142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1000 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1000  hypothetical protein  100 
 
 
307 aa  614  1e-175  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0492  hypothetical protein  68.69 
 
 
312 aa  437  1e-121  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1121  hypothetical protein  56.23 
 
 
314 aa  360  2e-98  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1606  hypothetical protein  56.31 
 
 
307 aa  346  2e-94  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1543  hypothetical protein  53.58 
 
 
323 aa  343  1e-93  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0149  hypothetical protein  53.92 
 
 
298 aa  329  3e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00561727  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1572  hypothetical protein  52.26 
 
 
311 aa  318  7.999999999999999e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1034  hypothetical protein  52.46 
 
 
312 aa  310  2e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0628  hypothetical protein  31.71 
 
 
327 aa  112  6e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.939458  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2698  hypothetical protein  28.66 
 
 
318 aa  109  6e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1422  hypothetical protein  41.88 
 
 
161 aa  109  6e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2623  hypothetical protein  28.79 
 
 
322 aa  109  8.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0276584  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2863  hypothetical protein  29.1 
 
 
322 aa  107  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.113899 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1250  hypothetical protein  30.34 
 
 
331 aa  102  7e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2547  hypothetical protein  29.02 
 
 
314 aa  101  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0376053  normal  0.0608447 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2781  hypothetical protein  28.39 
 
 
314 aa  101  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.664556  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2902  putative transposase  25.33 
 
 
335 aa  95.1  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2785  hypothetical protein  25.63 
 
 
310 aa  92.8  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3166  putative transposase YhgA family protein  28.94 
 
 
317 aa  92.4  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0643  hypothetical protein  32.03 
 
 
247 aa  86.3  5e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.460705  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0045  hypothetical protein  23.97 
 
 
341 aa  85.1  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.242935 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6237  putative transposase  26.52 
 
 
345 aa  84.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.62735  normal 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0068  putative transposase  25.25 
 
 
296 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.565138  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1247  hypothetical protein  27.98 
 
 
336 aa  82.8  0.000000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2289  hypothetical protein  29.28 
 
 
333 aa  82.4  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0492229  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2880  hypothetical protein  22.6 
 
 
323 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.149752  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3726  putative transposase  25.09 
 
 
310 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4766  hypothetical protein  22.84 
 
 
334 aa  78.2  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2630  hypothetical protein  25.48 
 
 
317 aa  78.2  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2960  putative transposase  23.93 
 
 
329 aa  76.6  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.26307  normal  0.0520741 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3707  hypothetical protein  24.54 
 
 
304 aa  77  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1702  hypothetical protein  21.91 
 
 
326 aa  76.3  0.0000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.412934  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0911  putative transposase YhgA family protein  25.75 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1059  putative transposase  23.84 
 
 
329 aa  75.1  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0409  hypothetical protein  25.6 
 
 
336 aa  74.3  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.650641  hitchhiker  0.00708611 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1150  putative transposase  24.75 
 
 
330 aa  74.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3782  hypothetical protein  23.79 
 
 
304 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3816  hypothetical protein  23.79 
 
 
304 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.792275 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0238  hypothetical protein  25.59 
 
 
344 aa  73.6  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.447255  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4885  hypothetical protein  22.68 
 
 
318 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287711  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3878  hypothetical protein  23.99 
 
 
308 aa  73.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3710  hypothetical protein  23.42 
 
 
304 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1045  putative transposase  22.29 
 
 
343 aa  72.4  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0831423  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1089  putative transposase  22.96 
 
 
337 aa  72.4  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.693638  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4566  hypothetical protein  22.87 
 
 
314 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0878  putative transposase  26.32 
 
 
321 aa  70.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110546  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2153  hypothetical protein  26.96 
 
 
332 aa  71.2  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.101261 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2307  hypothetical protein  31.48 
 
 
321 aa  70.5  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000450312  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4874  hypothetical protein  21.29 
 
