More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2282 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_2282  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  100 
 
 
425 aa  825    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.335323 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2055  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  70.42 
 
 
436 aa  531  1e-150  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0321  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  67.22 
 
 
425 aa  529  1e-149  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.583446  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1800  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  69.33 
 
 
429 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.916161 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0650  NADH dehydrogenase (quinone)  34 
 
 
476 aa  186  5e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208373  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1629  NADH dehydrogenase (quinone)  33.51 
 
 
476 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.22379  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1902  NADH dehydrogenase (quinone)  31.57 
 
 
1152 aa  177  2e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165011  normal  0.0801476 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0519  NADH dehydrogenase (quinone)  33.43 
 
 
476 aa  176  5e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0654  NADH dehydrogenase (quinone)  35.58 
 
 
474 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1305  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.65 
 
 
1128 aa  167  4e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1086  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.23 
 
 
500 aa  155  1e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0284  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit M  26.7 
 
 
517 aa  126  8.000000000000001e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000106102 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1281  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  29.87 
 
 
488 aa  121  3e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000193774 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0700  NADH dehydrogenase (quinone)  28.34 
 
 
484 aa  100  6e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.452975  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1304  NADH dehydrogenase (quinone)  28.57 
 
 
480 aa  99.4  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0582  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.72 
 
 
966 aa  96.7  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.041044 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3532  NADH dehydrogenase (quinone)  26.61 
 
 
480 aa  95.1  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.563705  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1691  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  27.09 
 
 
688 aa  94.4  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000143823  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1127  hydrogenase membrane subunit  29.29 
 
 
649 aa  94.7  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0224903  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1281  hydrogenase 4 subunit F  27.09 
 
 
538 aa  94  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0834276  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0587  NADH dehydrogenase (quinone)  25.75 
 
 
480 aa  93.6  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4288  NADH dehydrogenase (quinone)  31.17 
 
 
637 aa  92.4  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277072  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3852  hydrogenase 4 subunit F  27.35 
 
 
483 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0294681  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0184  NADH dehydrogenase (quinone)  28.48 
 
 
487 aa  92  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2554  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  25.61 
 
 
650 aa  90.1  7e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0107  NADH dehydrogenase (quinone)  27.12 
 
 
500 aa  90.1  7e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000249004 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3695  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.56 
 
 
782 aa  90.1  7e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.983526 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2712  hydrogenase 4 subunit F  26.35 
 
 
553 aa  89.4  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1263  hydrogenase 4 subunit F  26.4 
 
 
483 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0336263 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4571  hydrogenase 4 subunit F  26.45 
 
 
512 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2871  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  26.56 
 
 
537 aa  88.6  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0408599 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4494  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  28.9 
 
 
496 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.704587  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0326  hydrogenase 4 subunit F  25.88 
 
 
486 aa  88.6  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0660  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.11 
 
 
800 aa  87.4  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0122576  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0645  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.11 
 
 
800 aa  87.4  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3678  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  26.4 
 
 
496 aa  87.4  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0386913  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2633  hydrogenase 4 subunit F  26.64 
 
 
526 aa  87  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3708  hydrogenase 4 subunit F  27.34 
 
 
521 aa  87  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332962  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3982  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.23 
 
 
932 aa  86.7  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.728427 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0176  hydrogenase 4 subunit F  25.88 
 
 
486 aa  86.7  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.399009  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2620  hydrogenase 4 subunit F  26.04 
 
 
526 aa  86.7  8e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1190  hydrogenase 4 subunit F  26.04 
 
 
526 aa  86.7  8e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.647759 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6068  hydrogenase 4 subunit F  25.56 
 
 
486 aa  86.7  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0822285  hitchhiker  0.00325517 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1914  L-alanyl-D-glutamate peptidase  27.35 
 
 
655 aa  86.7  8e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2796  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  26.71 
 
 
537 aa  85.9  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.798229 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02378  NADH dehydrogenase subunit N  25.69 
 
 
526 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1183  NADH dehydrogenase (quinone)  25.69 
 
