151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1150 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1150  putative transposase  100 
 
 
330 aa  662    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2960  putative transposase  90 
 
 
329 aa  563  1.0000000000000001e-159  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.26307  normal  0.0520741 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0878  putative transposase  93.91 
 
 
321 aa  555  1e-157  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110546  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0990  putative transposase  92.31 
 
 
321 aa  543  1e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.271034  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1059  putative transposase  88.75 
 
 
329 aa  525  1e-148  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1089  putative transposase  85.06 
 
 
337 aa  516  1.0000000000000001e-145  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.693638  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0802  putative transposase  84.57 
 
 
333 aa  511  1e-144  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6237  putative transposase  76.79 
 
 
345 aa  504  1e-141  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.62735  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2902  putative transposase  75.31 
 
 
335 aa  483  1e-135  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2828  putative transposase  50.16 
 
 
338 aa  265  8e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.949777  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2880  hypothetical protein  41.46 
 
 
323 aa  224  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.149752  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2698  hypothetical protein  31.37 
 
 
318 aa  140  3.9999999999999997e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2785  hypothetical protein  30.57 
 
 
310 aa  136  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2623  hypothetical protein  29.45 
 
 
322 aa  135  9e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0276584  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2781  hypothetical protein  30.75 
 
 
314 aa  134  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.664556  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2547  hypothetical protein  31.38 
 
 
314 aa  124  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0376053  normal  0.0608447 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2863  hypothetical protein  29.14 
 
 
322 aa  118  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.113899 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1963  putative transposase  27.44 
 
 
331 aa  118  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0706346  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1045  putative transposase  26.45 
 
 
343 aa  117  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0831423  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1034  hypothetical protein  26.13 
 
 
312 aa  117  3e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1994  putative transposase  26.79 
 
 
319 aa  110  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.735151 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0523  hypothetical protein  32.63 
 
 
311 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0894  hypothetical protein  31 
 
 
308 aa  104  3e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.284853 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3166  putative transposase YhgA family protein  30.3 
 
 
317 aa  103  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0691  putative transposase  89.29 
 
 
67 aa  103  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.76792  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2830  hypothetical protein  83.33 
 
 
85 aa  101  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.362282  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0529  hypothetical protein  32.63 
 
 
311 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0539  hypothetical protein  32.28 
 
 
311 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0045  hypothetical protein  28.21 
 
 
341 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.242935 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0520  hypothetical protein  32.03 
 
 
307 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1108  putative transposase  25.66 
 
 
339 aa  98.6  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2307  hypothetical protein  29.95 
 
 
321 aa  99  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000450312  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0492  hypothetical protein  23.51 
 
 
312 aa  98.2  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3726  putative transposase  29.93 
 
 
310 aa  96.3  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2289  hypothetical protein  36.15 
 
 
333 aa  95.5  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0492229  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0068  putative transposase  29.39 
 
 
296 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.565138  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0628  hypothetical protein  25.16 
 
 
327 aa  94.7  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.939458  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0149  hypothetical protein  24.15 
 
 
298 aa  93.2  5e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00561727  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2267  hypothetical protein  32.26 
 
 
360 aa  89.4  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1250  hypothetical protein  24.05 
 
 
331 aa  89  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1247  hypothetical protein  22.59 
 
 
336 aa  88.2  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3445  hypothetical protein  28.72 
 
 
296 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.143681  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0135  hypothetical protein  28.42 
 
 
300 aa  87  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0125  hypothetical protein  28.52 
 
 
298 aa  87  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0141  hypothetical protein  28.07 
 
 
298 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1351  putative transposase YhgA family protein  29.82 
 
 
296 aa  86.7  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0581087  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1347  putative transposase YhgA family protein  29.82 
 
 
296 aa  86.7  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0644465  normal  0.765955 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00131  predicted transposase  28.07 
 
 
300 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3470  putative transposase YhgA family protein  28.07 
 
 
300 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0086  putative transposase  29.35 
 
 
319 aa  86.3  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.864811  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0084  hypothetical protein  29.35 
 
 
319 aa  86.3  7e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4129  putative transposase YhgA family protein  29.35 
 
 
319 aa  86.3  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.683023  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3527  putative transposase YhgA family protein  28.07 
 
 
300 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.653665  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00130  hypothetical protein  28.07 
 
 
300 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.969091  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02230  hypothetical protein  29.45 
 
 
296 aa  85.9  9e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.326611  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02190  hypothetical protein  29.45 
 
 
296 aa  85.9  9e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.428095  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0911  putative transposase YhgA family protein  28.71 
 
 
298 aa  85.9  9e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2599  hypothetical protein  29.45 
 
 
296 aa  85.9  9e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00513302  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1504  putative transposase  30.93 
 
 
350 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1702  hypothetical protein  29.69 
 
 
326 aa  85.5  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.412934  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0740  hypothetical protein  27.43 
 
 
323 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.559811  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4766  hypothetical protein  29.45 
 
 
334 aa  85.5  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0238  hypothetical protein  31.07 
 
 
344 aa  84.7  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.447255  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1411  hypothetical protein  30.54 
 
 
312 aa  85.1  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.27197 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0658  putative transposase  29.89 
 
 
332 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000193277 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4885  hypothetical protein  28.71 
 
 
318 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287711  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1400  putative transposase  29.61 
 
 
301 aa  84  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0429556  normal  0.22922 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2461  hypothetical protein  29.68 
 
 
300 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.171355  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1398  putative transposase  29.61 
 
 
289 aa  84  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4072  putative transposase  33.54 
 
 
340 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0142  ISNCY family transposase  27.38 
 
 
306 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0065  hypothetical protein  33.5 
 
 
313 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0980043  hitchhiker  0.0000000385113 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4059  putative transposase  33.33 
 
 
332 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.860661 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4014  putative transposase  33.54 
 
 
332 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.456112  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1406  hypothetical protein  28.23 
 
 
299 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.286093  normal  0.84386 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1399  putative transposase  28.95 
 
 
293 aa  81.6  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.213871 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2386  hypothetical protein  28.04 
 
 
300 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4566  hypothetical protein  29.92 
 
 
314 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2542  hypothetical protein  27.89 
 
 
300 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2397  hypothetical protein  29.21 
 
 
319 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2627  hypothetical protein  27.89 
 
 
300 aa  81.3  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4028  putative transposase  32.92 
 
 
340 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1543  hypothetical protein  23.97 
 
 
323 aa  81.3  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1415  putative transposase YhgA family protein  27.89 
 
 
299 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.571537  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0147  hypothetical protein  33.33 
 
 
141 aa  80.9  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.320665  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3382  hypothetical protein  27.3 
 
 
308 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04207  predicted transposase  30.67 
 
 
255 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4159  hypothetical protein  29.43 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.241117  normal  0.413105 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4045  hypothetical protein  29.02 
 
 
309 aa  80.1  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.673826  normal  0.0374243 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4096  hypothetical protein  29.43 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3973  hypothetical protein  29.02 
 
 
309 aa  80.1  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3991  hypothetical protein  29.43 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3724  putative transposase YhgA family protein  29.55 
 
 
314 aa  79.7  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1121  hypothetical protein  24.6 
 
 
314 aa  79.7  0.00000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02170  hypothetical protein  27.7 
 
 
300 aa  79.3  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02129  hypothetical protein  27.7 
 
 
282 aa  79.3  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04729  hypothetical protein  28.52 
 
 
309 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1606  hypothetical protein  23.77 
 
 
307 aa  78.6  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1309  hypothetical protein  24.52 
 
 
328 aa  77.8  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1572  hypothetical protein  22 
 
 
311 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>