141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_02170 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02170  hypothetical protein  100 
 
 
300 aa  624  1e-178  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2386  hypothetical protein  99.33 
 
 
300 aa  617  1e-176  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2542  hypothetical protein  99.33 
 
 
300 aa  618  1e-176  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2627  hypothetical protein  99.33 
 
 
300 aa  618  1e-176  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3382  hypothetical protein  96.43 
 
 
308 aa  609  1e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1406  hypothetical protein  96.33 
 
 
299 aa  596  1e-169  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.286093  normal  0.84386 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1415  putative transposase YhgA family protein  95.67 
 
 
299 aa  590  1e-167  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.571537  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02129  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  588  1e-167  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2397  hypothetical protein  90.16 
 
 
319 aa  580  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3816  hypothetical protein  64.8 
 
 
304 aa  421  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.792275 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3707  hypothetical protein  64.8 
 
 
304 aa  421  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3710  hypothetical protein  64.8 
 
 
304 aa  421  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3878  hypothetical protein  63.96 
 
 
308 aa  421  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2461  hypothetical protein  65.67 
 
 
300 aa  418  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.171355  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3782  hypothetical protein  64.47 
 
 
304 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02230  hypothetical protein  65.33 
 
 
296 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.326611  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1351  putative transposase YhgA family protein  65.33 
 
 
296 aa  414  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0581087  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02190  hypothetical protein  65.33 
 
 
296 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.428095  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2599  hypothetical protein  65.33 
 
 
296 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00513302  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1347  putative transposase YhgA family protein  65.33 
 
 
296 aa  414  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0644465  normal  0.765955 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3445  hypothetical protein  65 
 
 
296 aa  413  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.143681  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4045  hypothetical protein  63.75 
 
 
309 aa  408  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.673826  normal  0.0374243 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3973  hypothetical protein  63.75 
 
 
309 aa  408  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4096  hypothetical protein  62.62 
 
 
313 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3991  hypothetical protein  62.62 
 
 
313 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4159  hypothetical protein  62.62 
 
 
313 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.241117  normal  0.413105 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4874  hypothetical protein  60.88 
 
 
317 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.702519 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4776  hypothetical protein  60.57 
 
 
317 aa  387  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4851  hypothetical protein  60.12 
 
 
321 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03263  predicted transposase  60.2 
 
 
292 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.100095  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0302  putative transposase YhgA family protein  60.2 
 
 
292 aa  379  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.78914  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03215  hypothetical protein  60.2 
 
 
292 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0821559  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3608  hypothetical protein  60.2 
 
 
292 aa  379  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0302  hypothetical protein  60.2 
 
 
292 aa  379  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.094929  normal  0.0909002 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4718  hypothetical protein  60.2 
 
 
292 aa  376  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3886  hypothetical protein  59.87 
 
 
292 aa  376  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3692  hypothetical protein  59.87 
 
 
292 aa  377  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3792  hypothetical protein  59.87 
 
 
292 aa  377  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4566  hypothetical protein  56.04 
 
 
314 aa  348  5e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3726  putative transposase  54.69 
 
 
310 aa  348  8e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4885  hypothetical protein  56.62 
 
 
318 aa  347  2e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287711  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0086  putative transposase  54.93 
 
 
319 aa  345  4e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.864811  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0084  hypothetical protein  54.93 
 
 
319 aa  345  4e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4129  putative transposase YhgA family protein  54.93 
 
 
319 aa  345  4e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.683023  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3724  putative transposase YhgA family protein  55.37 
 
 
314 aa  342  4e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4766  hypothetical protein  54.97 
 
 
334 aa  341  1e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04207  predicted transposase  61.18 
 
 
255 aa  338  8e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0122  putative transposase  50 
 
 
313 aa  331  7.000000000000001e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  1.2156300000000001e-29 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04729  hypothetical protein  49.34 
 
 
309 aa  323  2e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0029  transposase  48.75 
 
