30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4052 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4052  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  181  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4053  hypothetical protein  94.74 
 
 
295 aa  136  7.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3181  hypothetical protein  55.13 
 
 
307 aa  83.6  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.913856  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3180  hypothetical protein  48.89 
 
 
102 aa  81.3  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.534154  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2839  hypothetical protein  55.17 
 
 
296 aa  65.5  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.350671  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3768  hypothetical protein  45.31 
 
 
83 aa  56.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0181  hypothetical protein  38.55 
 
 
325 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000266297  normal  0.396651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2360  hypothetical protein  39.39 
 
 
85 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1862  hypothetical protein  47.27 
 
 
280 aa  50.4  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5118  hypothetical protein  41.67 
 
 
291 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.469414  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0272  hypothetical protein  35.87 
 
 
310 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.514892 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0451  hypothetical protein  49.09 
 
 
278 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0464  hypothetical protein  49.09 
 
 
278 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.188518 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3769  hypothetical protein  45.16 
 
 
277 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4037  hypothetical protein  48.94 
 
 
87 aa  47  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4799  hypothetical protein  43.75 
 
 
295 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4928  hypothetical protein  46.43 
 
 
315 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.443955 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6237  putative transposase  37.08 
 
 
345 aa  44.3  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.62735  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2623  hypothetical protein  37.08 
 
 
322 aa  44.3  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0276584  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0354  hypothetical protein  52.63 
 
 
294 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0361  hypothetical protein  52.63 
 
 
294 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.926631  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3289  hypothetical protein  66.67 
 
 
324 aa  43.9  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00577897 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0492  hypothetical protein  31.94 
 
 
312 aa  43.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2902  putative transposase  38.82 
 
 
335 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0954  hypothetical protein  31.43 
 
 
150 aa  42.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372234  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2863  hypothetical protein  57.58 
 
 
322 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.113899 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1128  hypothetical protein  29.21 
 
 
328 aa  41.6  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2950  hypothetical protein  48.78 
 
 
334 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0249458  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1963  putative transposase  30.23 
 
 
331 aa  40.4  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0706346  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0517  conserved hypothetical cytosolic protein  34.62 
 
 
339 aa  40.4  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>