79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1763 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1763  hypothetical protein  100 
 
 
300 aa  619  1e-176  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0148846 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1737  hypothetical protein  87.34 
 
 
318 aa  556  1e-157  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0033036 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1070  hypothetical protein  70.46 
 
 
287 aa  416  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0885  hypothetical protein  70.93 
 
 
183 aa  246  4e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00688729 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0886  transposase and inactivated derivative  42.4 
 
 
310 aa  241  7.999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.615238  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0898  hypothetical protein  41.9 
 
 
283 aa  210  3e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148019 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5306  hypothetical protein  38.16 
 
 
308 aa  205  6e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939469  normal  0.0565222 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1830  hypothetical protein  35.81 
 
 
290 aa  175  7e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00791791  hitchhiker  0.0000000000564838 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0749  hypothetical protein  35.17 
 
 
288 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0598  hypothetical protein  37.97 
 
 
296 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0615  hypothetical protein  37.55 
 
 
300 aa  159  4e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1091  hypothetical protein  37.75 
 
 
322 aa  158  1e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0528026  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1534  hypothetical protein  35.47 
 
 
233 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0627  hypothetical protein  32.44 
 
 
298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.261327  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0296  hypothetical protein  29.64 
 
 
303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0337026  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0511  hypothetical protein  29.26 
 
 
309 aa  101  2e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00971553  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2497  hypothetical protein  25.26 
 
 
309 aa  90.5  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3057  hypothetical protein  27.76 
 
 
285 aa  89.4  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.139134 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3058  hypothetical protein  27.5 
 
 
289 aa  86.7  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.669677  normal  0.19062 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1941  hypothetical protein  28.52 
 
 
288 aa  86.3  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000016272  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1947  hypothetical protein  28.43 
 
 
299 aa  78.6  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000247154  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0766  hypothetical protein  25.34 
 
 
303 aa  76.3  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4711  hypothetical protein  28.17 
 
 
293 aa  70.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0013874  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3230  hypothetical protein  26.88 
 
 
326 aa  66.6  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593282  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0226  hypothetical protein  41.98 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3232  hypothetical protein  26.88 
 
 
382 aa  64.7  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3231  hypothetical protein  26.88 
 
 
382 aa  64.3  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0691  hypothetical protein  38.27 
 
 
147 aa  62.8  0.000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0223479  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0528  hypothetical protein  25.34 
 
 
311 aa  60.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.261127  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0694  hypothetical protein  28.64 
 
 
242 aa  59.7  0.00000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0550  hypothetical protein  34.29 
 
 
109 aa  59.7  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.15726  normal  0.439248 
 
 
-
 
NC_002978  WD0398  hypothetical protein  35.8 
 
 
147 aa  58.5  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0993  hypothetical protein  35.8 
 
 
147 aa  58.5  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3010  hypothetical protein  24.2 
 
 
326 aa  57  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0413061  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0257  hypothetical protein  22.81 
 
 
306 aa  57  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0536  hypothetical protein  37.04 
 
 
147 aa  56.6  0.0000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.392908  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0127  hypothetical protein  31.43 
 
 
303 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000393642 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0158  hypothetical protein  31.43 
 
 
307 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.459825  hitchhiker  4.24073e-17 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0031  hypothetical protein  31.43 
 
 
307 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1931  hypothetical protein  26.58 
 
 
308 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0294  hypothetical protein  27.05 
 
 
315 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2384  hypothetical protein  32.28 
 
 
325 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000252943  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1140  hypothetical protein  34.57 
 
 
147 aa  54.3  0.000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2719  hypothetical protein  23.99 
 
 
296 aa  54.7  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0142  hypothetical protein  25.81 
 
 
298 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.836251  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4944  hypothetical protein  27.05 
 
 
319 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1131  hypothetical protein  23.15 
 
 
298 aa  53.5  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1261  hypothetical protein  24.05 
 
 
290 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0101  hypothetical protein  32.32 
 
 
298 aa  53.1  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0058  hypothetical protein  26.23 
 
 
315 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00639651  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4940  hypothetical protein  27.05 
 
 
327 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0165  hypothetical protein  24.03 
 
 
284 aa  52  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0395  hypothetical protein  28.02 
 
 
246 aa  52  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0403  hypothetical protein  23.05 
 
 
284 aa  51.2  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000003324  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2145  hypothetical protein  25.48 
 
 
285 aa  50.8  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.955694  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0807  hypothetical protein  24.92 
 
 
298 aa  50.4  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.098381  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0862  hypothetical protein  22.22 
 
 
284 aa  49.7  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1976  hypothetical protein  23.39 
 
 
287 aa  49.3  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2607  hypothetical protein  24.76 
 
 
289 aa  49.3  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.989258  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1487  hypothetical protein  23.49 
 
 
302 aa  48.9  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4715  hypothetical protein  26.23 
 
 
331 aa  49.3  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5077  hypothetical protein  28.57 
 
 
325 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0551  hypothetical protein  32.61 
 
 
166 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298634  normal  0.46051 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0007  hypothetical protein  23.43 
 
 
284 aa  48.1  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0230  hypothetical protein  23.67 
 
 
290 aa  48.1  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00383338  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2707  hypothetical protein  31.96 
 
 
300 aa  47.8  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0996  hypothetical protein  27.06 
 
 
266 aa  47  0.0004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1344  hypothetical protein  21.6 
 
 
292 aa  47  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0006  hypothetical protein  22.6 
 
 
313 aa  46.2  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00155614  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4961  hypothetical protein  26.6 
 
 
101 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2425  hypothetical protein  29.6 
 
 
276 aa  45.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2698  hypothetical protein  26.09 
 
 
291 aa  45.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0049  hypothetical protein  20.62 
 
 
296 aa  44.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2560  hypothetical protein  30.93 
 
 
282 aa  44.3  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0300  hypothetical protein  23.7 
 
 
305 aa  43.5  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000400684  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1137  hypothetical protein  22.71 
 
 
256 aa  43.1  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24430  hypothetical protein  27.78 
 
 
323 aa  43.1  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3043  hypothetical protein  31.07 
 
 
187 aa  42.7  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.190501  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2384  hypothetical protein  24.01 
 
 
314 aa  42.7  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000288219  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>