108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2560 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2560  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  576  1.0000000000000001e-163  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0669  hypothetical protein  71.88 
 
 
292 aa  422  1e-117  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0007  hypothetical protein  74.64 
 
 
284 aa  420  1e-116  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0165  hypothetical protein  71.79 
 
 
284 aa  409  1e-113  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1344  hypothetical protein  71.18 
 
 
292 aa  409  1e-113  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2719  hypothetical protein  69.86 
 
 
296 aa  409  1e-113  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0862  hypothetical protein  70 
 
 
284 aa  398  9.999999999999999e-111  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2707  hypothetical protein  67.91 
 
 
300 aa  400  9.999999999999999e-111  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0403  hypothetical protein  59.64 
 
 
284 aa  345  5e-94  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000003324  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0049  hypothetical protein  56.85 
 
 
296 aa  343  2.9999999999999997e-93  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1691  hypothetical protein  58.45 
 
 
288 aa  339  2.9999999999999998e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1976  hypothetical protein  57.89 
 
 
287 aa  336  2.9999999999999997e-91  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0142  hypothetical protein  31.85 
 
 
298 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.836251  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1931  hypothetical protein  31.31 
 
 
308 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2429  hypothetical protein  31.72 
 
 
306 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.905832 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0294  hypothetical protein  31.92 
 
 
315 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0127  hypothetical protein  32.99 
 
 
303 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000393642 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4711  hypothetical protein  30.25 
 
 
293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0013874  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0058  hypothetical protein  29.62 
 
 
315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00639651  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1261  hypothetical protein  29.68 
 
 
290 aa  112  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0031  hypothetical protein  32.21 
 
 
307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3010  hypothetical protein  29.67 
 
 
326 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0413061  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0158  hypothetical protein  32.21 
 
 
307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.459825  hitchhiker  4.24073e-17 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4940  hypothetical protein  30.41 
 
 
327 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2145  hypothetical protein  29.27 
 
 
285 aa  109  4.0000000000000004e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.955694  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2384  hypothetical protein  30.22 
 
 
325 aa  109  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000252943  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2136  hypothetical protein  73.61 
 
 
89 aa  108  1e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4715  hypothetical protein  30.03 
 
 
331 aa  106  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0101  hypothetical protein  32.55 
 
 
298 aa  106  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5077  hypothetical protein  30.03 
 
 
325 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0257  hypothetical protein  31.97 
 
 
306 aa  104  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1941  hypothetical protein  31.71 
 
 
288 aa  102  7e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000016272  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4944  hypothetical protein  29.26 
 
 
319 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2698  hypothetical protein  28.42 
 
 
291 aa  97.4  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2696  hypothetical protein  26.07 
 
 
291 aa  97.1  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.216249 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1947  hypothetical protein  31.23 
 
 
299 aa  95.9  6e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000247154  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2413  hypothetical protein  25.53 
 
 
326 aa  92.8  5e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000810744  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1487  hypothetical protein  27.65 
 
 
302 aa  91.7  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0958  hypothetical protein  28.04 
 
 
285 aa  90.5  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1608  hypothetical protein  23.99 
 
 
306 aa  90.5  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1114  hypothetical protein  24 
 
 
310 aa  89.7  5e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2607  hypothetical protein  28.23 
 
 
289 aa  88.2  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.989258  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1178  hypothetical protein  24.34 
 
 
314 aa  87.8  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0627  hypothetical protein  28.37 
 
 
298 aa  87  3e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.261327  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1611  hypothetical protein  22.83 
 
 
318 aa  85.9  7e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.5466e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2384  hypothetical protein  26.89 
 
 
314 aa  84.7  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000288219  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1236  hypothetical protein  23.51 
 
 
311 aa  85.1  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00145215  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2695  hypothetical protein  26.64 
 
 
304 aa  83.2  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0536722 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0216  hypothetical protein  29.11 
 
 
312 aa  83.2  0.000000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000115501  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0397  hypothetical protein  25.58 
 
 
317 aa  82.8  0.000000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0511  hypothetical protein  29.05 
 
