82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1249 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1249  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  297  5e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1248  hypothetical protein  89.41 
 
 
330 aa  283  4e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.442555 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1348  hypothetical protein  93.63 
 
 
318 aa  281  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0527396  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1349  hypothetical protein  89.7 
 
 
166 aa  276  5e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072063  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2274  hypothetical protein  39.74 
 
 
315 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1193  hypothetical protein  37.25 
 
 
317 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1222  hypothetical protein  37.84 
 
 
313 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3426  hypothetical protein  44.3 
 
 
311 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0681  hypothetical protein  39.46 
 
 
304 aa  88.2  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000573749  unclonable  0.0000000126403 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0564  hypothetical protein  35.62 
 
 
302 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0181  hypothetical protein  31.51 
 
 
325 aa  75.5  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000266297  normal  0.396651 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3564  hypothetical protein  38.61 
 
 
94 aa  74.3  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0951658  normal  0.295077 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0174  hypothetical protein  31.88 
 
 
317 aa  73.9  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.384261  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3368  hypothetical protein  36.21 
 
 
297 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3206  hypothetical protein  34.62 
 
 
284 aa  71.6  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.488157  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4879  hypothetical protein  41.11 
 
 
196 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4509  hypothetical protein  39.47 
 
 
303 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3060  hypothetical protein  31.3 
 
 
280 aa  62.8  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4873  hypothetical protein  47.14 
 
 
286 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1306  hypothetical protein  34.69 
 
 
283 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1707  hypothetical protein  38.14 
 
 
280 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.420351  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3228  hypothetical protein  33.09 
 
 
152 aa  61.2  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000432911  normal  0.0886646 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0749  hypothetical protein  30.16 
 
 
122 aa  59.3  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000564338  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5125  hypothetical protein  33.71 
 
 
310 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3230  hypothetical protein  36.76 
 
 
326 aa  55.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593282  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0368  hypothetical protein  38.81 
 
 
287 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.730391  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5391  hypothetical protein  38.16 
 
 
70 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.566383  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2187  hypothetical protein  38.71 
 
 
290 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3232  hypothetical protein  36.76 
 
 
382 aa  54.7  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3231  hypothetical protein  36.76 
 
 
382 aa  55.1  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1221  hypothetical protein  31.25 
 
 
292 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1818  hypothetical protein  42.03 
 
 
280 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0320519  normal  0.937622 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0655  hypothetical protein  33.68 
 
 
300 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2808  hypothetical protein  32.43 
 
 
85 aa  52.8  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.118486  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1061  hypothetical protein  31.62 
 
 
311 aa  52  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000000000109934  normal  0.0587349 
 
 
 
NC_013411  GYMC61_1182  hypothetical protein  34.41 
 
 
304 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2793  hypothetical protein  35.48 
 
 
301 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2918  hypothetical protein  46.77 
 
 
94 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2781  hypothetical protein  32.67 
 
 
314 aa  51.2  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.664556  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1063  hypothetical protein  39.24 
 
 
82 aa  51.2  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000000299029  normal  0.0436362 
 
 
 
NC_007413  Ava_1071  hypothetical protein  49.12 
 
 
294 aa  50.4  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.05102 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1883  hypothetical protein  45.45 
 
 
80 aa  50.4  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.812855 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1062  hypothetical protein  41.33 
 
 
75 aa  50.1  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144683  normal  0.0450083 
 
 
 
NC_014248  Aazo_3597  hypothetical protein  56.1 
 
 
58 aa  49.3  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4928  hypothetical protein  37.14 
 
 
315 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.443955 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1739  hypothetical cytosolic protein  29.08 
 
 
312 aa  49.3  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2786  hypothetical protein  34.41 
 
 
340 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3814  hypothetical protein  43.48 
 
 
261 aa  47.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.04819  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1045  putative transposase  35.82 
 
 
343 aa  47.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0831423  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3554  hypothetical protein  30.84 
 
 
276 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0248  hypothetical cytosolic protein  32.04 
 
 
138 aa  47.8  0.00006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2559  hypothetical protein  30.84 
 
 
276 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.789765  normal  0.602087 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1946  hypothetical protein  32.04 
 
 
138 aa  47.8  0.00006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000308535  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0257  hypothetical protein  30.77 
 
 
306 aa  47.4  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1257  hypothetical protein  29.29 
 
 
324 aa  47.4  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4405  hypothetical protein  43.14 
 
 
305 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2698  hypothetical protein  30.48 
 
 
318 aa  47.4  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1994  putative transposase  35.14 
 
 
319 aa  47  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.735151 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2379  hypothetical protein  29.41 
 
 
320 aa  47  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1963  putative transposase  30.23 
 
 
331 aa  46.2  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0706346  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6237  putative transposase  45.16 
 
 
345 aa  46.2  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.62735  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2497  hypothetical protein  30.56 
 
 
309 aa  45.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2960  putative transposase  38.75 
 
 
329 aa  45.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.26307  normal  0.0520741 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1243  hypothetical protein  30.97 
 
 
288 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2348  hypothetical protein  27.82 
 
 
201 aa  44.7  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0167  hypothetical protein  39.22 
 
 
290 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3810  hypothetical protein  33.96 
 
 
274 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00863066  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1089  putative transposase  41.94 
 
 
337 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.693638  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4234  hypothetical protein  34.62 
 
 
59 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000176119 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1542  hypothetical protein  33.33 
 
 
275 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.966764  normal  0.0160527 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1515  hypothetical protein  33.33 
 
 
275 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2623  hypothetical protein  36.51 
 
 
322 aa  43.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0276584  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1410  hypothetical protein  39.44 
 
 
235 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1121  hypothetical protein  26.6 
 
 
314 aa  42.7  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5118  hypothetical protein  32.39 
 
 
291 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.469414  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1699  hypothetical protein  32.76 
 
 
288 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2442  hypothetical protein  32.14 
 
 
296 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.888337  hitchhiker  0.000000122281 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1724  hypothetical protein  27.54 
 
 
280 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.377801  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5057  hypothetical protein  33.33 
 
 
86 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206595 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1250  hypothetical protein  33.98 
 
 
331 aa  41.2  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5809  hypothetical protein  29.2 
 
 
284 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3467  hypothetical protein  29.41 
 
 
301 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.432253  normal  0.840048 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>