30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3180 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3180  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  197  3.9999999999999996e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.534154  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3181  hypothetical protein  88.24 
 
 
307 aa  171  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.913856  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3768  hypothetical protein  44.57 
 
 
83 aa  74.7  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3769  hypothetical protein  59.09 
 
 
277 aa  69.3  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4037  hypothetical protein  59.57 
 
 
87 aa  57.4  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2360  hypothetical protein  43.08 
 
 
85 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4799  hypothetical protein  53.19 
 
 
295 aa  53.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4053  hypothetical protein  54.05 
 
 
295 aa  51.6  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4052  hypothetical protein  50.98 
 
 
95 aa  51.2  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2839  hypothetical protein  42.37 
 
 
296 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.350671  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4928  hypothetical protein  45.61 
 
 
315 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.443955 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0181  hypothetical protein  33.72 
 
 
325 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000266297  normal  0.396651 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3289  hypothetical protein  60.61 
 
 
324 aa  46.2  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00577897 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0679  hypothetical protein  42.62 
 
 
309 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0517  conserved hypothetical cytosolic protein  33.33 
 
 
339 aa  45.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2384  hypothetical protein  64.71 
 
 
325 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000252943  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2623  hypothetical protein  41.43 
 
 
322 aa  45.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0276584  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1248  hypothetical protein  36.99 
 
 
330 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.442555 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1567a  hypothetical cytosolic protein  35.29 
 
 
335 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.203402  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6237  putative transposase  37.35 
 
 
345 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.62735  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0272  hypothetical protein  32.91 
 
 
310 aa  42.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.514892 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0361  hypothetical protein  55.26 
 
 
294 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.926631  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0757  hypothetical protein  35.71 
 
 
226 aa  43.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0354  hypothetical protein  55.26 
 
 
294 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5118  hypothetical protein  47.37 
 
 
291 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.469414  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1543  hypothetical protein  26.83 
 
 
323 aa  42  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1963  putative transposase  30.12 
 
 
331 aa  41.6  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0706346  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0492  hypothetical protein  29.17 
 
 
312 aa  41.2  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2285  hypothetical protein  31.65 
 
 
288 aa  41.2  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1326  flagellar assembly protein H  51.35 
 
 
375 aa  40  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>