
 
311 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.261127  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3231  hypothetical protein  25.82 
 
 
382 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3232  hypothetical protein  25.82 
 
 
382 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>