122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_28300 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_28300  hypothetical protein  100 
 
 
365 aa  749    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.197043 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24430  hypothetical protein  51.89 
 
 
323 aa  285  8e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4715  hypothetical protein  27.39 
 
 
331 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5077  hypothetical protein  27.39 
 
 
325 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4940  hypothetical protein  27.63 
 
 
327 aa  99.8  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2384  hypothetical protein  25.79 
 
 
325 aa  90.5  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000252943  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1131  hypothetical protein  28.77 
 
 
298 aa  86.3  7e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2384  hypothetical protein  26.13 
 
 
314 aa  85.9  9e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000288219  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1178  hypothetical protein  24.84 
 
 
314 aa  84  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1611  hypothetical protein  24.17 
 
 
318 aa  81.6  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.5466e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0230  hypothetical protein  29.41 
 
 
290 aa  77  0.0000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00383338  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4555  hypothetical protein  29.58 
 
 
234 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.166025  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0294  hypothetical protein  24.38 
 
 
315 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0820  hypothetical protein  28.67 
 
 
334 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4944  hypothetical protein  23.69 
 
 
319 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1947  hypothetical protein  27.3 
 
 
299 aa  74.3  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000247154  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1236  hypothetical protein  24.5 
 
 
311 aa  72.4  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00145215  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1487  hypothetical protein  24.18 
 
 
302 aa  72.4  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4573  hypothetical protein  26.12 
 
 
230 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0597  hypothetical protein  25.69 
 
 
330 aa  70.1  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.946017  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4711  hypothetical protein  24.52 
 
 
293 aa  69.7  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0013874  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1931  hypothetical protein  25.17 
 
 
308 aa  69.7  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1091  hypothetical protein  21.56 
 
 
322 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0528026  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0807  hypothetical protein  26.12 
 
 
298 aa  69.3  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.098381  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1608  hypothetical protein  24.49 
 
 
306 aa  68.6  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2583  hypothetical protein  22.56 
 
 
317 aa  67.8  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.21441e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3232  hypothetical protein  26.04 
 
 
382 aa  67.4  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3231  hypothetical protein  27.03 
 
 
382 aa  65.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1941  hypothetical protein  24.04 
 
 
288 aa  63.2  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000016272  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0511  hypothetical protein  24.92 
 
 
309 aa  62.8  0.000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00971553  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15060  predicted protein  39.47 
 
 
191 aa  60.5  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0142  hypothetical protein  24.64 
 
 
298 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.836251  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0517  conserved hypothetical cytosolic protein  39.76 
 
 
339 aa  58.9  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1737  hypothetical protein  26.3 
 
 
318 aa  58.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0033036 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3230  hypothetical protein  25.08 
 
 
326 aa  57.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593282  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2924  flagellar assembly protein H  33.33 
 
 
338 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2934  flagellar assembly protein H  33.33 
 
 
338 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3066  flagellar assembly protein H  33.33 
 
 
338 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.934094 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1439  flagellar assembly protein H  33.33 
 
 
338 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4928  hypothetical protein  46.15 
 
 
315 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.443955 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0397  hypothetical protein  25.78 
 
 
317 aa  56.6  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2565  hypothetical protein  23.57 
 
 
313 aa  56.6  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136363  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4962  hypothetical protein  25.48 
 
 
192 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2719  hypothetical protein  22.53 
 
 
296 aa  55.5  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0257  hypothetical protein  25.51 
 
 
306 aa  55.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1567a  hypothetical cytosolic protein  65.79 
 
 
335 aa  55.5  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.203402  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0216  hypothetical protein  23.55 
 
 
312 aa  54.7  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000115501  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0885  hypothetical protein  23.92 
 
 
313 aa  54.7  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2574  flagellar assembly protein H  33.33 
 
 
318 aa  55.5  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.412103  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1184  flagellar assembly protein H  51.92 
 
 
403 aa  54.3  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1326  flagellar assembly protein H  55.56 
 
 
375 aa  53.5  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1351  flagellar assembly protein H  35 
 
