More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1281 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1281  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  100 
 
 
488 aa  950    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000193774 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1629  NADH dehydrogenase (quinone)  33.4 
 
 
476 aa  204  2e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.22379  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0519  NADH dehydrogenase (quinone)  35.03 
 
 
476 aa  196  8.000000000000001e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0654  NADH dehydrogenase (quinone)  33.74 
 
 
474 aa  192  1e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0650  NADH dehydrogenase (quinone)  34.53 
 
 
476 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208373  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1086  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  32.04 
 
 
500 aa  186  9e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1902  NADH dehydrogenase (quinone)  32.02 
 
 
1152 aa  173  5e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165011  normal  0.0801476 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1305  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.09 
 
 
1128 aa  167  5e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0284  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit M  32.42 
 
 
517 aa  167  5e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000106102 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0321  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.37 
 
 
425 aa  139  8.999999999999999e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.583446  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1800  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.84 
 
 
429 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.916161 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2282  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  28.94 
 
 
425 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.335323 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2055  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.21 
 
 
436 aa  117  5e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1598  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  27.41 
 
 
545 aa  111  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0851  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  27.36 
 
 
545 aa  108  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.157945  normal  0.412273 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0192  NADH dehydrogenase subunit L  27.74 
 
 
610 aa  107  5e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0853  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  26.75 
 
 
545 aa  105  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1691  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  29.41 
 
 
688 aa  103  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000143823  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5537  NADH dehydrogenase subunit L  28.78 
 
 
620 aa  103  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0906168 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0752  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  26.47 
 
 
545 aa  102  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.511316  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3914  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  27.14 
 
 
535 aa  102  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0719914  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3998  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  27.14 
 
 
535 aa  101  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000144113 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1030  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  27.2 
 
 
511 aa  100  4e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1864  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  27.23 
 
 
544 aa  101  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0594  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  27.78 
 
 
512 aa  100  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.926621  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0643  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  26.72 
 
 
544 aa  99.8  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.552071  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3532  NADH dehydrogenase (quinone)  28.75 
 
 
480 aa  99.4  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.563705  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10561  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  26.84 
 
 
523 aa  98.6  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1533  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.45 
 
 
628 aa  98.6  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2411  NADH dehydrogenase subunit M  27.78 
 
 
502 aa  99  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139684  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0816  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  26.39 
 
 
497 aa  99  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2882  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit M  28.9 
 
 
534 aa  98.2  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.139376  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2161  NADH dehydrogenase (quinone)  27.02 
 
 
501 aa  98.2  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1518  NADH dehydrogenase subunit L  27.38 
 
 
613 aa  98.2  3e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.282876  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3405  NADH dehydrogenase subunit L  29.57 
 
 
617 aa  97.8  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4285  NADH dehydrogenase (quinone)  28.43 
 
 
499 aa  97.8  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.14859  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0931  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  26.95 
 
 
504 aa  97.8  4e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.743179  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1728  NADH dehydrogenase subunit M  26.32 
 
 
512 aa  97.8  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.694351  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0587  NADH dehydrogenase (quinone)  29.73 
 
 
480 aa  97.8  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3247  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  28.21 
 
 
678 aa  97.4  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1656  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  30.16 
 
 
495 aa  96.7  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.750988  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5417  NADH dehydrogenase subunit L  27.16 
 
 
620 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0814  NADH dehydrogenase subunit M  26.56 
 
 
502 aa  96.3  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669912  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0672  NADH dehydrogenase (quinone)  29.72 
 
 
645 aa  96.3  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.922518  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0970  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  24.94 
 
 
545 aa  96.3  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0163848  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0932  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, M subunit  25.83 
 
 
497 aa  95.1  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3402  F420H2 dehydrogenase subunit M  27.49 
 
 
495 aa  95.9  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00767556  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1926  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  28.69 
 
 
522 aa  95.1  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.676502  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06201  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  28.68 
 
 
513 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.347032  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4380  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  28.99 
 
