70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2348 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2348  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  411  1e-114  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2379  hypothetical protein  88.29 
 
 
320 aa  366  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2345  hypothetical protein  87.5 
 
 
206 aa  357  5e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.387086  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1257  hypothetical protein  81.82 
 
 
324 aa  346  1e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2183  hypothetical protein  82.44 
 
 
320 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1248  hypothetical protein  66.52 
 
 
336 aa  300  1e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1410  hypothetical protein  65.17 
 
 
235 aa  278  4e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1399  hypothetical protein  65.33 
 
 
211 aa  275  4e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0266105  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0517  conserved hypothetical cytosolic protein  40.64 
 
 
339 aa  176  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0991  hypothetical protein  45.66 
 
 
324 aa  155  3e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000745042  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1336  hypothetical protein  47.77 
 
 
316 aa  153  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1034  hypothetical protein  47.62 
 
 
321 aa  149  3e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.121952  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1509  hypothetical protein  44.72 
 
 
320 aa  144  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.055753  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1015  hypothetical protein  44.72 
 
 
324 aa  143  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0762  hypothetical protein  44.38 
 
 
317 aa  142  5e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00138696  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1558  hypothetical protein  43.67 
 
 
316 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5125  hypothetical protein  38.74 
 
 
310 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2950  hypothetical protein  40.45 
 
 
334 aa  130  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0249458  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0686  hypothetical protein  43.64 
 
 
312 aa  129  3e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000261491  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0038  hypothetical protein  45.03 
 
 
324 aa  128  6e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1739  hypothetical cytosolic protein  37.37 
 
 
312 aa  125  4.0000000000000003e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1916  hypothetical protein  47.2 
 
 
252 aa  122  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2152  hypothetical cytosolic protein  34.76 
 
 
325 aa  123  2e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4593  hypothetical protein  38.2 
 
 
311 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00114736  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0026  hypothetical protein  34.29 
 
 
325 aa  119  3e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1243  hypothetical protein  42.33 
 
 
310 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000429592  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3938  hypothetical protein  40.58 
 
 
311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1962  hypothetical protein  36.05 
 
 
327 aa  108  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4493  hypothetical protein  38.8 
 
 
319 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0619  hypothetical protein  31.86 
 
 
341 aa  107  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4532  hypothetical protein  38.8 
 
 
319 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1061  hypothetical protein  38.02 
 
 
311 aa  105  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000000000109934  normal  0.0587349 
 
 
 
NC_011729  PCC7424_2414  hypothetical protein  38.41 
 
 
307 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0198  hypothetical protein  36.88 
 
 
313 aa  99  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.202809  hitchhiker  0.00402229 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1567a  hypothetical cytosolic protein  30.92 
 
 
335 aa  94.7  9e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.203402  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0624  hypothetical protein  50 
 
 
130 aa  80.9  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0436757  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0599  hypothetical protein  64.52 
 
 
319 aa  71.2  0.000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0596  hypothetical protein  62.9 
 
 
401 aa  68.9  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.320961  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2781  hypothetical protein  50 
 
 
314 aa  68.6  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.664556  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2698  hypothetical protein  55.56 
 
 
318 aa  68.2  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2623  hypothetical protein  55.56 
 
 
322 aa  68.2  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0276584  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0616  hypothetical protein  62.5 
 
 
384 aa  67.4  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.618084  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1946  hypothetical protein  37.27 
 
 
138 aa  67  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000308535  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0248  hypothetical cytosolic protein  37.27 
 
 
138 aa  67  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1089  putative transposase  46.97 
 
 
337 aa  64.7  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.693638  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2785  hypothetical protein  37.33 
 
 
310 aa  61.6  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0802  putative transposase  43.55 
 
 
333 aa  58.5  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1108  putative transposase  53.97 
 
 
339 aa  58.2  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1059  putative transposase  32.95 
 
 
329 aa  56.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1994  putative transposase  36.9 
 
 
319 aa  55.8  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.735151 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1045  putative transposase  46.77 
 
 
343 aa  55.5  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0831423  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2960  putative transposase  29.55 
 
 
329 aa  54.3  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.26307  normal  0.0520741 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6237  putative transposase  40.91 
 
 
345 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.62735  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1963  putative transposase  43.94 
 
 
331 aa  53.9  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0706346  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2863  hypothetical protein  53.97 
 
 
322 aa  52.4  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.113899 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2547  hypothetical protein  48.61 
 
 
314 aa  52.8  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0376053  normal  0.0608447 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0990  putative transposase  32.1 
 
 
321 aa  51.2  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.271034  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1150  putative transposase  34.57 
 
 
330 aa  50.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0878  putative transposase  36.99 
 
 
321 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110546  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1504  putative transposase  46 
 
 
350 aa  48.9  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1348  hypothetical protein  27.81 
 
 
318 aa  48.1  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0527396  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0368  hypothetical protein  40 
 
 
287 aa  45.4  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.730391  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2880  hypothetical protein  35.71 
 
 
323 aa  44.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.149752  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1063  hypothetical protein  40 
 
 
82 aa  44.3  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000000299029  normal  0.0436362 
 
 
 
NC_009523  RoseRS_1249  hypothetical protein  27.82 
 
 
154 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2902  putative transposase  32.14 
 
 
335 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0749  hypothetical protein  36.21 
 
 
122 aa  43.5  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000564338  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1248  hypothetical protein  23.75 
 
 
330 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.442555 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0681  hypothetical protein  26.59 
 
 
304 aa  43.1  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000573749  unclonable  0.0000000126403 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1349  hypothetical protein  23.03 
 
 
166 aa  42  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072063  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>