More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0321 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0321  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  100 
 
 
425 aa  813    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.583446  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1800  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  89.28 
 
 
429 aa  676    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.916161 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2282  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  67.22 
 
 
425 aa  543  1e-153  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.335323 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2055  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  65.78 
 
 
436 aa  494  9.999999999999999e-139  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0650  NADH dehydrogenase (quinone)  35.16 
 
 
476 aa  194  3e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208373  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0519  NADH dehydrogenase (quinone)  33.95 
 
 
476 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0654  NADH dehydrogenase (quinone)  36.5 
 
 
474 aa  182  7e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1629  NADH dehydrogenase (quinone)  34.47 
 
 
476 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.22379  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1902  NADH dehydrogenase (quinone)  32.23 
 
 
1152 aa  171  2e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165011  normal  0.0801476 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1305  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  36.04 
 
 
1128 aa  160  4e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1086  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.09 
 
 
500 aa  157  3e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1281  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.82 
 
 
488 aa  130  3e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000193774 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0284  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit M  31.08 
 
 
517 aa  122  9e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000106102 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1304  NADH dehydrogenase (quinone)  39.33 
 
 
480 aa  99  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0700  NADH dehydrogenase (quinone)  36.13 
 
 
484 aa  99.4  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.452975  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1281  hydrogenase 4 subunit F  28.38 
 
 
538 aa  98.2  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0834276  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1822  hydrogenase membrane subunit  29.85 
 
 
643 aa  97.8  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0165692  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4571  hydrogenase 4 subunit F  27.78 
 
 
512 aa  97.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2712  hydrogenase 4 subunit F  28.72 
 
 
553 aa  97.4  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0587  NADH dehydrogenase (quinone)  27.6 
 
 
480 aa  95.1  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1127  hydrogenase membrane subunit  28.06 
 
 
649 aa  93.2  9e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0224903  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3121  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  29.93 
 
 
513 aa  92  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0441802  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1926  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  25.86 
 
 
522 aa  92  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.676502  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2620  hydrogenase 4 subunit F  26.49 
 
 
526 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1190  hydrogenase 4 subunit F  26.49 
 
 
526 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.647759 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2633  hydrogenase 4 subunit F  26.49 
 
 
526 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0184  NADH dehydrogenase (quinone)  27.76 
 
 
487 aa  90.1  6e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0645  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  27 
 
 
800 aa  90.1  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3708  hydrogenase 4 subunit F  26.49 
 
 
521 aa  90.1  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332962  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4288  NADH dehydrogenase (quinone)  31.85 
 
 
637 aa  90.1  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277072  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0660  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  27 
 
 
800 aa  90.1  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0122576  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02378  NADH dehydrogenase subunit N  26.16 
 
 
526 aa  89.7  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1183  NADH dehydrogenase (quinone)  26.16 
 
 
526 aa  89.7  9e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02340  hypothetical protein  26.16 
 
 
526 aa  89.7  9e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1252  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  29.76 
 
 
485 aa  89.7  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0107  NADH dehydrogenase (quinone)  29.97 
 
 
500 aa  88.2  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000249004 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2858  hydrogenase 4 subunit F  27.41 
 
 
517 aa  88.6  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3886  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  25.65 
 
 
560 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.590668 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1673  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34.64 
 
 
604 aa  88.2  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3836  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  25.65 
 
 
560 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3805  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.84 
 
 
969 aa  88.6  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.761799 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0609  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  27.34 
 
 
496 aa  88.2  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29860  NADH dehydrogenase subunit M  27.91 
 
 
509 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000573313  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1077  NADH dehydrogenase (quinone)  33.51 
 
 
430 aa  87.8  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00864791  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2796  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  27.18 
 
 
537 aa  87  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2558  NADH dehydrogenase subunit M  27.86 
 
 
509 aa  87  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3715  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  27.63 
 
 
952 aa  87  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.593151  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1691  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  27.97 
 
 
688 aa  87  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000143823  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3246  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  25.32 
 
 
509 aa  86.7  7e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1768  NADH dehydrogenase (quinone)  29.89 
 
