43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0624 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0624  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  270  5.000000000000001e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0436757  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1257  hypothetical protein  57.5 
 
 
324 aa  93.6  8e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2379  hypothetical protein  58.75 
 
 
320 aa  89.7  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2348  hypothetical protein  50 
 
 
201 aa  80.9  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1248  hypothetical protein  53.26 
 
 
336 aa  80.1  0.000000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2183  hypothetical protein  58.75 
 
 
320 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2345  hypothetical protein  51.25 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.387086  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1399  hypothetical protein  47.56 
 
 
211 aa  72  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0266105  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0599  hypothetical protein  51.19 
 
 
319 aa  70.5  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0596  hypothetical protein  54.29 
 
 
401 aa  67.4  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.320961  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1410  hypothetical protein  45.12 
 
 
235 aa  64.7  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0616  hypothetical protein  48.75 
 
 
384 aa  63.9  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.618084  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2698  hypothetical protein  42.31 
 
 
318 aa  62  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2623  hypothetical protein  44.29 
 
 
322 aa  60.1  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0276584  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2781  hypothetical protein  44.44 
 
 
314 aa  56.2  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.664556  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0607  hypothetical protein  71.88 
 
 
71 aa  54.3  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.231913  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2604  hypothetical protein  71.88 
 
 
77 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000657983  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1713  hypothetical protein  67.57 
 
 
81 aa  53.9  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.286402  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6237  putative transposase  38.57 
 
 
345 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.62735  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1739  hypothetical cytosolic protein  38.27 
 
 
312 aa  50.4  0.000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2863  hypothetical protein  42.86 
 
 
322 aa  50.4  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.113899 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3562  hypothetical protein  64.52 
 
 
73 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0263191 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1946  hypothetical protein  35.8 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000308535  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2880  hypothetical protein  45.9 
 
 
323 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.149752  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0248  hypothetical cytosolic protein  35.8 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1939  hypothetical protein  59.38 
 
 
102 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00984973  normal  0.824571 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1954  hypothetical protein  59.38 
 
 
102 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.522228 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2547  hypothetical protein  44.44 
 
 
314 aa  47.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0376053  normal  0.0608447 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2785  hypothetical protein  39.68 
 
 
310 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2152  hypothetical cytosolic protein  34.12 
 
 
325 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0026  hypothetical protein  34.12 
 
 
325 aa  45.4  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1089  putative transposase  37.31 
 
 
337 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.693638  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0802  putative transposase  36.51 
 
 
333 aa  45.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1108  putative transposase  38.57 
 
 
339 aa  44.3  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1348  hypothetical protein  39.24 
 
 
318 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0527396  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0517  conserved hypothetical cytosolic protein  29.17 
 
 
339 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0181  hypothetical protein  40 
 
 
325 aa  41.6  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000266297  normal  0.396651 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1045  putative transposase  33.72 
 
 
343 aa  40.8  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0831423  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0174  hypothetical protein  37.68 
 
 
317 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.384261  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1248  hypothetical protein  36.62 
 
 
330 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.442555 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1963  putative transposase  37.14 
 
 
331 aa  40.8  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0706346  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1059  putative transposase  38.98 
 
 
329 aa  40.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1349  hypothetical protein  37.35 
 
 
166 aa  40.4  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072063  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>