 
317 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.702519 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4776  hypothetical protein  21.29 
 
 
317 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4851  hypothetical protein  21.29 
 
 
321 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0802  putative transposase  23.96 
 
 
333 aa  69.7  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0740  hypothetical protein  25.6 
 
 
323 aa  69.3  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.559811  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0990  putative transposase  28.14 
 
 
321 aa  68.9  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.271034  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3382  hypothetical protein  24.55 
 
 
308 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0367  hypothetical protein  30.36 
 
 
324 aa  68.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000913589  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04207  predicted transposase  22.62 
 
 
255 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1400  putative transposase  24.55 
 
 
301 aa  67.8  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0429556  normal  0.22922 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0122  putative transposase  23.51 
 
 
313 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  1.2156300000000001e-29 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2267  hypothetical protein  28.24 
 
 
360 aa  68.2  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3724  putative transposase YhgA family protein  22.87 
 
 
314 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1309  hypothetical protein  26.62 
 
 
328 aa  67.4  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0086  putative transposase  24.09 
 
 
319 aa  67  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.864811  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0084  hypothetical protein  24.09 
 
 
319 aa  67  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4129  putative transposase YhgA family protein  24.09 
 
 
319 aa  67  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.683023  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1504  putative transposase  27.88 
 
 
350 aa  66.2  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0135  hypothetical protein  22.63 
 
 
300 aa  66.2  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1429  putative transposase YhgA family protein  24.52 
 
 
302 aa  65.9  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1415  putative transposase YhgA family protein  23.38 
 
 
299 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.571537  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4045  hypothetical protein  22.78 
 
 
309 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.673826  normal  0.0374243 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4096  hypothetical protein  22.78 
 
 
313 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3973  hypothetical protein  22.78 
 
 
309 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3991  hypothetical protein  22.78 
 
 
313 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4159  hypothetical protein  22.78 
 
 
313 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.241117  normal  0.413105 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4072  putative transposase  24.64 
 
 
340 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2397  hypothetical protein  24 
 
 
319 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0125  hypothetical protein  22.68 
 
 
298 aa  65.1  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4028  putative transposase  24.64 
 
 
340 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1399  putative transposase  24.25 
 
 
293 aa  63.9  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.213871 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00131  predicted transposase  22.68 
 
 
300 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3470  putative transposase YhgA family protein  22.68 
 
 
300 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0658  putative transposase  24.74 
 
 
332 aa  63.5  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000193277 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1722  hypothetical protein  26.42 
 
 
308 aa  63.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000483242  normal  0.789674 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3527  putative transposase YhgA family protein  22.68 
 
 
300 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.653665  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00130  hypothetical protein  22.68 
 
 
300 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.969091  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0039  transposase  23.28 
 
 
316 aa  63.5  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02170  hypothetical protein  22.74 
 
 
300 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4014  putative transposase  24.15 
 
 
332 aa  63.2  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.456112  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2386  hypothetical protein  22.74 
 
 
300 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0142  ISNCY family transposase  22.64 
 
 
306 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2673  hypothetical protein  27.39 
 
 
320 aa  63.2  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000356994  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4059  putative transposase  25.4 
 
 
332 aa  63.2  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.860661 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0147  hypothetical protein  31.67 
 
 
141 aa  63.2  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.320665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02129  hypothetical protein  22.74 
 
 
282 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0065  hypothetical protein  25.13 
 
 
313 aa  62.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0980043  hitchhiker  0.0000000385113 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0141  hypothetical protein  22.3 
 
 
298 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1406  hypothetical protein  22.74 
 
 
299 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.286093  normal  0.84386 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2542  hypothetical protein  23.66 
 
 
300 aa  62.4  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2627  hypothetical protein  23.66 
 
 
300 aa  62.4  0.000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1963  putative transposase  21.43 
 
 
331 aa  61.6  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0706346  normal  0.536642 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>