16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0272 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0272  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  612  9.999999999999999e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.514892 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3064  flagellar assembly protein FliH  32 
 
 		 334 aa  51.6  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3231  hypothetical protein  42.11 
 
 		 382 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3232  hypothetical protein  40.35 
 
 		 382 aa  46.6  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0098  cell wall anchor domain-containing protein  33.96 
 
 		 520 aa  45.8  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0102  cell wall anchor domain-containing protein  33.96 
 
 		 520 aa  45.8  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1715  flagellar assembly protein H  40.74 
 
 		 270 aa  45.4  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2306  flagellar assembly protein H  39.06 
 
 		 265 aa  45.8  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0633  flagellar assembly protein H  47.62 
 
 		 238 aa  43.5  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0232  flagellar assembly protein H  47.62 
 
 		 238 aa  43.9  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.310336 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0713  flagellar assembly protein H  47.62 
 
 		 238 aa  43.9  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1620  flagellar assembly protein FliH  28.42 
 
 		 324 aa  43.1  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2382  TRD5  40.62 
 
 		 253 aa  43.1  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3768  hypothetical protein  35.9 
 
 		 83 aa  43.5  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0820  hypothetical protein  33.61 
 
 		 334 aa  42.7  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3180  hypothetical protein  32.91 
 
 		 102 aa  42.7  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.534154  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>