 
698 aa  95.1  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18571  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  26.5 
 
 
523 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.960985 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1007  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  25.88 
 
 
527 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.244989  normal  0.172272 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1453  hydrogenase subunit, HycC-like protein  26.67 
 
 
644 aa  94.7  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06501  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  27.92 
 
 
513 aa  94.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_803  NADH:quinone oxidoreductase subunit 4 (chain M)  25.56 
 
 
497 aa  94.7  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06591  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  28.17 
 
 
512 aa  94.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3293  NADH dehydrogenase subunit L  30.14 
 
 
617 aa  94.7  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0815  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.56 
 
 
654 aa  94  5e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5090  NADH dehydrogenase subunit L  28.75 
 
 
620 aa  94  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3814  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  30.35 
 
 
490 aa  94  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3530  NADH dehydrogenase (quinone)  27.08 
 
 
470 aa  94  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2796  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  29.1 
 
 
537 aa  94  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1073  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  26.13 
 
 
527 aa  93.6  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.397792  normal  0.614174 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1202  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  26.13 
 
 
527 aa  94  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4402  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  26.13 
 
 
506 aa  93.6  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.807836 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4992  NADH dehydrogenase subunit L  28.04 
 
 
620 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1273  NADH dehydrogenase subunit M  26.45 
 
 
503 aa  93.6  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218995  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3982  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.49 
 
 
932 aa  93.6  8e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.728427 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0713  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  26.9 
 
 
509 aa  93.2  9e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.288184  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5413  NADH dehydrogenase subunit L  28.04 
 
 
620 aa  93.2  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5142  NADH dehydrogenase subunit L  27.79 
 
 
620 aa  92.8  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4974  NADH dehydrogenase subunit L  28.04 
 
 
620 aa  93.2  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1365  NADH dehydrogenase subunit M  25.61 
 
 
503 aa  93.2  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288443  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0694  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  28.85 
 
 
672 aa  93.2  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.284575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5534  NADH dehydrogenase subunit L  27.79 
 
 
604 aa  93.2  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0943  NADH dehydrogenase (quinone)  27.45 
 
 
723 aa  92.8  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.730208  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0809  NADH dehydrogenase subunit M  26.29 
 
 
502 aa  92.8  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4232  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  26.29 
 
 
525 aa  92.8  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177133  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2456  NADH dehydrogenase (quinone)  27.76 
 
 
662 aa  92.8  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0192367  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5468  NADH dehydrogenase subunit L  29.47 
 
 
620 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0030  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  27.76 
 
 
524 aa  92.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_802  NADH:quinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)  29.94 
 
 
654 aa  91.7  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06501  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  27.76 
 
 
524 aa  92  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5383  NADH dehydrogenase subunit L  27.79 
 
 
620 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.0362e-16 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1059  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  26.19 
 
 
502 aa  92  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0350  NADH dehydrogenase I, M subunit  26.14 
 
 
522 aa  91.7  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1667  NADH dehydrogenase subunit L  27.3 
 
 
612 aa  91.3  3e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3815  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  28.61 
 
 
618 aa  91.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205922  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1538  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.4 
 
 
953 aa  91.7  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0170317 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  26.72 
 
 
675 aa  91.7  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0931  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, L subunit  29.94 
 
 
654 aa  91.3  4e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0968  NADH dehydrogenase I, M subunit  29.72 
 
 
480 aa  91.3  4e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.806652  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2849  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  27.42 
 
 
933 aa  90.9  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3836  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  29.97 
 
 
560 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4138  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  26.45 
 
 
506 aa  91.3  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.68162  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2806  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.29 
 
 
997 aa  91.3  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.448623 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1297  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  26.78 
 
 
517 aa  90.5  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.310609  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1627  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.61 
 
 
656 aa  90.9  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1367  NADH dehydrogenase subunit M  27.61 
 
 
504 aa  90.9  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73718  normal  0.0186615 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1865  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  28.33 
 
 
758 aa  90.5  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.13806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>