91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0886 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0886  transposase and inactivated derivative  100 
 
 
310 aa  639    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.615238  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1070  hypothetical protein  43.82 
 
 
287 aa  248  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1737  hypothetical protein  41.69 
 
 
318 aa  246  3e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0033036 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1763  hypothetical protein  42.4 
 
 
300 aa  241  9e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0148846 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5306  hypothetical protein  36.6 
 
 
308 aa  187  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939469  normal  0.0565222 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0898  hypothetical protein  38.52 
 
 
283 aa  186  5e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148019 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0749  hypothetical protein  35.09 
 
 
288 aa  172  5e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1091  hypothetical protein  38.22 
 
 
322 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0528026  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0598  hypothetical protein  33.11 
 
 
296 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0615  hypothetical protein  33 
 
 
300 aa  159  6e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1830  hypothetical protein  30.99 
 
 
290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00791791  hitchhiker  0.0000000000564838 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0885  hypothetical protein  39.77 
 
 
183 aa  125  7e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00688729 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1534  hypothetical protein  31.06 
 
 
233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1947  hypothetical protein  29.97 
 
 
299 aa  105  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000247154  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1941  hypothetical protein  30.58 
 
 
288 aa  105  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000016272  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0296  hypothetical protein  33.15 
 
 
303 aa  104  2e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0337026  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0627  hypothetical protein  29 
 
 
298 aa  104  2e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.261327  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0511  hypothetical protein  32.6 
 
 
309 aa  93.6  3e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00971553  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2497  hypothetical protein  25.69 
 
 
309 aa  88.6  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3057  hypothetical protein  29.07 
 
 
285 aa  87.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.139134 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2145  hypothetical protein  27.15 
 
 
285 aa  83.2  0.000000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.955694  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4711  hypothetical protein  25.26 
 
 
293 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0013874  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3010  hypothetical protein  24.73 
 
 
326 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0413061  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3058  hypothetical protein  27.75 
 
 
289 aa  79.7  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.669677  normal  0.19062 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0165  hypothetical protein  30.1 
 
 
284 aa  78.6  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0807  hypothetical protein  29.18 
 
 
298 aa  75.5  0.0000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.098381  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1487  hypothetical protein  27.24 
 
 
302 aa  75.5  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0257  hypothetical protein  26.35 
 
 
306 aa  74.7  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2719  hypothetical protein  26.78 
 
 
296 aa  73.2  0.000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0766  hypothetical protein  25.5 
 
 
303 aa  72  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1344  hypothetical protein  25.35 
 
 
292 aa  72  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0862  hypothetical protein  26.83 
 
 
284 aa  70.9  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2698  hypothetical protein  25.5 
 
 
291 aa  70.1  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0403  hypothetical protein  26.46 
 
 
284 aa  69.7  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000003324  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0691  hypothetical protein  41.56 
 
 
147 aa  68.6  0.0000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0223479  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2384  hypothetical protein  27.3 
 
 
314 aa  67.4  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000288219  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2707  hypothetical protein  25 
 
 
300 aa  66.6  0.0000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0049  hypothetical protein  23.67 
 
 
296 aa  66.2  0.0000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0007  hypothetical protein  26.3 
 
 
284 aa  65.9  0.0000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0669  hypothetical protein  26.46 
 
 
292 aa  65.5  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3230  hypothetical protein  25.69 
 
 
326 aa  64.3  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593282  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0528  hypothetical protein  25.83 
 
 
311 aa  63.2  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.261127  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0226  hypothetical protein  40.26 
 
 
147 aa  62.4  0.000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3232  hypothetical protein  25.69 
 
 
382 aa  62.8  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2560  hypothetical protein  28.11 
 
 
282 aa  62.4  0.000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3231  hypothetical protein  25.69 
 
 
382 aa  62  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0142  hypothetical protein  24.41 
 
 
298 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.836251  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1976  hypothetical protein  26.1 
 
 
287 aa  60.5  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0127  hypothetical protein  24.32 
 
 
303 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000393642 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0101  hypothetical protein  24.32 
 
 
298 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0230  hypothetical protein  24.58 
 
 
290 aa  59.7  0.00000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00383338  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0058  hypothetical protein  25.42 
 
 
315 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00639651  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2607  hypothetical protein  25.59 
 
 
289 aa  58.9  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.989258  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0993  hypothetical protein  39.74 
 
 
147 aa  57.8  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0300  hypothetical protein  24.32 
 
 
305 aa  58.2  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000400684  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1140  hypothetical protein  39.74 
 
 
147 aa  57  0.0000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0398  hypothetical protein  39.74 
 
 
147 aa  57  0.0000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1261  hypothetical protein  25.42 
 
 
290 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0294  hypothetical protein  25.4 
 
 
315 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0536  hypothetical protein  39.74 
 
 
147 aa  55.5  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.392908  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1691  hypothetical protein  22.11 
 
 
288 aa  54.7  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0958  hypothetical protein  23.43 
 
 
285 aa  55.1  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0031  hypothetical protein  22.45 
 
 
307 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0158  hypothetical protein  22.45 
 
 
307 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.459825  hitchhiker  4.24073e-17 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2771  hypothetical protein  25.66 
 
 
283 aa  53.1  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2556  hypothetical protein  24.67 
 
 
281 aa  53.1  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0820  hypothetical protein  25.68 
 
 
334 aa  53.1  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0694  hypothetical protein  32.71 
 
 
242 aa  52.4  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3043  hypothetical protein  33.65 
 
 
187 aa  52  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.190501  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1032  hypothetical protein  23.55 
 
 
287 aa  51.2  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.15202  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1931  hypothetical protein  24.34 
 
 
308 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4944  hypothetical protein  34.69 
 
 
319 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2294  hypothetical protein  23.94 
 
 
276 aa  50.4  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2711  hypothetical protein  24.38 
 
 
299 aa  50.1  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0116861  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1131  hypothetical protein  23.2 
 
 
298 aa  50.1  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2413  hypothetical protein  21.47 
 
 
326 aa  48.5  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000810744  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0550  hypothetical protein  28.16 
 
 
109 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.15726  normal  0.439248 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2565  hypothetical protein  22.86 
 
 
313 aa  47.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136363  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0885  hypothetical protein  23.17 
 
 
313 aa  47.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0397  hypothetical protein  22.69 
 
 
317 aa  47  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2429  hypothetical protein  23.17 
 
 
306 aa  46.6  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.905832 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4940  hypothetical protein  32.65 
 
 
327 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2417  Exodeoxyribonuclease V  34.19 
 
 
1124 aa  45.8  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.449307  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5077  hypothetical protein  32.98 
 
 
325 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0216  hypothetical protein  24.17 
 
 
312 aa  45.8  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000115501  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4715  hypothetical protein  32.98 
 
 
331 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0006  hypothetical protein  23.33 
 
 
313 aa  45.4  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00155614  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2384  hypothetical protein  23.78 
 
 
325 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000252943  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2425  hypothetical protein  31.71 
 
 
276 aa  44.3  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1240  hypothetical protein  23.79 
 
 
334 aa  44.3  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24430  hypothetical protein  25.25 
 
 
323 aa  43.1  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>