121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0165 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0165  hypothetical protein  100 
 
 
284 aa  583  1e-166  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2719  hypothetical protein  82.77 
 
 
296 aa  501  1e-141  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0007  hypothetical protein  83.45 
 
 
284 aa  492  9.999999999999999e-139  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0862  hypothetical protein  83.8 
 
 
284 aa  491  9.999999999999999e-139  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1344  hypothetical protein  81.16 
 
 
292 aa  480  1e-135  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2707  hypothetical protein  79.67 
 
 
300 aa  482  1e-135  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0669  hypothetical protein  79.45 
 
 
292 aa  478  1e-134  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2560  hypothetical protein  71.79 
 
 
282 aa  409  1e-113  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0403  hypothetical protein  63.03 
 
 
284 aa  372  1e-102  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000003324  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1976  hypothetical protein  61.11 
 
 
287 aa  365  1e-100  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0049  hypothetical protein  58.11 
 
 
296 aa  355  3.9999999999999996e-97  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1691  hypothetical protein  60.07 
 
 
288 aa  355  3.9999999999999996e-97  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1931  hypothetical protein  31.99 
 
 
308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2145  hypothetical protein  31.85 
 
 
285 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.955694  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4711  hypothetical protein  30.99 
 
 
293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0013874  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2384  hypothetical protein  31.78 
 
 
325 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000252943  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0058  hypothetical protein  28.72 
 
 
315 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00639651  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3010  hypothetical protein  30.8 
 
 
326 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0413061  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0142  hypothetical protein  28.81 
 
 
298 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.836251  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0807  hypothetical protein  29.07 
 
 
298 aa  118  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.098381  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1608  hypothetical protein  27.67 
 
 
306 aa  118  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1487  hypothetical protein  28.91 
 
 
302 aa  115  6e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2097  hypothetical protein  65.12 
 
 
87 aa  114  2.0000000000000002e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.607253  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2698  hypothetical protein  30.03 
 
 
291 aa  113  4.0000000000000004e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2384  hypothetical protein  28.1 
 
 
314 aa  112  7.000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000288219  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0127  hypothetical protein  31.01 
 
 
303 aa  112  9e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000393642 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2136  hypothetical protein  75 
 
 
89 aa  111  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2607  hypothetical protein  31.44 
 
 
289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.989258  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0294  hypothetical protein  27.27 
 
 
315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4940  hypothetical protein  27.1 
 
 
327 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0958  hypothetical protein  30.18 
 
 
285 aa  109  6e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0216  hypothetical protein  30.91 
 
 
312 aa  109  6e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000115501  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2429  hypothetical protein  29.9 
 
 
306 aa  108  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.905832 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0257  hypothetical protein  31.66 
 
 
306 aa  108  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1941  hypothetical protein  27.97 
 
 
288 aa  108  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000016272  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1611  hypothetical protein  25.72 
 
 
318 aa  107  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.5466e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1261  hypothetical protein  27.66 
 
 
290 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0397  hypothetical protein  26.94 
 
 
317 aa  107  3e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0300  hypothetical protein  27.46 
 
 
305 aa  105  6e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000400684  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0230  hypothetical protein  28.81 
 
 
290 aa  105  8e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00383338  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4715  hypothetical protein  29.55 
 
 
331 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1178  hypothetical protein  25.97 
 
 
314 aa  105  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5077  hypothetical protein  29.55 
 
 
325 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1236  hypothetical protein  26 
 
 
311 aa  104  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00145215  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2413  hypothetical protein  27.11 
 
 
326 aa  103  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000810744  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0158  hypothetical protein  31.38 
 
 
307 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.459825  hitchhiker  4.24073e-17 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1131  hypothetical protein  29.04 
 
 
298 aa  103  4e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1114  hypothetical protein  26.97 
 
 
310 aa  102  6e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0031  hypothetical protein  31.03 
 
 
307 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1947  hypothetical protein  27.18 
 
