140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0147 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0147  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  291  2e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.320665  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3166  putative transposase YhgA family protein  60.66 
 
 
317 aa  169  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1250  hypothetical protein  47.15 
 
 
331 aa  131  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0628  hypothetical protein  45.53 
 
 
327 aa  128  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.939458  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1531  hypothetical protein  60.76 
 
 
167 aa  107  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2785  hypothetical protein  45.6 
 
 
310 aa  101  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0045  hypothetical protein  40.34 
 
 
341 aa  101  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.242935 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2547  hypothetical protein  43.09 
 
 
314 aa  96.3  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0376053  normal  0.0608447 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1547  putative transposase YhgA family protein  38.33 
 
 
288 aa  95.1  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.738107  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2623  hypothetical protein  42.28 
 
 
322 aa  95.1  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0276584  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2698  hypothetical protein  42.28 
 
 
318 aa  95.1  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2863  hypothetical protein  42.28 
 
 
322 aa  95.1  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.113899 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3726  putative transposase  36.67 
 
 
310 aa  94.4  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0911  putative transposase YhgA family protein  37.7 
 
 
298 aa  94  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04207  predicted transposase  32.31 
 
 
255 aa  93.6  9e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2727  putative transposase YhgA family protein  38.33 
 
 
310 aa  93.6  9e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4566  hypothetical protein  32.56 
 
 
314 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0539  hypothetical protein  33.61 
 
 
311 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03263  predicted transposase  38.66 
 
 
292 aa  92  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.100095  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1415  putative transposase YhgA family protein  35.25 
 
 
299 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.571537  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03215  hypothetical protein  38.66 
 
 
292 aa  92  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0821559  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3608  hypothetical protein  38.66 
 
 
292 aa  92  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0302  hypothetical protein  38.66 
 
 
292 aa  92  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.094929  normal  0.0909002 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3692  hypothetical protein  38.66 
 
 
292 aa  92  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0529  hypothetical protein  33.61 
 
 
311 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0520  hypothetical protein  32.79 
 
 
307 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0523  hypothetical protein  33.61 
 
 
311 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2781  hypothetical protein  41.46 
 
 
314 aa  91.7  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.664556  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1406  hypothetical protein  36.07 
 
 
299 aa  91.3  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.286093  normal  0.84386 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0302  putative transposase YhgA family protein  37.82 
 
 
292 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.78914  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2542  hypothetical protein  36.07 
 
 
300 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3886  hypothetical protein  37.82 
 
 
292 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2627  hypothetical protein  36.07 
 
 
300 aa  90.9  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3792  hypothetical protein  37.82 
 
 
292 aa  90.9  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4766  hypothetical protein  32.79 
 
 
334 aa  90.5  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3382  hypothetical protein  36.07 
 
 
308 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2386  hypothetical protein  36.07 
 
 
300 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4718  hypothetical protein  37.82 
 
 
292 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0039  transposase  35.25 
 
 
316 aa  90.1  9e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04729  hypothetical protein  37.21 
 
 
309 aa  89.4  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0122  putative transposase  34.43 
 
 
313 aa  89.7  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  1.2156300000000001e-29 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3724  putative transposase YhgA family protein  32.56 
 
 
314 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3782  hypothetical protein  33.61 
 
 
304 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3816  hypothetical protein  33.61 
 
 
304 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.792275 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1429  putative transposase YhgA family protein  36.67 
 
 
302 aa  89.4  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2880  hypothetical protein  35.29 
 
 
323 aa  89.4  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.149752  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2397  hypothetical protein  35.25 
 
 
319 aa  89  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4885  hypothetical protein  31.78 
 
 
318 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287711  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3878  hypothetical protein  33.61 
 
 
308 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3710  hypothetical protein  32.79 
 
 
304 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02129  hypothetical protein  35.25 
 
 
282 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0142  ISNCY family transposase  31.97 
 
 
306 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2461  hypothetical protein  35.29 
 
 
300 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.171355  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3707  hypothetical protein  32.79 
 
 
304 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02170  hypothetical protein  35.25 
 
 
300 aa  87.4  7e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1059  putative transposase  33.06 
 
 
329 aa  87  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1089  putative transposase  33.61 
 
 
337 aa  86.7  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.693638  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0878  putative transposase  33.61 
 
 
321 aa  86.7  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110546  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02230  hypothetical protein  35.29 
 
 
296 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.326611  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6237  putative transposase  30.66 
 
 
345 aa  86.7  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.62735  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02190  hypothetical protein  35.29 
 
 
296 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.428095  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0990  putative transposase  31.39 
 
 
321 aa  86.3  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.271034  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2599  hypothetical protein  35.29 
 
 
296 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00513302  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1351  putative transposase YhgA family protein  34.45 
 
 
296 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0581087  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2902  putative transposase  32.79 
 
 
335 aa  85.9  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0086  putative transposase  32.88 
 
 
319 aa  85.5  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.864811  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0084  hypothetical protein  32.88 
 
 
319 aa  85.5  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4129  putative transposase YhgA family protein  32.88 
 
 
319 aa  85.5  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.683023  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1347  putative transposase YhgA family protein  34.45 
 
 
296 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0644465  normal  0.765955 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4874  hypothetical protein  35.29 
 
 
317 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.702519 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4776  hypothetical protein  35.29 
 
 
317 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4851  hypothetical protein  35.29 
 
 
321 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0802  putative transposase  30.66 
 
 
333 aa  85.1  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0029  transposase  34.43 
 
 
320 aa  85.1  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3445  hypothetical protein  34.45 
 
 
296 aa  84.7  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.143681  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4096  hypothetical protein  36.07 
 
 
313 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2960  putative transposase  32.79 
 
 
329 aa  84.7  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.26307  normal  0.0520741 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3991  hypothetical protein  36.07 
 
 
313 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4159  hypothetical protein  36.07 
 
 
313 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.241117  normal  0.413105 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4045  hypothetical protein  36.07 
 
 
309 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.673826  normal  0.0374243 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3973  hypothetical protein  36.07 
 
 
309 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0599  putative transposase YhgA family protein  34.68 
 
 
318 aa  84.3  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00131  predicted transposase  31.15 
 
 
300 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3470  putative transposase YhgA family protein  31.15 
 
 
300 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00130  hypothetical protein  31.15 
 
 
300 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.969091  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0135  hypothetical protein  31.15 
 
 
300 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3527  putative transposase YhgA family protein  31.15 
 
 
300 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.653665  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0125  hypothetical protein  31.15 
 
 
298 aa  82.8  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0141  hypothetical protein  31.15 
 
 
298 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1150  putative transposase  33.33 
 
 
330 aa  80.9  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0065  hypothetical protein  32.52 
 
 
313 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0980043  hitchhiker  0.0000000385113 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0068  putative transposase  32.52 
 
 
296 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.565138  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0894  hypothetical protein  30.94 
 
 
308 aa  77  0.00000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.284853 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1034  hypothetical protein  37.5 
 
 
312 aa  75.9  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04170  hypothetical protein  34.38 
 
 
103 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.858892  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2828  putative transposase  29.23 
 
 
338 aa  73.6  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.949777  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1309  hypothetical protein  37.4 
 
 
328 aa  71.2  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0643  hypothetical protein  49.21 
 
 
247 aa  70.1  0.000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.460705  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0149  hypothetical protein  33.33 
 
 
298 aa  69.7  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00561727  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2289  hypothetical protein  33.33 
 
 
333 aa  69.3  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0492229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>