90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2711 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2711  hypothetical protein  100 
 
 
299 aa  607  1e-173  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0116861  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1032  hypothetical protein  85.95 
 
 
287 aa  511  1e-144  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.15202  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2771  hypothetical protein  84.62 
 
 
283 aa  506  9.999999999999999e-143  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2556  hypothetical protein  67.59 
 
 
281 aa  403  1e-111  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2707  hypothetical protein  28.24 
 
 
300 aa  89  9e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1344  hypothetical protein  27.72 
 
 
292 aa  88.2  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1976  hypothetical protein  27.15 
 
 
287 aa  82.8  0.000000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2384  hypothetical protein  28.44 
 
 
325 aa  82.4  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000252943  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0007  hypothetical protein  27 
 
 
284 aa  78.6  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1691  hypothetical protein  27 
 
 
288 aa  73.9  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2719  hypothetical protein  25.66 
 
 
296 aa  73.6  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0403  hypothetical protein  25.57 
 
 
284 aa  72.8  0.000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000003324  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0615  hypothetical protein  27.42 
 
 
300 aa  73.2  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0862  hypothetical protein  26.44 
 
 
284 aa  69.7  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0669  hypothetical protein  24.33 
 
 
292 aa  68.6  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3010  hypothetical protein  26.92 
 
 
326 aa  68.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0413061  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0049  hypothetical protein  25.49 
 
 
296 aa  67.4  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0885  hypothetical protein  25.87 
 
 
313 aa  66.2  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1931  hypothetical protein  24.92 
 
 
308 aa  66.2  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1487  hypothetical protein  25.4 
 
 
302 aa  63.2  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1947  hypothetical protein  24.92 
 
 
299 aa  63.2  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000247154  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3230  hypothetical protein  30.11 
 
 
326 aa  62  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593282  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0598  hypothetical protein  26.13 
 
 
296 aa  62  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0006  hypothetical protein  25.89 
 
 
313 aa  61.2  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00155614  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2384  hypothetical protein  23.62 
 
 
314 aa  61.2  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000288219  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3232  hypothetical protein  30.11 
 
 
382 aa  60.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0294  hypothetical protein  22.86 
 
 
315 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3231  hypothetical protein  29.37 
 
 
382 aa  59.7  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0511  hypothetical protein  27.97 
 
 
309 aa  59.3  0.00000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00971553  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1240  hypothetical protein  23.62 
 
 
334 aa  57  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2097  hypothetical protein  56.25 
 
 
87 aa  56.2  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.607253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4940  hypothetical protein  22.84 
 
 
327 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0165  hypothetical protein  23.73 
 
 
284 aa  55.5  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4711  hypothetical protein  25.25 
 
 
293 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0013874  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4715  hypothetical protein  22.26 
 
 
331 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1904  hypothetical protein  57.14 
 
 
138 aa  54.7  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0807  hypothetical protein  23.25 
 
 
298 aa  54.3  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.098381  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0257  hypothetical protein  26.82 
 
 
306 aa  54.7  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1941  hypothetical protein  23.55 
 
 
288 aa  53.9  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000016272  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5077  hypothetical protein  22.15 
 
 
325 aa  52.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1131  hypothetical protein  24.68 
 
 
298 aa  52  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0975  hypothetical protein  45 
 
 
292 aa  52  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000468925  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3368  hypothetical protein  25.62 
 
 
297 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1182  hypothetical protein  21.11 
 
 
304 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0627  hypothetical protein  25.83 
 
 
298 aa  50.1  0.00004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.261327  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0886  transposase and inactivated derivative  24.38 
 
 
310 aa  50.1  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.615238  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0948  hypothetical protein  40 
 
 
292 aa  50.1  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4944  hypothetical protein  23.34 
 
 
319 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2145  hypothetical protein  22.51 
 
 
285 aa  49.3  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.955694  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2565  hypothetical protein  21.34 
 
 
313 aa  48.9  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136363  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0216  hypothetical protein  23.48 
 
 
312 aa  48.9  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000115501  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1261  hypothetical protein  24.73 
 
 
290 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2786  hypothetical protein  21.77 
 
 
340 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2607  hypothetical protein  22.93 
 
 
289 aa  47.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.989258  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1737  hypothetical protein  26.1 
 
 
318 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0033036 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4573  hypothetical protein  27.41 
 
 
230 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0058  hypothetical protein  25 
 
 
315 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00639651  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1236  hypothetical protein  23.15 
 
 
311 aa  47.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00145215  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2560  hypothetical protein  23.73 
 
 
282 aa  47.4  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0749  hypothetical protein  26.06 
 
 
288 aa  47  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4962  hypothetical protein  27.01 
 
 
192 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1091  hypothetical protein  24.17 
 
 
322 aa  46.6  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0528026  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0397  hypothetical protein  23.47 
 
 
317 aa  46.2  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3206  hypothetical protein  22.1 
 
 
284 aa  46.2  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.488157  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2583  hypothetical protein  21.7 
 
 
317 aa  46.6  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.21441e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0655  hypothetical protein  21.8 
 
 
300 aa  45.8  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4072  putative transposase  31.18 
 
 
340 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0596  hypothetical protein  24.48 
 
 
401 aa  45.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.320961  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0528  hypothetical protein  37.63 
 
 
311 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.261127  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0142  hypothetical protein  23.1 
 
 
298 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.836251  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4028  putative transposase  31.18 
 
 
340 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0684  hypothetical protein  43.08 
 
 
303 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.92177 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1611  hypothetical protein  43.48 
 
 
318 aa  45.8  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.5466e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0361  hypothetical protein  34.15 
 
 
294 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.926631  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0354  hypothetical protein  34.15 
 
 
294 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4981  hypothetical protein  28.36 
 
 
160 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1608  hypothetical protein  40.62 
 
 
306 aa  44.3  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0230  hypothetical protein  24.59 
 
 
290 aa  45.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00383338  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4555  hypothetical protein  25.71 
 
 
234 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.166025  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0658  putative transposase  38.33 
 
 
332 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000193277 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1938  hypothetical protein  26.81 
 
 
288 aa  44.3  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4851  hypothetical protein  35 
 
 
321 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4924  hypothetical protein  33.75 
 
 
170 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.414279  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0300  hypothetical protein  23.53 
 
 
305 aa  43.5  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000400684  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2696  hypothetical protein  32.41 
 
 
291 aa  43.1  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.216249 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1707  hypothetical protein  35.71 
 
 
280 aa  43.1  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.420351  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3455  hypothetical protein  44.64 
 
 
283 aa  43.1  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0766  hypothetical protein  25.9 
 
 
303 aa  43.1  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4874  hypothetical protein  33.75 
 
 
317 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.702519 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1906  hypothetical protein  42.86 
 
 
254 aa  42.7  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>