 
320 aa  323  2e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0599  putative transposase YhgA family protein  49.52 
 
 
318 aa  322  6e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0039  transposase  48.1 
 
 
316 aa  319  3.9999999999999996e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0135  hypothetical protein  51.54 
 
 
300 aa  310  2e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0125  hypothetical protein  51.19 
 
 
298 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0141  hypothetical protein  51.19 
 
 
298 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00131  predicted transposase  50.67 
 
 
300 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3470  putative transposase YhgA family protein  50.67 
 
 
300 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3527  putative transposase YhgA family protein  50.67 
 
 
300 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.653665  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00130  hypothetical protein  50.67 
 
 
300 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.969091  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0068  putative transposase  49.66 
 
 
296 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.565138  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0539  hypothetical protein  48.06 
 
 
311 aa  302  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0520  hypothetical protein  46.73 
 
 
307 aa  302  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0523  hypothetical protein  47.74 
 
 
311 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0529  hypothetical protein  47.42 
 
 
311 aa  298  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0142  ISNCY family transposase  50.99 
 
 
306 aa  295  7e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2727  putative transposase YhgA family protein  51.92 
 
 
310 aa  291  6e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1429  putative transposase YhgA family protein  48.97 
 
 
302 aa  291  8e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0911  putative transposase YhgA family protein  49.31 
 
 
298 aa  291  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3046  transposase  49.65 
 
 
282 aa  289  3e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131132  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0065  hypothetical protein  47.74 
 
 
313 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0980043  hitchhiker  0.0000000385113 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1547  putative transposase YhgA family protein  47.35 
 
 
288 aa  267  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.738107  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3432  putative transposase YhgA family protein  51.38 
 
 
218 aa  232  6e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0136  hypothetical protein  48.52 
 
 
238 aa  231  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04171  hypothetical protein  62.22 
 
 
135 aa  186  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04170  hypothetical protein  63.11 
 
 
103 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.858892  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0894  hypothetical protein  27.24 
 
 
308 aa  120  3e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.284853 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2398  hypothetical protein  91.8 
 
 
61 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1306  hypothetical protein  27.8 
 
 
275 aa  109  5e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3166  putative transposase YhgA family protein  27.85 
 
 
317 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2880  hypothetical protein  30.04 
 
 
323 aa  102  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.149752  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0628  hypothetical protein  28.57 
 
 
327 aa  101  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.939458  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1250  hypothetical protein  28.52 
 
 
331 aa  100  4e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4924  hypothetical protein  42.96 
 
 
170 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.414279  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2698  hypothetical protein  27.97 
 
 
318 aa  95.5  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2623  hypothetical protein  30 
 
 
322 aa  95.5  9e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0276584  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2781  hypothetical protein  26.85 
 
 
314 aa  93.6  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.664556  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2547  hypothetical protein  30.63 
 
 
314 aa  92.4  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0376053  normal  0.0608447 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1034  hypothetical protein  25.36 
 
 
312 aa  91.3  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2863  hypothetical protein  27.21 
 
 
322 aa  88.6  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.113899 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0147  hypothetical protein  35.25 
 
 
141 aa  87.4  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.320665  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1722  hypothetical protein  24.16 
 
 
308 aa  84.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000483242  normal  0.789674 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2960  putative transposase  27.74 
 
 
329 aa  80.9  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.26307  normal  0.0520741 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2785  hypothetical protein  26.07 
 
 
310 aa  80.1  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1059  putative transposase  27.84 
 
 
329 aa  79.3  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6237  putative transposase  25.99 
 
 
345 aa  78.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.62735  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2902  putative transposase  27.36 
 
 
335 aa  78.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0802  putative transposase  28.16 
 
 
333 aa  78.2  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1089  putative transposase  27.08 
 
 
337 aa  77.8  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.693638  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1121  hypothetical protein  25.74 
 
 
314 aa  75.9  0.0000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1543  hypothetical protein  26.59 
 
 
323 aa  75.1  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>