 
299 aa  100  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000247154  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2696  hypothetical protein  28.72 
 
 
291 aa  99.8  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.216249 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4944  hypothetical protein  26.13 
 
 
319 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0101  hypothetical protein  29.31 
 
 
298 aa  93.6  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2565  hypothetical protein  27.69 
 
 
313 aa  90.5  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136363  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0175  hypothetical protein  26 
 
 
256 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0006  hypothetical protein  26.03 
 
 
313 aa  88.2  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00155614  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2583  hypothetical protein  25.32 
 
 
317 aa  84.7  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.21441e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0885  hypothetical protein  26.37 
 
 
313 aa  82.4  0.000000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0627  hypothetical protein  26.3 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.261327  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0511  hypothetical protein  25.17 
 
 
309 aa  79.3  0.00000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00971553  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0886  transposase and inactivated derivative  30.1 
 
 
310 aa  78.6  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.615238  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2695  hypothetical protein  26.39 
 
 
304 aa  77.4  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0536722 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1240  hypothetical protein  23.87 
 
 
334 aa  75.9  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2694  hypothetical protein  27.56 
 
 
293 aa  76.3  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2098  hypothetical protein  94.59 
 
 
44 aa  75.5  0.0000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0948  hypothetical protein  47.06 
 
 
292 aa  74.7  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2425  hypothetical protein  25 
 
 
276 aa  74.3  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1032  hypothetical protein  25.7 
 
 
287 aa  73.2  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.15202  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0598  hypothetical protein  25.94 
 
 
296 aa  72.8  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0296  hypothetical protein  25.58 
 
 
303 aa  72.4  0.000000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0337026  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0749  hypothetical protein  25.09 
 
 
288 aa  71.6  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2436  hypothetical protein  26.19 
 
 
254 aa  68.6  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2771  hypothetical protein  24.38 
 
 
283 aa  68.6  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2497  hypothetical protein  25.93 
 
 
309 aa  68.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2444  hypothetical protein  23.47 
 
 
299 aa  68.2  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.445451  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0615  hypothetical protein  24.92 
 
 
300 aa  67.4  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0820  hypothetical protein  26.48 
 
 
334 aa  67  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2432  hypothetical protein  26.88 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.870937 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2294  hypothetical protein  24.38 
 
 
276 aa  63.5  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0597  hypothetical protein  24.3 
 
 
330 aa  62.4  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.946017  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0599  hypothetical protein  24.3 
 
 
319 aa  61.2  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4961  hypothetical protein  38.46 
 
 
101 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1906  hypothetical protein  23.79 
 
 
254 aa  60.5  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0596  hypothetical protein  23.9 
 
 
401 aa  59.7  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.320961  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0616  hypothetical protein  23.9 
 
 
384 aa  59.7  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.618084  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2419  hypothetical protein  25.44 
 
 
245 aa  59.3  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4555  hypothetical protein  22.94 
 
 
234 aa  58.9  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.166025  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0550  hypothetical protein  33.33 
 
 
109 aa  58.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.15726  normal  0.439248 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4573  hypothetical protein  23.79 
 
 
230 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2556  hypothetical protein  25.36 
 
 
281 aa  57.4  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0766  hypothetical protein  24.18 
 
 
303 aa  56.6  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2711  hypothetical protein  23.73 
 
 
299 aa  55.5  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0116861  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1091  hypothetical protein  23.22 
 
 
322 aa  55.5  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0528026  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1891  hypothetical protein  22.76 
 
 
254 aa  53.9  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000150124  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2196  hypothetical protein  22.03 
 
 
254 aa  53.1  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1737  hypothetical protein  22.45 
 
 
318 aa  52.8  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0033036 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2135  hypothetical protein  23.78 
 
 
250 aa  52  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0898  hypothetical protein  23.21 
 
 
283 aa  52  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148019 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1763  hypothetical protein  24.03 
 
 
300 aa  52  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0148846 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3230  hypothetical protein  27.59 
 
 
326 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593282  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>