185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0029 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0029  transposase  100 
 
 
320 aa  662    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0039  transposase  85.94 
 
 
316 aa  572  1.0000000000000001e-162  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3046  transposase  90.82 
 
 
282 aa  544  1e-154  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131132  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0086  putative transposase  56.15 
 
 
319 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.864811  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0599  putative transposase YhgA family protein  55.59 
 
 
318 aa  375  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0084  hypothetical protein  56.15 
 
 
319 aa  375  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4129  putative transposase YhgA family protein  56.15 
 
 
319 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.683023  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3878  hypothetical protein  52.19 
 
 
308 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3710  hypothetical protein  50.94 
 
 
304 aa  362  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0122  putative transposase  55.14 
 
 
313 aa  362  4e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  1.2156300000000001e-29 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3726  putative transposase  54.26 
 
 
310 aa  362  5.0000000000000005e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3782  hypothetical protein  50.62 
 
 
304 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3707  hypothetical protein  50.62 
 
 
304 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3816  hypothetical protein  50.31 
 
 
304 aa  359  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.792275 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04729  hypothetical protein  58.65 
 
 
309 aa  355  5e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4851  hypothetical protein  51.71 
 
 
321 aa  354  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4776  hypothetical protein  52.34 
 
 
317 aa  350  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4874  hypothetical protein  51.71 
 
 
317 aa  348  5e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.702519 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2397  hypothetical protein  50.16 
 
 
319 aa  342  4e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3973  hypothetical protein  49.84 
 
 
309 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4045  hypothetical protein  49.84 
 
 
309 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.673826  normal  0.0374243 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0302  putative transposase YhgA family protein  52.35 
 
 
292 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.78914  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0539  hypothetical protein  50.96 
 
 
311 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3792  hypothetical protein  52.35 
 
 
292 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0529  hypothetical protein  50.96 
 
 
311 aa  336  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0523  hypothetical protein  50.96 
 
 
311 aa  335  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3382  hypothetical protein  50 
 
 
308 aa  335  5e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3886  hypothetical protein  52.35 
 
 
292 aa  335  7e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03263  predicted transposase  52.04 
 
 
292 aa  335  7.999999999999999e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.100095  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03215  hypothetical protein  52.04 
 
 
292 aa  335  7.999999999999999e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0821559  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3608  hypothetical protein  52.04 
 
 
292 aa  335  7.999999999999999e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0302  hypothetical protein  52.04 
 
 
292 aa  335  7.999999999999999e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.094929  normal  0.0909002 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3692  hypothetical protein  52.04 
 
 
292 aa  334  1e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0520  hypothetical protein  50.64 
 
 
307 aa  333  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4096  hypothetical protein  51.4 
 
 
313 aa  331  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3991  hypothetical protein  51.4 
 
 
313 aa  331  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4159  hypothetical protein  51.4 
 
 
313 aa  331  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.241117  normal  0.413105 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4718  hypothetical protein  51.1 
 
 
292 aa  330  2e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2542  hypothetical protein  50 
 
 
300 aa  329  3e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2627  hypothetical protein  50 
 
 
300 aa  329  3e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02170  hypothetical protein  49.69 
 
 
300 aa  324  1e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2386  hypothetical protein  49.69 
 
 
300 aa  324  1e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1406  hypothetical protein  48.89 
 
 
299 aa  320  3e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.286093  normal  0.84386 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2461  hypothetical protein  46.88 
 
 
300 aa  317  1e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.171355  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02129  hypothetical protein  54.34 
 
 
282 aa  316  3e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02230  hypothetical protein  46.88 
 
 
296 aa  316  4e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.326611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2599  hypothetical protein  46.88 
 
 
296 aa  316  4e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00513302  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02190  hypothetical protein  46.88 
 
 
296 aa  316  4e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.428095  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1351  putative transposase YhgA family protein  46.88 
 
 
296 aa  315  6e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0581087  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1347  putative transposase YhgA family protein  46.88 
 
 
296 aa  315  6e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0644465  normal  0.765955 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4885  hypothetical protein  46.69 
 