 
792 aa  86.7  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1538  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.65 
 
 
953 aa  86.7  8e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0170317 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1453  hydrogenase subunit, HycC-like protein  27.68 
 
 
644 aa  85.9  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2882  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit M  25.12 
 
 
534 aa  85.9  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.139376  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4787  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.36 
 
 
475 aa  85.9  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0729  NADH dehydrogenase (quinone)  37.74 
 
 
512 aa  85.9  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0359188  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10561  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  28.62 
 
 
523 aa  85.1  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0108  hydrogenase 4 subunit F  27.8 
 
 
486 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1264  hydrogenase 4 subunit F  27.8 
 
 
463 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218764  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1614  hydrogenase 4 subunit F  27.8 
 
 
486 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1529  hydrogenase 4 subunit F  27.8 
 
 
486 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2806  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.03 
 
 
997 aa  84.7  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.448623 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2423  NADH dehydrogenase subunit M  27.81 
 
 
509 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.200315 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2709  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  28.44 
 
 
786 aa  84.7  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3241  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  26.41 
 
 
561 aa  84.3  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3532  NADH dehydrogenase (quinone)  25.96 
 
 
480 aa  84.3  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.563705  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0074  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  27.3 
 
 
765 aa  84.3  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0349  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit D4  26.26 
 
 
506 aa  84.3  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224429  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0511  NADH ubiquinone/plastoquinone complex subunit, putative  31.21 
 
 
488 aa  84  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  27.1 
 
 
662 aa  83.6  0.000000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.20305  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2871  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  26.4 
 
 
537 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0408599 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6068  hydrogenase 4 subunit F  27.76 
 
 
486 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0822285  hitchhiker  0.00325517 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1620  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  29.81 
 
 
503 aa  83.6  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0320  NADH dehydrogenase (quinone)  24.48 
 
 
531 aa  83.2  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2554  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  26.09 
 
 
650 aa  83.2  0.000000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0713  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  25.3 
 
 
509 aa  82.4  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.288184  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0931  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  29.36 
 
 
504 aa  82.4  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.743179  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1030  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  28.94 
 
 
511 aa  82.8  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1000  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.36 
 
 
785 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1638  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28.46 
 
 
452 aa  82.4  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0030  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.21 
 
 
973 aa  82  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3297  NADH dehydrogenase subunit M  25.13 
 
 
509 aa  81.6  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.416453 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4211  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  31.93 
 
 
555 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1109  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  28.43 
 
 
505 aa  82  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2102  NADH dehydrogenase (quinone)  29.61 
 
 
793 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0326  hydrogenase 4 subunit F  27.8 
 
 
486 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1405  NADH dehydrogenase subunit M  24.74 
 
 
532 aa  82  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0707014  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3982  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.83 
 
 
932 aa  81.6  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.728427 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1103  NADH dehydrogenase subunit M  30.09 
 
 
495 aa  81.3  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135594  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0693  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  27.37 
 
 
510 aa  80.9  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.378065  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2456  NADH dehydrogenase subunit M  26.08 
 
 
509 aa  80.9  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2556  NADH dehydrogenase subunit M  26.08 
 
 
509 aa  80.9  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28550  NADH dehydrogenase subunit M  28.23 
 
 
509 aa  80.5  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.101547  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1914  L-alanyl-D-glutamate peptidase  30.19 
 
 
655 aa  80.1  0.00000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3852  hydrogenase 4 subunit F  27.07 
 
 
483 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0294681  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1615  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.91 
 
 
485 aa  80.1  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.619005  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0874  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.66 
 
 
786 aa  80.1  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.755571  normal  0.723984 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1465  NADH dehydrogenase subunit M  25.19 
 
 
510 aa  80.1  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2821  NADH dehydrogenase subunit M  26.08 
 
 
509 aa  80.1  0.00000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.43  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1805  NADH dehydrogenase subunit M  25.19 
 
 
510 aa  80.1  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.168858 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1571  NADH dehydrogenase subunit M  25.19 
 
 
510 aa  80.1  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>