144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0149 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0149  hypothetical protein  100 
 
 
298 aa  594  1e-169  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00561727  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1572  hypothetical protein  86.77 
 
 
311 aa  531  1e-150  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0492  hypothetical protein  55.48 
 
 
312 aa  338  9e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1000  hypothetical protein  53.92 
 
 
307 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1606  hypothetical protein  49.68 
 
 
307 aa  301  7.000000000000001e-81  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1121  hypothetical protein  49.53 
 
 
314 aa  295  9e-79  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1543  hypothetical protein  46.6 
 
 
323 aa  286  2.9999999999999996e-76  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1034  hypothetical protein  44.15 
 
 
312 aa  246  3e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3166  putative transposase YhgA family protein  32.46 
 
 
317 aa  100  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1422  hypothetical protein  38.51 
 
 
161 aa  100  4e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0628  hypothetical protein  29.39 
 
 
327 aa  97.1  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.939458  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1250  hypothetical protein  28.21 
 
 
331 aa  97.1  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1150  putative transposase  23.99 
 
 
330 aa  89  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2698  hypothetical protein  23.85 
 
 
318 aa  88.2  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2623  hypothetical protein  23.08 
 
 
322 aa  87  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0276584  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2547  hypothetical protein  26.43 
 
 
314 aa  86.3  6e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0376053  normal  0.0608447 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2863  hypothetical protein  27.96 
 
 
322 aa  85.1  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.113899 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2781  hypothetical protein  23.53 
 
 
314 aa  84.3  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.664556  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2785  hypothetical protein  24.76 
 
 
310 aa  84  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2289  hypothetical protein  29.71 
 
 
333 aa  82  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0492229  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2960  putative transposase  28.24 
 
 
329 aa  81.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.26307  normal  0.0520741 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1059  putative transposase  27.65 
 
 
329 aa  80.5  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0802  putative transposase  28.24 
 
 
333 aa  79.7  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0990  putative transposase  26.95 
 
 
321 aa  79  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.271034  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2880  hypothetical protein  21.67 
 
 
323 aa  79  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.149752  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0878  putative transposase  28.24 
 
 
321 aa  79  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110546  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2902  putative transposase  23.12 
 
 
335 aa  77.4  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0045  hypothetical protein  25.2 
 
 
341 aa  77  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.242935 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1089  putative transposase  27.06 
 
 
337 aa  77  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.693638  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6237  putative transposase  27.06 
 
 
345 aa  75.5  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.62735  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0911  putative transposase YhgA family protein  24.17 
 
 
298 aa  73.9  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1722  hypothetical protein  32.42 
 
 
308 aa  72.4  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000483242  normal  0.789674 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2307  hypothetical protein  28.07 
 
 
321 aa  70.5  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000450312  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2673  hypothetical protein  26.56 
 
 
320 aa  70.1  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000356994  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0147  hypothetical protein  33.33 
 
 
141 aa  69.7  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.320665  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1247  hypothetical protein  27.52 
 
 
336 aa  68.6  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1399  putative transposase  24.71 
 
 
293 aa  67.4  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.213871 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1398  putative transposase  24.71 
 
 
289 aa  66.6  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1400  putative transposase  24.71 
 
 
301 aa  66.6  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0429556  normal  0.22922 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2727  putative transposase YhgA family protein  24.1 
 
 
310 aa  65.1  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0643  hypothetical protein  27.5 
 
 
247 aa  64.3  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.460705  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04207  predicted transposase  22.44 
 
 
255 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1429  putative transposase YhgA family protein  25.2 
 
 
302 aa  63.2  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0029  transposase  23.11 
 
 
320 aa  63.2  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1309  hypothetical protein  28.74 
 
 
328 aa  62.8  0.000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4766  hypothetical protein  22.01 
 
 
334 aa  62.4  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4566  hypothetical protein  22.39 
 
 
314 aa  62.4  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0238  hypothetical protein  24.4 
 