 
318 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287711  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1415  putative transposase YhgA family protein  48.25 
 
 
299 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.571537  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4766  hypothetical protein  46.06 
 
 
334 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3445  hypothetical protein  45.94 
 
 
296 aa  309  5e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.143681  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4566  hypothetical protein  47 
 
 
314 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0068  putative transposase  48.91 
 
 
296 aa  298  6e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.565138  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04207  predicted transposase  52.99 
 
 
255 aa  295  5e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3724  putative transposase YhgA family protein  45.11 
 
 
314 aa  291  9e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2727  putative transposase YhgA family protein  47.49 
 
 
310 aa  290  2e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00131  predicted transposase  48.99 
 
 
300 aa  286  4e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3470  putative transposase YhgA family protein  48.99 
 
 
300 aa  286  4e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00130  hypothetical protein  48.99 
 
 
300 aa  286  4e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.969091  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3527  putative transposase YhgA family protein  48.99 
 
 
300 aa  286  4e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.653665  normal 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0065  hypothetical protein  48.6 
 
 
313 aa  285  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0980043  hitchhiker  0.0000000385113 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0125  hypothetical protein  48.32 
 
 
298 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0141  hypothetical protein  47.99 
 
 
298 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0135  hypothetical protein  45.37 
 
 
300 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0142  ISNCY family transposase  48.37 
 
 
306 aa  281  1e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1547  putative transposase YhgA family protein  44.63 
 
 
288 aa  279  4e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.738107  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1429  putative transposase YhgA family protein  43.97 
 
 
302 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0911  putative transposase YhgA family protein  42.86 
 
 
298 aa  265  5.999999999999999e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3432  putative transposase YhgA family protein  50.43 
 
 
218 aa  239  5e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0136  hypothetical protein  45.83 
 
 
238 aa  209  6e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04171  hypothetical protein  48.09 
 
 
135 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3166  putative transposase YhgA family protein  29.28 
 
 
317 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04170  hypothetical protein  61.17 
 
 
103 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.858892  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0894  hypothetical protein  26.96 
 
 
308 aa  127  3e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.284853 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1306  hypothetical protein  27.51 
 
 
275 aa  125  1e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2863  hypothetical protein  29.15 
 
 
322 aa  119  7.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.113899 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2623  hypothetical protein  28.81 
 
 
322 aa  118  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0276584  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2698  hypothetical protein  28.81 
 
 
318 aa  111  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1045  putative transposase  30.32 
 
 
343 aa  110  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0831423  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1250  hypothetical protein  26.84 
 
 
331 aa  108  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2547  hypothetical protein  29.02 
 
 
314 aa  107  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0376053  normal  0.0608447 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2781  hypothetical protein  28.87 
 
 
314 aa  107  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.664556  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2880  hypothetical protein  28.81 
 
 
323 aa  106  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.149752  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6237  putative transposase  28.47 
 
 
345 aa  99.4  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.62735  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0628  hypothetical protein  26.13 
 
 
327 aa  95.9  9e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.939458  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1702  hypothetical protein  29.11 
 
 
326 aa  95.5  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.412934  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1108  putative transposase  29.32 
 
 
339 aa  94.7  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1089  putative transposase  26.44 
 
 
337 aa  92.4  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.693638  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2902  putative transposase  29.24 
 
 
335 aa  92  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0238  hypothetical protein  25.67 
 
 
344 aa  91.3  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.447255  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2785  hypothetical protein  24.45 
 
 
310 aa  89.7  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1963  putative transposase  27.69 
 
 
331 aa  89.4  8e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0706346  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1722  hypothetical protein  27.89 
 
 
308 aa  89  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000483242  normal  0.789674 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2289  hypothetical protein  25.84 
 
 
333 aa  87.8  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0492229  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0409  hypothetical protein  25.15 
 
 
336 aa  86.3  7e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.650641  hitchhiker  0.00708611 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2960  putative transposase  27.82 
 
 
329 aa  85.5  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.26307  normal  0.0520741 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2153  hypothetical protein  25.3 
 
 
332 aa  84.3  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.101261 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>