More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2475 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2475  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 445 aa  917    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.770034  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  28.94 
 
 		 363 aa  72  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2965  hypothetical protein  30.11 
 
 		 342 aa  71.2  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2815  hypothetical protein  29.67 
 
 		 341 aa  71.2  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  31.67 
 
 		 384 aa  71.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4049  glycosyl transferase group 1  28.94 
 
 		 363 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  30.72 
 
 		 411 aa  68.9  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0312  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 		 389 aa  68.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  30.9 
 
 		 417 aa  67.4  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3432  glycosyl transferase group 1  23.55 
 
 		 419 aa  67  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  30.9 
 
 		 417 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  24.91 
 
 		 414 aa  65.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  29 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  31.87 
 
 		 406 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29460  Glycosyl transferase, group 1  25.77 
 
 		 451 aa  63.9  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.565576  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1355  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.57 
 
 		 413 aa  63.9  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  35 
 
 		 374 aa  63.9  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  27.66 
 
 		 414 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 406 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  31.87 
 
 		 392 aa  62  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2186  glycosyl transferase group 1  26.97 
 
 		 378 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0781  galactosyltransferase  23.04 
 
 		 377 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176556  normal  0.0501278 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  30.62 
 
 		 421 aa  60.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 		 392 aa  60.1  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  29.3 
 
 		 403 aa  60.1  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 		 403 aa  60.1  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1089  glycosyl transferase group 1  35.77 
 
 		 381 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0606318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  29.7 
 
 		 373 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  24.24 
 
 		 536 aa  58.9  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0878  galactosyltransferase  22.12 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.184172 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4579  glycosyl transferase, group 1  27.75 
 
 		 398 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0122865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 		 418 aa  58.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3446  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.86 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3228  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.948731  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 		 379 aa  58.5  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1792  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 365 aa  58.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0177  glycosyl transferase group 1  29.22 
 
 		 445 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0643614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  27.8 
 
 		 398 aa  57.8  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3107  glycosyl transferase, group 1  29.36 
 
 		 452 aa  57.8  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  25.64 
 
 		 364 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0060  glycosyl transferase group 1  26.05 
 
 		 656 aa  57.8  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.19162  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14251  hypothetical protein  27.33 
 
 		 384 aa  57.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0241071  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  28.72 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1638  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 		 519 aa  57.4  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  33.12 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  31.21 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  25.58 
 
 		 415 aa  57  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  30.17 
 
 		 388 aa  57  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  29.29 
 
 		 350 aa  57  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0769  glycosyl transferase group 1  26.97 
 
 		 347 aa  57  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2695  glycosyl transferase, group 1  25.88 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  25.9 
 
 		 355 aa  56.6  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1188  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  29.49 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  28.52 
 
 		 406 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1445  glycosyl transferase group 1  31.98 
 
 		 379 aa  56.2  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000927133 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  28.52 
 
 		 406 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3740  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  26.09 
 
 		 349 aa  56.6  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.939916 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1597  glycosyl transferase group 1  29.49 
 
 		 406 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.308201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  33.05 
 
 		 416 aa  55.8  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0984  glycosyl transferase group 1  28.32 
 
 		 403 aa  56.2  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137415 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2336  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  29.44 
 
 		 406 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000162166  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  21.6 
 
 		 395 aa  56.6  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1613  glycosyl transferase group 1  29.49 
 
 		 406 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2208  glycosyl transferase group 1  30.51 
 
 		 403 aa  55.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 		 353 aa  55.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2957  glycosyl transferase group 1  27.38 
 
 		 435 aa  55.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2798  glycosyl transferase, group 1  29.51 
 
 		 390 aa  55.1  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6015  glycosyl transferase group 1  28 
 
 		 384 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.44691 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  25.26 
 
 		 388 aa  55.8  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1018  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  29.49 
 
 		 406 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  40.54 
 
 		 394 aa  55.5  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  23 
 
 		 412 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  25.96 
 
 		 415 aa  54.7  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  27.04 
 
 		 399 aa  54.7  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 		 366 aa  54.7  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3895  glycosyl transferase group 1  23.13 
 
 		 458 aa  55.1  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  27.63 
 
 		 385 aa  54.7  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 426 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  31.01 
 
 		 441 aa  54.3  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21730  glycogen synthase  29.05 
 
 		 404 aa  54.3  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4356  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 409 aa  54.7  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.784045 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  27.52 
 
 		 362 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.35 
 
 		 407 aa  54.3  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  29.6 
 
 		 406 aa  53.9  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1421  glycogen synthase  26.89 
 
 		 431 aa  53.9  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  30.04 
 
 		 406 aa  53.9  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2483  glycosyl transferase group 1  28.22 
 
 		 399 aa  53.9  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0486018 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2978  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  29.27 
 
 		 406 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  hitchhiker  0.000111113 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2263  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.67 
 
 		 377 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2594  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 		 421 aa  53.1  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5152  glycosyl transferase group 1  30.46 
 
 		 377 aa  53.1  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011173  decreased coverage  0.000105469 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2588  glycosyl transferase, group 1  27.55 
 
 		 426 aa  53.1  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3258  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 		 379 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4435  glycosyl transferase group 1  29.71 
 
 		 400 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  25.4 
 
 		 935 aa  53.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.55 
 
 		 388 aa  52.8  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2749  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 393 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000830011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>