152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1947 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1947  hypothetical protein  100 
 
 
299 aa  613  1e-175  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000247154  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1941  hypothetical protein  93.94 
 
 
288 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000016272  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4711  hypothetical protein  33.88 
 
 
293 aa  182  6e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0013874  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0294  hypothetical protein  34.21 
 
 
315 aa  170  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4940  hypothetical protein  33.23 
 
 
327 aa  169  7e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4715  hypothetical protein  32.51 
 
 
331 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1928  hypothetical protein  76.36 
 
 
111 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5077  hypothetical protein  32.51 
 
 
325 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2384  hypothetical protein  34.27 
 
 
325 aa  160  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000252943  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1931  hypothetical protein  33.89 
 
 
308 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0142  hypothetical protein  32.34 
 
 
298 aa  159  6e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.836251  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0058  hypothetical protein  32.89 
 
 
315 aa  159  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00639651  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4944  hypothetical protein  34.08 
 
 
319 aa  155  9e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2429  hypothetical protein  35.76 
 
 
306 aa  152  5e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.905832 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1261  hypothetical protein  31.23 
 
 
290 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0627  hypothetical protein  34.12 
 
 
298 aa  144  3e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.261327  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3010  hypothetical protein  31.48 
 
 
326 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0413061  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0257  hypothetical protein  32.13 
 
 
306 aa  139  6e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0127  hypothetical protein  31.46 
 
 
303 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000393642 
 
 
-
 
NC_002978  WD0511  hypothetical protein  32.13 
 
 
309 aa  132  9e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00971553  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0031  hypothetical protein  31.79 
 
 
307 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0158  hypothetical protein  31.79 
 
 
307 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.459825  hitchhiker  4.24073e-17 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1487  hypothetical protein  31.23 
 
 
302 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0101  hypothetical protein  32 
 
 
298 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2719  hypothetical protein  30 
 
 
296 aa  129  8.000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0397  hypothetical protein  32.56 
 
 
317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1236  hypothetical protein  31.33 
 
 
311 aa  125  7e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00145215  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2145  hypothetical protein  31.44 
 
 
285 aa  125  8.000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.955694  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1131  hypothetical protein  30.03 
 
 
298 aa  125  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0669  hypothetical protein  31.33 
 
 
292 aa  123  3e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2696  hypothetical protein  31.08 
 
 
291 aa  123  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.216249 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0006  hypothetical protein  31.35 
 
 
313 aa  123  4e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00155614  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0049  hypothetical protein  32.46 
 
 
296 aa  122  5e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0885  hypothetical protein  31.25 
 
 
313 aa  122  5e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2497  hypothetical protein  30.5 
 
 
309 aa  122  6e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0766  hypothetical protein  32.27 
 
 
303 aa  122  8e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0296  hypothetical protein  31.02 
 
 
303 aa  121  9.999999999999999e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0337026  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2565  hypothetical protein  30.38 
 
 
313 aa  122  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136363  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1611  hypothetical protein  30.96 
 
 
318 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.5466e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2583  hypothetical protein  28.88 
 
 
317 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.21441e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1178  hypothetical protein  31.25 
 
 
314 aa  120  3e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1091  hypothetical protein  33.59 
 
 
322 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0528026  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2432  hypothetical protein  30.82 
 
 
259 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.870937 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2384  hypothetical protein  29.39 
 
 
314 aa  118  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000288219  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1976  hypothetical protein  33.55 
 
 
287 aa  115  8.999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0807  hypothetical protein  30.56 
 
 
298 aa  115  8.999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.098381  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1114  hypothetical protein  30.38 
 
 
310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5306  hypothetical protein  25.99 
 
 
308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939469  normal  0.0565222 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0300  hypothetical protein  31.12 
 
 
305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000400684  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0958  hypothetical protein  31.06 
 
 
285 aa  114  3e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0175  hypothetical protein  30.21 
 
