112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0749 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0749  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  591  1e-168  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0598  hypothetical protein  86.49 
 
 
296 aa  531  1e-150  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0615  hypothetical protein  83 
 
 
300 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1091  hypothetical protein  75.69 
 
 
322 aa  424  1e-117  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0528026  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1534  hypothetical protein  61.44 
 
 
233 aa  301  1e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5306  hypothetical protein  40.2 
 
 
308 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939469  normal  0.0565222 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1830  hypothetical protein  41.61 
 
 
290 aa  206  4e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00791791  hitchhiker  0.0000000000564838 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0898  hypothetical protein  37.54 
 
 
283 aa  191  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148019 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0886  transposase and inactivated derivative  35.09 
 
 
310 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.615238  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1737  hypothetical protein  34.01 
 
 
318 aa  168  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0033036 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1070  hypothetical protein  33.68 
 
 
287 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1763  hypothetical protein  35.17 
 
 
300 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0148846 
 
 
-
 
NC_002978  WD0627  hypothetical protein  30.82 
 
 
298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.261327  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0511  hypothetical protein  28.96 
 
 
309 aa  119  9e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00971553  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0296  hypothetical protein  27.67 
 
 
303 aa  113  3e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0337026  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1941  hypothetical protein  29.47 
 
 
288 aa  109  5e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000016272  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1947  hypothetical protein  29.93 
 
 
299 aa  104  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000247154  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3043  hypothetical protein  45.95 
 
 
187 aa  103  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.190501  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4711  hypothetical protein  27.46 
 
 
293 aa  97.1  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0013874  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0885  hypothetical protein  34.66 
 
 
183 aa  95.5  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00688729 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3230  hypothetical protein  27.46 
 
 
326 aa  95.1  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593282  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3231  hypothetical protein  28.37 
 
 
382 aa  94.7  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3232  hypothetical protein  28.52 
 
 
382 aa  95.1  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0142  hypothetical protein  27.46 
 
 
298 aa  89  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.836251  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3057  hypothetical protein  27.74 
 
 
285 aa  89  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.139134 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0528  hypothetical protein  26.92 
 
 
311 aa  87  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.261127  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3010  hypothetical protein  25.83 
 
 
326 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0413061  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2497  hypothetical protein  25.09 
 
 
309 aa  83.6  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3058  hypothetical protein  27.08 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.669677  normal  0.19062 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0294  hypothetical protein  25.71 
 
 
315 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0403  hypothetical protein  25.18 
 
 
284 aa  80.9  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000003324  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0049  hypothetical protein  26.41 
 
 
296 aa  80.5  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1691  hypothetical protein  25.09 
 
 
288 aa  80.1  0.00000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4940  hypothetical protein  22.53 
 
 
327 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1131  hypothetical protein  25.16 
 
 
298 aa  79.7  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1976  hypothetical protein  25.09 
 
 
287 aa  79.3  0.00000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0766  hypothetical protein  25.52 
 
 
303 aa  79.3  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1931  hypothetical protein  26.94 
 
 
308 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0230  hypothetical protein  25.33 
 
 
290 aa  76.6  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00383338  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4944  hypothetical protein  24.14 
 
 
319 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0397  hypothetical protein  23.23 
 
 
317 aa  75.1  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4715  hypothetical protein  21.52 
 
 
331 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5077  hypothetical protein  22.05 
 
 
325 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0058  hypothetical protein  27.68 
 
 
315 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00639651  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0257  hypothetical protein  27.6 
 
 
306 aa  73.2  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2413  hypothetical protein  22.85 
 
 
326 aa  72.8  0.000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000810744  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1487  hypothetical protein  23.67 
 
 
302 aa  72.8  0.000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2384  hypothetical protein  24.19 
 
 
314 aa  72.8  0.000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000288219  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1261  hypothetical protein  25.35 
 
 
290 aa  72  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0669  hypothetical protein  22.41 
 
 
292 aa  72  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0165  hypothetical protein  25.09 
 
 
284 aa  71.6  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2145  hypothetical protein  22.97 
 
