124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0615 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0615  hypothetical protein  100 
 
 
300 aa  612  9.999999999999999e-175  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0598  hypothetical protein  96.33 
 
 
296 aa  584  1e-166  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0749  hypothetical protein  83 
 
 
288 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1091  hypothetical protein  69.82 
 
 
322 aa  419  1e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0528026  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1534  hypothetical protein  60.76 
 
 
233 aa  285  8e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5306  hypothetical protein  41.72 
 
 
308 aa  224  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939469  normal  0.0565222 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1830  hypothetical protein  39.87 
 
 
290 aa  194  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00791791  hitchhiker  0.0000000000564838 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1737  hypothetical protein  35.35 
 
 
318 aa  181  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0033036 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0898  hypothetical protein  35 
 
 
283 aa  176  4e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148019 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1763  hypothetical protein  37.55 
 
 
300 aa  159  4e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0148846 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0886  transposase and inactivated derivative  33 
 
 
310 aa  159  5e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.615238  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1070  hypothetical protein  31.65 
 
 
287 aa  153  4e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_002978  WD0511  hypothetical protein  29.29 
 
 
309 aa  120  3e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00971553  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0627  hypothetical protein  30.56 
 
 
298 aa  120  3e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.261327  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0296  hypothetical protein  29.67 
 
 
303 aa  108  1e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0337026  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1947  hypothetical protein  28.43 
 
 
299 aa  107  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000247154  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3043  hypothetical protein  46.43 
 
 
187 aa  104  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.190501  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3231  hypothetical protein  28 
 
 
382 aa  102  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3232  hypothetical protein  28 
 
 
382 aa  102  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3230  hypothetical protein  29.06 
 
 
326 aa  101  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593282  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1941  hypothetical protein  29.19 
 
 
288 aa  100  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000016272  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1131  hypothetical protein  27.24 
 
 
298 aa  99.8  5e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4711  hypothetical protein  28.23 
 
 
293 aa  93.2  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0013874  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4940  hypothetical protein  25.86 
 
 
327 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0397  hypothetical protein  24.28 
 
 
317 aa  89.7  6e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0230  hypothetical protein  25.72 
 
 
290 aa  89  9e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00383338  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3010  hypothetical protein  26.24 
 
 
326 aa  88.6  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0413061  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0294  hypothetical protein  26.37 
 
 
315 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4715  hypothetical protein  24.31 
 
 
331 aa  86.7  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0885  hypothetical protein  30.32 
 
 
183 aa  86.7  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00688729 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5077  hypothetical protein  24.46 
 
 
325 aa  85.9  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3057  hypothetical protein  31.16 
 
 
285 aa  85.9  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.139134 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4944  hypothetical protein  25.4 
 
 
319 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2384  hypothetical protein  26.06 
 
 
325 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000252943  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1931  hypothetical protein  28.57 
 
 
308 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0528  hypothetical protein  27.95 
 
 
311 aa  82.4  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.261127  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1236  hypothetical protein  22.3 
 
 
311 aa  80.9  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00145215  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1178  hypothetical protein  23.72 
 
 
314 aa  80.5  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3058  hypothetical protein  30.15 
 
 
289 aa  79.7  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.669677  normal  0.19062 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1487  hypothetical protein  24.18 
 
 
302 aa  80.1  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2384  hypothetical protein  23.55 
 
 
314 aa  79.3  0.00000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000288219  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2145  hypothetical protein  24.33 
 
 
285 aa  78.2  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.955694  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1608  hypothetical protein  24.03 
 
 
306 aa  76.6  0.0000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0049  hypothetical protein  22.82 
 
 
296 aa  75.9  0.0000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2497  hypothetical protein  23.11 
 
 
309 aa  75.9  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2719  hypothetical protein  25.25 
 
 
296 aa  75.5  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0142  hypothetical protein  24.1 
 
 
298 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.836251  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0300  hypothetical protein  22.85 
 
 
305 aa  74.7  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000400684  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1114  hypothetical protein  24.35 
 
 
310 aa  74.7  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1611  hypothetical protein  21.5 
 
