41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3289 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3289  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  655    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00577897 
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5617  hypothetical protein  48.01 
 
 
302 aa  291  8e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0277  hypothetical protein  42.33 
 
 
295 aa  243  3e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77254  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4509  hypothetical protein  41.11 
 
 
303 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4405  hypothetical protein  42.62 
 
 
305 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3467  hypothetical protein  39.79 
 
 
301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.432253  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1673  hypothetical protein  38.92 
 
 
206 aa  129  7.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2227  hypothetical protein  51.49 
 
 
92 aa  93.6  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.32475  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2930  hypothetical protein  53.03 
 
 
131 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1045  putative transposase  42.05 
 
 
343 aa  65.1  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0831423  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0354  hypothetical protein  75.61 
 
 
294 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0361  hypothetical protein  75.61 
 
 
294 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.926631  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4928  hypothetical protein  46.58 
 
 
315 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.443955 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5118  hypothetical protein  38.16 
 
 
291 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.469414  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0464  hypothetical protein  63.16 
 
 
278 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.188518 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0451  hypothetical protein  63.16 
 
 
278 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4394  helicase domain-containing protein  70.97 
 
 
1140 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1248  hypothetical protein  41.67 
 
 
330 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.442555 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2623  hypothetical protein  54.9 
 
 
322 aa  49.3  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0276584  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2950  hypothetical protein  50.94 
 
 
334 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0249458  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0181  hypothetical protein  37.84 
 
 
325 aa  48.9  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000266297  normal  0.396651 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1862  hypothetical protein  54.76 
 
 
280 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1422  hypothetical protein  33.33 
 
 
161 aa  48.5  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3726  putative transposase  41.18 
 
 
310 aa  47.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2863  hypothetical protein  60.53 
 
 
322 aa  46.2  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.113899 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3180  hypothetical protein  60.61 
 
 
102 aa  46.2  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.534154  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1225  hypothetical protein  38.89 
 
 
339 aa  45.8  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0829025 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1223  hypothetical protein  38.89 
 
 
339 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0862091 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5306  hypothetical protein  38.3 
 
 
308 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939469  normal  0.0565222 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3181  hypothetical protein  42.62 
 
 
307 aa  45.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.913856  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6237  putative transposase  42.31 
 
 
345 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.62735  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1702  hypothetical protein  60.61 
 
 
326 aa  44.3  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.412934  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1963  putative transposase  33.01 
 
 
331 aa  43.9  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0706346  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1349  hypothetical protein  39.13 
 
 
166 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072063  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2384  hypothetical protein  43.9 
 
 
325 aa  44.3  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000252943  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3230  hypothetical protein  39.74 
 
 
326 aa  43.9  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593282  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1178  hypothetical protein  48 
 
 
314 aa  43.5  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2754  hypothetical protein  29.51 
 
 
275 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1543  hypothetical protein  34.21 
 
 
323 aa  43.1  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3348  hypothetical protein  29.51 
 
 
272 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.301153 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1608  hypothetical protein  53.85 
 
 
306 aa  42.4  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000774697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>