 
256 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0230  hypothetical protein  29.9 
 
 
290 aa  113  4.0000000000000004e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00383338  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2707  hypothetical protein  28.15 
 
 
300 aa  113  5e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2695  hypothetical protein  33.56 
 
 
304 aa  112  5e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0536722 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4573  hypothetical protein  33.19 
 
 
230 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1608  hypothetical protein  29.26 
 
 
306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3230  hypothetical protein  32.2 
 
 
326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593282  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3231  hypothetical protein  31.84 
 
 
382 aa  110  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3232  hypothetical protein  31.84 
 
 
382 aa  110  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0598  hypothetical protein  30.27 
 
 
296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4555  hypothetical protein  32.17 
 
 
234 aa  109  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.166025  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1344  hypothetical protein  28.28 
 
 
292 aa  107  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0403  hypothetical protein  31.42 
 
 
284 aa  107  3e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000003324  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0615  hypothetical protein  28.43 
 
 
300 aa  107  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2698  hypothetical protein  30.39 
 
 
291 aa  105  8e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0886  transposase and inactivated derivative  29.97 
 
 
310 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.615238  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0749  hypothetical protein  29.93 
 
 
288 aa  104  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0528  hypothetical protein  31.25 
 
 
311 aa  103  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.261127  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2413  hypothetical protein  29.7 
 
 
326 aa  103  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000810744  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0216  hypothetical protein  29.72 
 
 
312 aa  103  4e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000115501  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0898  hypothetical protein  29.69 
 
 
283 aa  103  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148019 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1691  hypothetical protein  31.92 
 
 
288 aa  101  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0165  hypothetical protein  27.18 
 
 
284 aa  100  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1737  hypothetical protein  29.84 
 
 
318 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0033036 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2607  hypothetical protein  28.43 
 
 
289 aa  99  8e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.989258  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0007  hypothetical protein  29.08 
 
 
284 aa  97.1  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2560  hypothetical protein  31.23 
 
 
282 aa  95.9  7e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2694  hypothetical protein  31.86 
 
 
293 aa  94.7  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0862  hypothetical protein  27.72 
 
 
284 aa  94  3e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0996  hypothetical protein  34.08 
 
 
266 aa  92  1e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2425  hypothetical protein  31.8 
 
 
276 aa  91.3  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1137  hypothetical protein  33.33 
 
 
256 aa  88.6  1e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1240  hypothetical protein  26.65 
 
 
334 aa  87.4  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2419  hypothetical protein  31.19 
 
 
245 aa  81.6  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1763  hypothetical protein  28.43 
 
 
300 aa  78.6  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0148846 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0597  hypothetical protein  26.46 
 
 
330 aa  78.6  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.946017  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1534  hypothetical protein  30.57 
 
 
233 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0539  hypothetical protein  31.49 
 
 
277 aa  77.4  0.0000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1070  hypothetical protein  26.33 
 
 
287 aa  77.4  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1830  hypothetical protein  26.94 
 
 
290 aa  76.3  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00791791  hitchhiker  0.0000000000564838 
 
 
-
 
NC_002978  WD0395  hypothetical protein  31.65 
 
 
246 aa  74.7  0.000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4962  hypothetical protein  31.55 
 
 
192 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0550  hypothetical protein  38.1 
 
 
109 aa  73.6  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.15726  normal  0.439248 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2444  hypothetical protein  26.4 
 
 
299 aa  71.6  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.445451  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2771  hypothetical protein  26.01 
 
 
283 aa  71.2  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4961  hypothetical protein  36.26 
 
 
101 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1937  hypothetical protein  81.58 
 
 
83 aa  70.5  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.869802  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1032  hypothetical protein  25.93 
 
 
287 aa  69.7  0.00000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.15202  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28300  hypothetical protein  27.64 
 
 
365 aa  69.3  0.00000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.197043 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0820  hypothetical protein  25.76 
 
 
334 aa  67  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>