58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0749 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0749  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  241  3e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000564338  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0564  hypothetical protein  48.7 
 
 
302 aa  110  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0681  hypothetical protein  45.54 
 
 
304 aa  106  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000573749  unclonable  0.0000000126403 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0257  hypothetical protein  77.78 
 
 
306 aa  100  7e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0174  hypothetical protein  39.06 
 
 
317 aa  98.2  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.384261  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0181  hypothetical protein  37.5 
 
 
325 aa  96.7  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000266297  normal  0.396651 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1222  hypothetical protein  34.13 
 
 
313 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1193  hypothetical protein  33.08 
 
 
317 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2274  hypothetical protein  32.06 
 
 
315 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0655  hypothetical protein  38.14 
 
 
300 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3368  hypothetical protein  50 
 
 
297 aa  72  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1182  hypothetical protein  36.07 
 
 
304 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2786  hypothetical protein  52.24 
 
 
340 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1249  hypothetical protein  30.16 
 
 
154 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3426  hypothetical protein  29.46 
 
 
311 aa  68.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3228  hypothetical protein  33.87 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000432911  normal  0.0886646 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1348  hypothetical protein  28.46 
 
 
318 aa  67  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0527396  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1221  hypothetical protein  36.36 
 
 
292 aa  66.2  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3206  hypothetical protein  39.05 
 
 
284 aa  65.5  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.488157  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1707  hypothetical protein  52.94 
 
 
280 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.420351  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1349  hypothetical protein  27.54 
 
 
166 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072063  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1306  hypothetical protein  39.74 
 
 
283 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1248  hypothetical protein  27.46 
 
 
330 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.442555 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2793  hypothetical protein  49.25 
 
 
301 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2808  hypothetical protein  31.43 
 
 
85 aa  56.6  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.118486  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1963  putative transposase  34.38 
 
 
331 aa  56.6  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0706346  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2187  hypothetical protein  50.75 
 
 
290 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2781  hypothetical protein  30.77 
 
 
314 aa  54.3  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.664556  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3564  hypothetical protein  23.71 
 
 
94 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0951658  normal  0.295077 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1994  putative transposase  35.71 
 
 
319 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.735151 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4879  hypothetical protein  30.77 
 
 
196 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2698  hypothetical protein  40.68 
 
 
318 aa  51.2  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2623  hypothetical protein  40.68 
 
 
322 aa  51.2  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0276584  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2785  hypothetical protein  39.66 
 
 
310 aa  50.4  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1243  hypothetical protein  32.91 
 
 
288 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0807  hypothetical protein  34.85 
 
 
279 aa  48.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2379  hypothetical protein  39.66 
 
 
320 aa  47.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4873  hypothetical protein  33.33 
 
 
286 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2497  hypothetical protein  29.03 
 
 
309 aa  47  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1045  putative transposase  40.68 
 
 
343 aa  47.4  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0831423  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3230  hypothetical protein  33.33 
 
 
326 aa  44.7  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593282  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3231  hypothetical protein  33.33 
 
 
382 aa  44.7  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3232  hypothetical protein  33.33 
 
 
382 aa  44.7  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1739  hypothetical cytosolic protein  28.07 
 
 
312 aa  44.7  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0517  conserved hypothetical cytosolic protein  40.68 
 
 
339 aa  44.3  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3060  hypothetical protein  26.98 
 
 
280 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2559  hypothetical protein  30 
 
 
276 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.789765  normal  0.602087 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3554  hypothetical protein  30 
 
 
276 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1061  hypothetical protein  28.83 
 
 
311 aa  43.5  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000000000109934  normal  0.0587349 
 
 
 
NC_011060  Ppha_2348  hypothetical protein  36.21 
 
 
201 aa  42.7  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1818  hypothetical protein  31.43 
 
 
280 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0320519  normal  0.937622 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0368  hypothetical protein  26.6 
 
 
287 aa  41.6  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.730391  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1108  putative transposase  42.37 
 
 
339 aa  41.6  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0167  hypothetical protein  41.3 
 
 
290 aa  41.2  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1257  hypothetical protein  35.09 
 
 
324 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2345  hypothetical protein  27.83 
 
 
206 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.387086  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5118  hypothetical protein  25.4 
 
 
291 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.469414  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2547  hypothetical protein  29.81 
 
 
314 aa  40.4  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0376053  normal  0.0608447 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>