47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0975 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0975  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  593  1e-169  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000468925  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1938  hypothetical protein  87.67 
 
 
288 aa  520  1e-146  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0948  hypothetical protein  84.25 
 
 
292 aa  507  1e-143  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1904  hypothetical protein  54.23 
 
 
138 aa  150  2e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1976  hypothetical protein  48.21 
 
 
287 aa  66.2  0.0000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1691  hypothetical protein  50 
 
 
288 aa  60.5  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2556  hypothetical protein  26.51 
 
 
281 aa  57  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0216  hypothetical protein  25 
 
 
312 aa  56.2  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000115501  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2384  hypothetical protein  27.2 
 
 
314 aa  55.5  0.0000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000288219  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0006  hypothetical protein  29.44 
 
 
313 aa  54.3  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00155614  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2719  hypothetical protein  42.03 
 
 
296 aa  53.9  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0862  hypothetical protein  44.26 
 
 
284 aa  53.5  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2145  hypothetical protein  27.95 
 
 
285 aa  53.5  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.955694  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0669  hypothetical protein  40.62 
 
 
292 aa  53.1  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0403  hypothetical protein  48.21 
 
 
284 aa  53.1  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000003324  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0300  hypothetical protein  54.35 
 
 
305 aa  53.1  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000400684  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1487  hypothetical protein  26.09 
 
 
302 aa  52.8  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1131  hypothetical protein  46.88 
 
 
298 aa  52.8  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2711  hypothetical protein  45 
 
 
299 aa  52  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0116861  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2698  hypothetical protein  26.77 
 
 
291 aa  51.6  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2097  hypothetical protein  42.42 
 
 
87 aa  50.4  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.607253  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4059  putative transposase  25.4 
 
 
332 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.860661 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4014  putative transposase  24.9 
 
 
332 aa  49.7  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.456112  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0807  hypothetical protein  23.68 
 
 
298 aa  48.5  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.098381  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2565  hypothetical protein  41.03 
 
 
313 aa  47.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136363  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4072  putative transposase  24.31 
 
 
340 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2413  hypothetical protein  48.84 
 
 
326 aa  47  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000810744  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0165  hypothetical protein  34.12 
 
 
284 aa  47.4  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4028  putative transposase  24.31 
 
 
340 aa  47.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1344  hypothetical protein  40.62 
 
 
292 aa  47.4  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2583  hypothetical protein  41.27 
 
 
317 aa  47  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.21441e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2707  hypothetical protein  54.35 
 
 
300 aa  47  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0007  hypothetical protein  39.34 
 
 
284 aa  46.2  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1032  hypothetical protein  27.51 
 
 
287 aa  45.8  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.15202  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0658  putative transposase  22.69 
 
 
332 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000193277 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3726  putative transposase  24.7 
 
 
310 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0615  hypothetical protein  32.61 
 
 
300 aa  44.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0230  hypothetical protein  44.44 
 
 
290 aa  44.3  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00383338  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0068  putative transposase  26.05 
 
 
296 aa  43.5  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.565138  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1178  hypothetical protein  40.74 
 
 
314 aa  43.5  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2771  hypothetical protein  32.8 
 
 
283 aa  43.9  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4874  hypothetical protein  20.9 
 
 
317 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.702519 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0539  hypothetical protein  24.9 
 
 
311 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0740  hypothetical protein  22.73 
 
 
323 aa  43.1  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.559811  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4045  hypothetical protein  26.29 
 
 
309 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.673826  normal  0.0374243 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1182  hypothetical protein  21.4 
 
 
304 aa  42.7  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0523  hypothetical protein  24.5 
 
 
311 aa  42.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>