 
285 aa  71.2  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.955694  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0807  hypothetical protein  22.45 
 
 
298 aa  71.2  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.098381  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2719  hypothetical protein  23.73 
 
 
296 aa  69.7  0.00000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2698  hypothetical protein  24.5 
 
 
291 aa  69.3  0.00000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0395  hypothetical protein  27.85 
 
 
246 aa  68.9  0.00000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1137  hypothetical protein  26.64 
 
 
256 aa  68.9  0.00000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0127  hypothetical protein  23.65 
 
 
303 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000393642 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1236  hypothetical protein  22.73 
 
 
311 aa  66.6  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00145215  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0694  hypothetical protein  26.89 
 
 
242 aa  66.6  0.0000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2384  hypothetical protein  25.91 
 
 
325 aa  66.2  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000252943  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2429  hypothetical protein  23.49 
 
 
306 aa  65.9  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.905832 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0958  hypothetical protein  23.73 
 
 
285 aa  66.2  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0300  hypothetical protein  22.19 
 
 
305 aa  65.9  0.0000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000400684  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1344  hypothetical protein  22.34 
 
 
292 aa  65.1  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0539  hypothetical protein  25.64 
 
 
277 aa  65.1  0.000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1114  hypothetical protein  21.68 
 
 
310 aa  63.5  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0398  hypothetical protein  36.59 
 
 
147 aa  63.2  0.000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0536  hypothetical protein  39.02 
 
 
147 aa  63.2  0.000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.392908  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0031  hypothetical protein  27.17 
 
 
307 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0158  hypothetical protein  27.17 
 
 
307 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.459825  hitchhiker  4.24073e-17 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0862  hypothetical protein  23.67 
 
 
284 aa  62  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2771  hypothetical protein  25.58 
 
 
283 aa  62  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0993  hypothetical protein  35.37 
 
 
147 aa  61.6  0.00000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2707  hypothetical protein  21.96 
 
 
300 aa  61.2  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1608  hypothetical protein  21.31 
 
 
306 aa  60.8  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0101  hypothetical protein  26.82 
 
 
298 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2444  hypothetical protein  25.26 
 
 
299 aa  61.6  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.445451  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1140  hypothetical protein  35.37 
 
 
147 aa  60.5  0.00000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0885  hypothetical protein  21.09 
 
 
313 aa  60.5  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1178  hypothetical protein  21.73 
 
 
314 aa  59.7  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2432  hypothetical protein  22.87 
 
 
259 aa  59.3  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.870937 
 
 
-
 
NC_002978  WD0996  hypothetical protein  26.13 
 
 
266 aa  59.3  0.00000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0226  hypothetical protein  35 
 
 
147 aa  58.5  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1611  hypothetical protein  20.74 
 
 
318 aa  58.5  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.5466e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0007  hypothetical protein  23.67 
 
 
284 aa  57.8  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2294  hypothetical protein  23.34 
 
 
276 aa  58.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0691  hypothetical protein  31.71 
 
 
147 aa  57.4  0.0000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0223479  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2583  hypothetical protein  19.3 
 
 
317 aa  57  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.21441e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1240  hypothetical protein  23.42 
 
 
334 aa  54.3  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0006  hypothetical protein  20.55 
 
 
313 aa  54.7  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00155614  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2560  hypothetical protein  24.55 
 
 
282 aa  53.9  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2607  hypothetical protein  21.71 
 
 
289 aa  53.9  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.989258  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0597  hypothetical protein  20.38 
 
 
330 aa  53.9  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.946017  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2556  hypothetical protein  25.93 
 
 
281 aa  53.5  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0216  hypothetical protein  22.81 
 
 
312 aa  53.5  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000115501  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0550  hypothetical protein  34.23 
 
 
109 aa  53.1  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.15726  normal  0.439248 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2565  hypothetical protein  21.54 
 
 
313 aa  52.8  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136363  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1032  hypothetical protein  22.9 
 
 
287 aa  49.7  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.15202  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0175  hypothetical protein  24.32 
 
 
256 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>