 
318 aa  73.9  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.5466e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2583  hypothetical protein  20.74 
 
 
317 aa  73.6  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.21441e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0006  hypothetical protein  25.08 
 
 
313 aa  73.2  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00155614  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2711  hypothetical protein  27.42 
 
 
299 aa  73.2  0.000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0116861  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2771  hypothetical protein  25.5 
 
 
283 aa  71.6  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2413  hypothetical protein  22.92 
 
 
326 aa  71.6  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000810744  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2565  hypothetical protein  20.45 
 
 
313 aa  71.2  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136363  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2707  hypothetical protein  23.83 
 
 
300 aa  70.5  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0807  hypothetical protein  23.86 
 
 
298 aa  70.1  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.098381  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0766  hypothetical protein  28.57 
 
 
303 aa  69.7  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0257  hypothetical protein  26.82 
 
 
306 aa  69.7  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0597  hypothetical protein  23.51 
 
 
330 aa  69.3  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.946017  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0885  hypothetical protein  21.73 
 
 
313 aa  68.6  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0539  hypothetical protein  28.63 
 
 
277 aa  68.6  0.0000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0165  hypothetical protein  24.92 
 
 
284 aa  67.4  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1344  hypothetical protein  26.26 
 
 
292 aa  68.2  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0403  hypothetical protein  24.83 
 
 
284 aa  67  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000003324  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0669  hypothetical protein  23 
 
 
292 aa  67.4  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2698  hypothetical protein  24.43 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0996  hypothetical protein  27.48 
 
 
266 aa  67  0.0000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2444  hypothetical protein  25.41 
 
 
299 aa  67  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.445451  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1137  hypothetical protein  27.31 
 
 
256 aa  65.9  0.0000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0958  hypothetical protein  24.16 
 
 
285 aa  65.1  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1691  hypothetical protein  23.05 
 
 
288 aa  64.7  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1976  hypothetical protein  22.64 
 
 
287 aa  64.3  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1240  hypothetical protein  23.62 
 
 
334 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1032  hypothetical protein  26.05 
 
 
287 aa  63.2  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.15202  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4555  hypothetical protein  24.56 
 
 
234 aa  62.4  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.166025  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0127  hypothetical protein  24.23 
 
 
303 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000393642 
 
 
-
 
NC_002978  WD0395  hypothetical protein  27.68 
 
 
246 aa  62  0.00000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0031  hypothetical protein  24.23 
 
 
307 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0158  hypothetical protein  24.23 
 
 
307 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.459825  hitchhiker  4.24073e-17 
 
 
-
 
NC_002978  WD0398  hypothetical protein  36.59 
 
 
147 aa  61.2  0.00000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0536  hypothetical protein  39.02 
 
 
147 aa  60.8  0.00000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.392908  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0058  hypothetical protein  23.93 
 
 
315 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00639651  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1261  hypothetical protein  23.23 
 
 
290 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0993  hypothetical protein  35.37 
 
 
147 aa  59.7  0.00000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1140  hypothetical protein  35.37 
 
 
147 aa  58.5  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0862  hypothetical protein  24.58 
 
 
284 aa  58.2  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0101  hypothetical protein  26.26 
 
 
298 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4573  hypothetical protein  24.34 
 
 
230 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0820  hypothetical protein  21.96 
 
 
334 aa  55.5  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2429  hypothetical protein  23.51 
 
 
306 aa  55.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.905832 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0550  hypothetical protein  34.82 
 
 
109 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.15726  normal  0.439248 
 
 
-
 
NC_002978  WD0691  hypothetical protein  30.49 
 
 
147 aa  53.9  0.000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0223479  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0596  hypothetical protein  23.21 
 
 
401 aa  53.5  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.320961  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2560  hypothetical protein  23.91 
 
 
282 aa  53.1  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0226  hypothetical protein  31.71 
 
 
147 aa  53.5  0.000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2556  hypothetical protein  25.67 
 
 
281 aa  51.6  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0694  hypothetical protein  24.11 
 
 
242 aa  50.8  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0599  hypothetical protein  23.88 
 
 
319 aa  51.6  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>