29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0885 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0885  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  375  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00688729 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1070  hypothetical protein  89.41 
 
 
287 aa  316  1e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1737  hypothetical protein  65.26 
 
 
318 aa  248  3e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0033036 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1763  hypothetical protein  70.93 
 
 
300 aa  246  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0148846 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0886  transposase and inactivated derivative  39.77 
 
 
310 aa  125  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.615238  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5306  hypothetical protein  35.03 
 
 
308 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939469  normal  0.0565222 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0898  hypothetical protein  39.23 
 
 
283 aa  106  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148019 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0749  hypothetical protein  34.66 
 
 
288 aa  95.5  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1830  hypothetical protein  37.28 
 
 
290 aa  92  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00791791  hitchhiker  0.0000000000564838 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0598  hypothetical protein  31.52 
 
 
296 aa  90.9  8e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0615  hypothetical protein  30.32 
 
 
300 aa  86.7  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1091  hypothetical protein  43.24 
 
 
322 aa  86.3  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0528026  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1534  hypothetical protein  39.44 
 
 
233 aa  85.9  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0694  hypothetical protein  28.64 
 
 
242 aa  59.3  0.00000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0395  hypothetical protein  29.17 
 
 
246 aa  55.1  0.0000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0996  hypothetical protein  29.61 
 
 
266 aa  51.2  0.000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0627  hypothetical protein  27.14 
 
 
298 aa  50.4  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.261327  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0551  hypothetical protein  28.18 
 
 
166 aa  48.9  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298634  normal  0.46051 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1941  hypothetical protein  29.7 
 
 
288 aa  47.8  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000016272  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3043  hypothetical protein  30 
 
 
187 aa  46.6  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.190501  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3057  hypothetical protein  23.98 
 
 
285 aa  45.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.139134 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2497  hypothetical protein  28.57 
 
 
309 aa  44.7  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1137  hypothetical protein  27.6 
 
 
256 aa  44.3  0.0009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0296  hypothetical protein  25.81 
 
 
303 aa  43.9  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0337026  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0539  hypothetical protein  25.93 
 
 
277 aa  43.1  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0042  hypothetical protein  46.81 
 
 
136 aa  43.5  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4711  hypothetical protein  24.4 
 
 
293 aa  42.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0013874  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3058  hypothetical protein  22.58 
 
 
289 aa  42.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.669677  normal  0.19062 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1947  hypothetical protein  27.93 
 
 
299 aa  41.6  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000247154  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>