 
316 aa  53.5  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.143361  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0958  hypothetical protein  25.99 
 
 
285 aa  53.5  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0038  hypothetical protein  36.47 
 
 
324 aa  53.1  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5306  hypothetical protein  21.53 
 
 
308 aa  53.1  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939469  normal  0.0565222 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2698  hypothetical protein  25.72 
 
 
291 aa  52.8  0.000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0627  hypothetical protein  25.27 
 
 
298 aa  52.8  0.000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.261327  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1284  flagellar assembly protein H  35 
 
 
316 aa  52.8  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0058  hypothetical protein  23.99 
 
 
315 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00639651  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4981  hypothetical protein  27.44 
 
 
160 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2429  hypothetical protein  25.24 
 
 
306 aa  52.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.905832 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1108  putative transposase  67.65 
 
 
339 aa  52.4  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1620  flagellar assembly protein FliH  43.1 
 
 
324 aa  52.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2145  hypothetical protein  25.09 
 
 
285 aa  51.6  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.955694  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1344  flagellar assembly protein H  34.34 
 
 
320 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.388859 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1504  flagellar assembly protein H  47.27 
 
 
262 aa  51.2  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3226  flagellar assembly protein H  34.34 
 
 
316 aa  50.8  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1368  flagellar assembly protein FliH  44.83 
 
 
339 aa  51.2  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3064  flagellar assembly protein FliH  39.29 
 
 
334 aa  51.2  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1114  hypothetical protein  23.12 
 
 
310 aa  50.4  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3657  flagellar assembly protein H  40.4 
 
 
235 aa  50.1  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1839  copper resistance B precursor  36 
 
 
429 aa  50.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.425584  hitchhiker  0.0000315743 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001188  flagellar assembly protein FliH  58.33 
 
 
251 aa  49.7  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02887  flagellar assembly protein H  34.07 
 
 
260 aa  49.7  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0403  hypothetical protein  28.33 
 
 
284 aa  49.3  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000003324  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2786  hypothetical protein  40.82 
 
 
340 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0049  hypothetical protein  22.26 
 
 
296 aa  48.5  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0669  hypothetical protein  22.76 
 
 
292 aa  48.1  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0762  hypothetical protein  32.26 
 
 
317 aa  48.1  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00138696  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3045  flagellar assembly protein H  41.94 
 
 
266 aa  48.5  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04975  flagellar assembly protein H  48.39 
 
 
224 aa  48.1  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5101  copper resistance B precursor  33.33 
 
 
421 aa  48.9  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.082477 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1034  hypothetical protein  30.93 
 
 
321 aa  47.8  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.121952  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0300  hypothetical protein  23.16 
 
 
305 aa  47.8  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000400684  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0127  hypothetical protein  25.94 
 
 
303 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000393642 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0684  hypothetical protein  48 
 
 
303 aa  47.4  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.92177 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0006  hypothetical protein  25.18 
 
 
313 aa  47  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00155614  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0528  hypothetical protein  25.44 
 
 
311 aa  47  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.261127  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1182  hypothetical protein  42.22 
 
 
304 aa  47  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1976  hypothetical protein  24.28 
 
 
287 aa  47  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0031  hypothetical protein  25.7 
 
 
307 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2696  hypothetical protein  23.69 
 
 
291 aa  46.6  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.216249 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0158  hypothetical protein  25.7 
 
 
307 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.459825  hitchhiker  4.24073e-17 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0272  hypothetical protein  24.51 
 
 
310 aa  46.2  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.514892 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1691  hypothetical protein  26.67 
 
 
288 aa  46.2  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1015  hypothetical protein  28.57 
 
 
324 aa  46.2  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1509  hypothetical protein  27.84 
 
 
320 aa  45.8  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.055753  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1045  putative transposase  58.82 
 
 
343 aa  45.8  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0831423  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2295  flagellar assembly protein H  42.59 
 
 
300 aa  45.4  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2793  hypothetical protein  34.21 
 
 
301 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>