36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I3043 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I3043  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  372  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.190501  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1091  hypothetical protein  52.29 
 
 
322 aa  106  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0528026  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0598  hypothetical protein  47.32 
 
 
296 aa  105  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0615  hypothetical protein  46.43 
 
 
300 aa  104  9e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0749  hypothetical protein  45.95 
 
 
288 aa  103  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5306  hypothetical protein  55.74 
 
 
308 aa  70.5  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939469  normal  0.0565222 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1534  hypothetical protein  45.54 
 
 
233 aa  70.1  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0898  hypothetical protein  40.3 
 
 
283 aa  63.2  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148019 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1830  hypothetical protein  32.46 
 
 
290 aa  52  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00791791  hitchhiker  0.0000000000564838 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0886  transposase and inactivated derivative  33.65 
 
 
310 aa  52  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.615238  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0550  hypothetical protein  55.81 
 
 
109 aa  52  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.15726  normal  0.439248 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1070  hypothetical protein  30.28 
 
 
287 aa  47  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1947  hypothetical protein  35.62 
 
 
299 aa  46.6  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000247154  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1941  hypothetical protein  35.62 
 
 
288 aa  46.6  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000016272  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0885  hypothetical protein  30 
 
 
183 aa  46.6  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00688729 
 
 
-
 
NC_002978  WD0398  hypothetical protein  51.06 
 
 
147 aa  45.8  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0226  hypothetical protein  45.45 
 
 
147 aa  45.1  0.0005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1140  hypothetical protein  43.94 
 
 
147 aa  45.1  0.0005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0536  hypothetical protein  50 
 
 
147 aa  45.1  0.0005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.392908  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0257  hypothetical protein  42.42 
 
 
306 aa  45.1  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0993  hypothetical protein  51.06 
 
 
147 aa  44.7  0.0008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3230  hypothetical protein  43.48 
 
 
326 aa  43.9  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593282  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0669  hypothetical protein  35.37 
 
 
292 aa  44.3  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2497  hypothetical protein  44.19 
 
 
309 aa  43.9  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0627  hypothetical protein  46 
 
 
298 aa  43.9  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.261327  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3166  putative transposase YhgA family protein  44.83 
 
 
317 aa  44.3  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3232  hypothetical protein  43.48 
 
 
382 aa  43.5  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3231  hypothetical protein  43.48 
 
 
382 aa  43.5  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1763  hypothetical protein  31.07 
 
 
300 aa  42.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0148846 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0528  hypothetical protein  40 
 
 
311 aa  42.4  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.261127  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0691  hypothetical protein  53.12 
 
 
147 aa  42.4  0.004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0223479  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1737  hypothetical protein  31.07 
 
 
318 aa  42.4  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0033036 
 
 
-
 
NC_002978  WD0296  hypothetical protein  42.86 
 
 
303 aa  42.4  0.004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0337026  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2698  hypothetical protein  50 
 
 
291 aa  42  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1137  hypothetical protein  38.57 
 
 
256 aa  41.2  0.01  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0511  hypothetical protein  53.12 
 
 
309 aa  40.8  0.01  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00971553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>