 
309 aa  81.6  0.00000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00971553  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0807  hypothetical protein  26.64 
 
 
298 aa  82  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.098381  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0300  hypothetical protein  23.69 
 
 
305 aa  80.9  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000400684  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1131  hypothetical protein  25.9 
 
 
298 aa  79.3  0.00000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2097  hypothetical protein  50 
 
 
87 aa  78.6  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.607253  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0296  hypothetical protein  28.28 
 
 
303 aa  77.4  0.0000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0337026  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0175  hypothetical protein  25.83 
 
 
256 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2694  hypothetical protein  27.64 
 
 
293 aa  77.4  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0885  hypothetical protein  25.32 
 
 
313 aa  77.4  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2432  hypothetical protein  27.37 
 
 
259 aa  76.6  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.870937 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0230  hypothetical protein  26.44 
 
 
290 aa  76.6  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00383338  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2565  hypothetical protein  25.65 
 
 
313 aa  74.3  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136363  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2294  hypothetical protein  25.45 
 
 
276 aa  73.2  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2583  hypothetical protein  26.67 
 
 
317 aa  72.4  0.000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.21441e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1240  hypothetical protein  25.08 
 
 
334 aa  70.1  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2497  hypothetical protein  29.81 
 
 
309 aa  68.9  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2444  hypothetical protein  24.58 
 
 
299 aa  68.9  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.445451  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2425  hypothetical protein  25.3 
 
 
276 aa  68.9  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0597  hypothetical protein  23.08 
 
 
330 aa  68.9  0.00000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.946017  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0820  hypothetical protein  25.69 
 
 
334 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2098  hypothetical protein  90.91 
 
 
44 aa  67.8  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0006  hypothetical protein  23.45 
 
 
313 aa  67.8  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00155614  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0599  hypothetical protein  24.32 
 
 
319 aa  65.9  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2771  hypothetical protein  25.26 
 
 
283 aa  64.3  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0596  hypothetical protein  24.32 
 
 
401 aa  64.7  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.320961  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0616  hypothetical protein  24.32 
 
 
384 aa  64.3  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.618084  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0886  transposase and inactivated derivative  28.11 
 
 
310 aa  62.4  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.615238  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4961  hypothetical protein  40.66 
 
 
101 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0598  hypothetical protein  25.26 
 
 
296 aa  62  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4555  hypothetical protein  26.64 
 
 
234 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.166025  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4573  hypothetical protein  27.11 
 
 
230 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0550  hypothetical protein  34.29 
 
 
109 aa  56.6  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.15726  normal  0.439248 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0766  hypothetical protein  26.62 
 
 
303 aa  57  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2419  hypothetical protein  26.9 
 
 
245 aa  55.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0749  hypothetical protein  24.55 
 
 
288 aa  53.9  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0898  hypothetical protein  25.53 
 
 
283 aa  53.9  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148019 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0615  hypothetical protein  23.91 
 
 
300 aa  53.1  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1032  hypothetical protein  22.92 
 
 
287 aa  53.1  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.15202  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2556  hypothetical protein  23.3 
 
 
281 aa  52.8  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1091  hypothetical protein  25.1 
 
 
322 aa  50.4  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0528026  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3057  hypothetical protein  20.64 
 
 
285 aa  50.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.139134 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1830  hypothetical protein  25 
 
 
290 aa  49.7  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00791791  hitchhiker  0.0000000000564838 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2474  hypothetical protein  23.32 
 
 
309 aa  49.7  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000139417  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3230  hypothetical protein  29.31 
 
 
326 aa  48.9  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593282  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0395  hypothetical protein  25.98 
 
 
246 aa  48.5  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3058  hypothetical protein  25.37 
 
 
289 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.669677  normal  0.19062 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2711  hypothetical protein  23.73 
 
 
299 aa  47.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0116861  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3232  hypothetical protein  29.31 
 
 
382 aa  47.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3231  hypothetical protein  29.31 
 
 
382 aa  47.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1070  hypothetical protein  31.63 
 
 
287 aa  46.6  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.950669 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>