 
344 aa  61.6  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.447255  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0599  putative transposase YhgA family protein  22.01 
 
 
318 aa  62.4  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0142  ISNCY family transposase  22.01 
 
 
306 aa  62  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1504  putative transposase  24.24 
 
 
350 aa  61.2  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2153  hypothetical protein  23.88 
 
 
332 aa  60.8  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.101261 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0068  putative transposase  21.55 
 
 
296 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.565138  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0039  transposase  22.83 
 
 
316 aa  60.5  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0409  hypothetical protein  24.1 
 
 
336 aa  60.1  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.650641  hitchhiker  0.00708611 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0086  putative transposase  24.36 
 
 
319 aa  60.5  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.864811  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0084  hypothetical protein  24.36 
 
 
319 aa  60.5  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4129  putative transposase YhgA family protein  24.36 
 
 
319 aa  60.5  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.683023  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3724  putative transposase YhgA family protein  22.01 
 
 
314 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2474  hypothetical protein  29.49 
 
 
309 aa  60.1  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000139417  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0174  hypothetical protein  24.21 
 
 
317 aa  59.7  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.384261  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0125  hypothetical protein  21.12 
 
 
298 aa  60.1  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0135  hypothetical protein  21.31 
 
 
300 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00131  predicted transposase  21.31 
 
 
300 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3470  putative transposase YhgA family protein  21.31 
 
 
300 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3527  putative transposase YhgA family protein  21.31 
 
 
300 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.653665  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00130  hypothetical protein  21.31 
 
 
300 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.969091  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0181  hypothetical protein  23.38 
 
 
325 aa  58.5  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000266297  normal  0.396651 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0894  hypothetical protein  25.9 
 
 
308 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.284853 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3707  hypothetical protein  23.95 
 
 
304 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02230  hypothetical protein  21.59 
 
 
296 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.326611  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3726  putative transposase  23.53 
 
 
310 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2599  hypothetical protein  21.59 
 
 
296 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00513302  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02190  hypothetical protein  21.59 
 
 
296 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.428095  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4885  hypothetical protein  20.31 
 
 
318 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287711  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0141  hypothetical protein  21.12 
 
 
298 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0529  hypothetical protein  21.23 
 
 
311 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2630  hypothetical protein  26.92 
 
 
317 aa  57.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0658  putative transposase  25 
 
 
332 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000193277 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3782  hypothetical protein  23.35 
 
 
304 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3816  hypothetical protein  23.49 
 
 
304 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.792275 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1351  putative transposase YhgA family protein  21.21 
 
 
296 aa  57  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0581087  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1963  putative transposase  21.26 
 
 
331 aa  57  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0706346  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1347  putative transposase YhgA family protein  21.21 
 
 
296 aa  57  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0644465  normal  0.765955 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3710  hypothetical protein  23.35 
 
 
304 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3878  hypothetical protein  23.35 
 
 
308 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4028  putative transposase  24.76 
 
 
340 aa  56.6  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0523  hypothetical protein  22.15 
 
 
311 aa  56.6  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4072  putative transposase  24.02 
 
 
340 aa  56.6  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3445  hypothetical protein  21.51 
 
 
296 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.143681  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1702  hypothetical protein  21.23 
 
 
326 aa  56.2  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.412934  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1411  hypothetical protein  25.17 
 
 
312 aa  55.8  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.27197 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4059  putative transposase  24.02 
 
 
332 aa  55.8  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.860661 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4014  putative transposase  24.76 
 
 
332 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.456112  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2461  hypothetical protein  21.64 
 
 
300 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.171355  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0740  hypothetical protein  22.46 
 
 
323 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.559811  normal 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0065  hypothetical protein  22.18 
 
 
313 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0980043  hitchhiker  0.0000000385113 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0367  hypothetical protein  28 
 
 
324 aa  53.9  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000913589  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1415  putative transposase YhgA family protein  22.75 
 
 
299 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.571537  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0539  hypothetical protein  22.15 
 
 
311 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>