 
526 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0108  hydrogenase 4 subunit F  26.3 
 
 
486 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02340  hypothetical protein  25.69 
 
 
526 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3203  NADH dehydrogenase subunit L  25.72 
 
 
692 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161285  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1614  hydrogenase 4 subunit F  26.3 
 
 
486 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25200  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  30.7 
 
 
981 aa  85.1  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1959  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  24.78 
 
 
653 aa  85.1  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0502995 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50730  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.6 
 
 
933 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.284613  normal  0.0126871 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1529  hydrogenase 4 subunit F  26.3 
 
 
486 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1768  NADH dehydrogenase (quinone)  30.36 
 
 
792 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2529  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.97 
 
 
766 aa  85.1  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.997639  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0754  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  26.48 
 
 
501 aa  84.7  0.000000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000228157  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5142  NADH dehydrogenase subunit L  28.45 
 
 
620 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5534  NADH dehydrogenase subunit L  28.45 
 
 
604 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1822  hydrogenase membrane subunit  26.85 
 
 
643 aa  84.3  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0165692  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4974  NADH dehydrogenase subunit L  28.18 
 
 
620 aa  84  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4992  NADH dehydrogenase subunit L  28.18 
 
 
620 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2445  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.61 
 
 
969 aa  84.3  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3715  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.03 
 
 
952 aa  84  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.593151  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0748  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.06 
 
 
767 aa  84.3  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.114554  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5537  NADH dehydrogenase subunit L  27.4 
 
 
620 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0906168 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0870  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.02 
 
 
775 aa  84  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.867337 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1264  hydrogenase 4 subunit F  28.09 
 
 
463 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218764  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2102  NADH dehydrogenase (quinone)  31.56 
 
 
793 aa  83.6  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1673  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.8 
 
 
604 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1354  NADH dehydrogenase subunit L  25.72 
 
 
695 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0117862  normal  0.0417376 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4787  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.33 
 
 
475 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1072  NADH dehydrogenase subunit L  26.2 
 
 
682 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1077  NADH dehydrogenase (quinone)  32.66 
 
 
430 aa  82.8  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00864791  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2858  hydrogenase 4 subunit F  27.91 
 
 
517 aa  82.8  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  25.25 
 
 
662 aa  82.8  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.20305  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5383  NADH dehydrogenase subunit L  27.9 
 
 
620 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.0362e-16 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0281  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.82 
 
 
800 aa  82  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.305042  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0967  NADH dehydrogenase I, L subunit  24.72 
 
 
614 aa  82  0.00000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.597239  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1453  hydrogenase subunit, HycC-like protein  29.17 
 
 
644 aa  81.6  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1285  hydrogenase 4 subunit B  27.3 
 
 
673 aa  82  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.488809  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2622  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5(chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  32.74 
 
 
758 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2855  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.3 
 
 
769 aa  82  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0772  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  28.72 
 
 
496 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.256181  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1880  NADH dehydrogenase subunit L  26.13 
 
 
686 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.835925  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0014  NADH dehydrogenase I, L subunit  26.78 
 
 
655 aa  82  0.00000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0932  hydrogenase 4 subunit F  25.91 
 
 
483 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.187708  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0744  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.51 
 
 
969 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0726  NADH dehydrogenase subunit L  25.72 
 
 
679 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.608468  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5417  NADH dehydrogenase subunit L  27.95 
 
 
620 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1818  NADH dehydrogenase subunit L  25.72 
 
 
679 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.179044  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1998  NADH dehydrogenase subunit L  25.18 
 
 
689 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.304901 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0424  NADH dehydrogenase subunit L  25.72 
 
 
679 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.523849  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1252  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  29.39 
 
 
485 aa  81.6  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1753  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  25.41 
 
 
675 aa  81.3  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.7142  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0828  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  25.66 
 
 
658 aa  81.3  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2806  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  27.55 
 
 
997 aa  81.3  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.448623 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1040  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  25.38 
 
 
685 aa  81.6  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1141  NADH dehydrogenase subunit L  25.72 
 
 
679 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.237098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>