69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2556 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2556  hypothetical protein  100 
 
 
281 aa  572  1.0000000000000001e-162  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2771  hypothetical protein  70.65 
 
 
283 aa  405  1.0000000000000001e-112  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2711  hypothetical protein  67.59 
 
 
299 aa  403  1e-111  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0116861  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1032  hypothetical protein  69.42 
 
 
287 aa  397  1e-109  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.15202  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2707  hypothetical protein  27.05 
 
 
300 aa  75.9  0.0000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1691  hypothetical protein  27.56 
 
 
288 aa  73.6  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2384  hypothetical protein  26.23 
 
 
325 aa  71.2  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000252943  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1344  hypothetical protein  24.83 
 
 
292 aa  68.2  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0007  hypothetical protein  25.7 
 
 
284 aa  67.8  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1931  hypothetical protein  25 
 
 
308 aa  65.9  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0669  hypothetical protein  25.61 
 
 
292 aa  65.5  0.0000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1976  hypothetical protein  23.93 
 
 
287 aa  62.4  0.000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0862  hypothetical protein  25.17 
 
 
284 aa  59.3  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0257  hypothetical protein  28.9 
 
 
306 aa  58.5  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0403  hypothetical protein  24.13 
 
 
284 aa  58.9  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000003324  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0142  hypothetical protein  23.92 
 
 
298 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.836251  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3368  hypothetical protein  25.84 
 
 
297 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0975  hypothetical protein  26.51 
 
 
292 aa  57  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000468925  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0165  hypothetical protein  25.36 
 
 
284 aa  57.4  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1261  hypothetical protein  25.82 
 
 
290 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2719  hypothetical protein  24.22 
 
 
296 aa  56.2  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0598  hypothetical protein  25.25 
 
 
296 aa  54.7  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0300  hypothetical protein  24.91 
 
 
305 aa  55.5  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000400684  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0049  hypothetical protein  24.32 
 
 
296 aa  54.3  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2145  hypothetical protein  24.32 
 
 
285 aa  54.7  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.955694  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0807  hypothetical protein  22.56 
 
 
298 aa  53.5  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.098381  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1991  hypothetical protein  26.74 
 
 
254 aa  53.9  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0749  hypothetical protein  25.93 
 
 
288 aa  53.5  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0886  transposase and inactivated derivative  24.67 
 
 
310 aa  53.1  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.615238  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1487  hypothetical protein  22.82 
 
 
302 aa  53.1  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2413  hypothetical protein  26.03 
 
 
326 aa  53.1  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000810744  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0230  hypothetical protein  25.6 
 
 
290 aa  53.1  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00383338  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2560  hypothetical protein  23.3 
 
 
282 aa  52.8  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2436  hypothetical protein  25.64 
 
 
254 aa  52.4  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1938  hypothetical protein  27 
 
 
288 aa  52.4  0.000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1941  hypothetical protein  25.61 
 
 
288 aa  52.4  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000016272  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1131  hypothetical protein  25.58 
 
 
298 aa  52.4  0.000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2384  hypothetical protein  21.73 
 
 
314 aa  52  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000288219  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0615  hypothetical protein  25.67 
 
 
300 aa  51.6  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0948  hypothetical protein  25.57 
 
 
292 aa  50.8  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1947  hypothetical protein  25.42 
 
 
299 aa  50.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000247154  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0058  hypothetical protein  23.73 
 
 
315 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00639651  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0511  hypothetical protein  26.64 
 
 
309 aa  49.7  0.00005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00971553  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2497  hypothetical protein  26.34 
 
 
309 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0528  hypothetical protein  25.56 
 
 
311 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.261127  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0627  hypothetical protein  25.58 
 
 
298 aa  48.5  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.261327  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0006  hypothetical protein  25 
 
 
313 aa  48.5  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00155614  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0885  hypothetical protein  24 
 
 
313 aa  47.4  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3206  hypothetical protein  24.12 
 
 
284 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.488157  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0216  hypothetical protein  22.74 
 
 
312 aa  47  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000115501  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2698  hypothetical protein  23.61 
 
 
291 aa  46.6  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0655  hypothetical protein  22.85 
 
 
300 aa  46.2  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3230  hypothetical protein  25.81 
 
 
326 aa  46.6  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593282  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0294  hypothetical protein  23.77 
 
 
315 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3232  hypothetical protein  25.81 
 
 
382 aa  46.2  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2786  hypothetical protein  22.51 
 
 
340 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2135  hypothetical protein  25 
 
 
250 aa  45.4  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2196  hypothetical protein  25.27 
 
 
254 aa  45.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0539  hypothetical protein  24.57 
 
 
277 aa  45.1  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0397  hypothetical protein  24.17 
 
 
317 aa  45.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3231  hypothetical protein  25.81 
 
 
382 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1182  hypothetical protein  21.43 
 
 
304 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2607  hypothetical protein  25 
 
 
289 aa  43.9  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.989258  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1221  hypothetical protein  22.78 
 
 
292 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0766  hypothetical protein  25.1 
 
 
303 aa  43.5  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0996  hypothetical protein  24.42 
 
 
266 aa  43.5  0.004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2565  hypothetical protein  22.37 
 
 
313 aa  42.7  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136363  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0296  hypothetical protein  26.14 
 
 
303 aa  42.4  0.009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0337026  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2265  hypothetical protein  35.29 
 
 
129 aa  42.4  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.571234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>