More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0921 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_0921  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  100 
 
 
249 aa  508  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.39802 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0822  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  68.8 
 
 
255 aa  341  7e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2990  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  68.27 
 
 
255 aa  340  1e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.234914  normal  0.405156 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2482  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  68 
 
 
254 aa  333  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.479189  normal  0.154733 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0353  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  68.4 
 
 
254 aa  332  4e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.363775  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0825  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  67.6 
 
 
254 aa  331  6e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1578  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  63.2 
 
 
251 aa  320  9.999999999999999e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1719  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  58.63 
 
 
274 aa  284  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1643  NAD(+) kinase  57.2 
 
 
288 aa  281  6.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2701  NAD(+) kinase  55.2 
 
 
255 aa  278  4e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2250  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  54 
 
 
257 aa  267  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.430774  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3856  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  55.82 
 
 
274 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0609  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  53.6 
 
 
257 aa  266  2e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.175662  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0520  NAD(+) kinase  55.02 
 
 
256 aa  264  1e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.250733 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1407  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  54.84 
 
 
257 aa  264  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809268  normal  0.698974 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1335  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  54.22 
 
 
261 aa  262  4e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3106  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  55.42 
 
 
259 aa  262  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0484  NAD(+) kinase  54.22 
 
 
256 aa  261  8e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1308  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  54.84 
 
 
257 aa  261  8e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.951629  normal  0.0573705 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0549  NAD(+) kinase  54.22 
 
 
256 aa  261  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0517  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  57.32 
 
 
269 aa  261  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3061  NAD(+) kinase  55.02 
 
 
253 aa  261  1e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5026  NAD(+) kinase  54.62 
 
 
255 aa  260  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265111  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0937  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  52.4 
 
 
265 aa  258  5.0000000000000005e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0932  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  52.4 
 
 
265 aa  258  5.0000000000000005e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1663  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  53.41 
 
 
259 aa  258  7e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.653393  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2196  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  55.82 
 
 
259 aa  258  8e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0360183 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0830  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  54.62 
 
 
255 aa  258  8e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3237  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  54.22 
 
 
259 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0627162  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5356  NAD(+) kinase  52.21 
 
 
256 aa  254  8e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0700115 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6083  ATP-NAD/AcoX kinase  52.61 
 
 
256 aa  254  9e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.21229  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0935  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  53.82 
 
 
256 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0863  NAD(+) kinase  54.22 
 
 
263 aa  253  2.0000000000000002e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.302398  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5177  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  54.22 
 
 
259 aa  249  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526752  normal  0.979978 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00767  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  52.59 
 
 
258 aa  247  1e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.526099  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0963  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  54.07 
 
 
257 aa  246  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.127918  hitchhiker  0.00623774 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2604  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  52.59 
 
 
257 aa  246  2e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37131  normal  0.175706 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1656  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  51.19 
 
 
256 aa  245  4.9999999999999997e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.739185 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1521  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  51.39 
 
 
257 aa  244  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.611356 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2254  NAD(+) kinase  51 
 
 
263 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0783  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  48.77 
 
 
263 aa  240  1e-62  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.897592  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1804  hypothetical protein  55.95 
 
 
233 aa  237  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1984  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  49.01 
 
 
261 aa  234  8e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1774  NAD(+) kinase  51.52 
 
 
267 aa  234  9e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1772  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  52.8 
 
 
258 aa  234  9e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.617823  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0225  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  46.72 
 
 
263 aa  226  2e-58  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1840  putative inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  48.31 
 
 
209 aa  194  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0871  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  39.11 
 
 
264 aa  182  6e-45  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.93065  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0310  putative ATP-NAD kinase  34.65 
 
 
253 aa  148  7e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.634813  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1238  NAD(+) kinase  35.11 
 
 
312 aa  93.2  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.299312  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3081  ATP-NAD/AcoX kinase  38.85 
 
 
287 aa  82.8  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0853  NAD(+) kinase  29.89 
 
 
278 aa  80.5  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000000499611  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2191  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  30.27 
 
 
275 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.186167 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0840  NAD(+) kinase  32.45 
 
 
271 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.947583  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0877  ATP-NAD/AcoX kinase  26.38 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5430  ATP-NAD/AcoX kinase  36.6 
 
 
301 aa  77  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.399636 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2371  ATP-NAD/AcoX kinase  32.8 
 
 
282 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1396  NAD(+) kinase  32.79 
 
 
288 aa  75.5  0.0000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1035  NAD(+)/NADH kinase family protein  37.36 
 
 
318 aa  75.5  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0428  hypothetical protein  30 
 
 
271 aa  75.5  0.0000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.797471 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1773  NAD(+) kinase  29.25 
 
 
301 aa  75.1  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2504  NAD(+)/NADH kinase family protein  34.68 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.586186  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2650  NAD(+)/NADH kinase family protein  34.76 
 
 
302 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.219637  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1525  ATP-NAD/AcoX kinase  32.41 
 
 
290 aa  75.1  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.367967  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2509  ATP-NAD/AcoX kinase  28.44 
 
 
285 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000348175  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1284  ATP-NAD/AcoX kinase  37.09 
 
 
289 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2370  ATP-NAD/AcoX kinase  31.82 
 
 
283 aa  75.1  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.109777 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2481  NAD(+)/NADH kinase family protein  34.29 
 
 
312 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0669  ATP-NAD/AcoX kinase  28.57 
 
 
294 aa  73.6  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.935643  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2628  ATP-NAD/AcoX kinase  23.63 
 
 
289 aa  73.2  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0843038  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1094  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  28.77 
 
 
278 aa  72.4  0.000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.06039  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0983  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  29.07 
 
 
293 aa  72.4  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.709246 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2887  NAD(+)/NADH kinase family protein  36.21 
 
 
312 aa  72.4  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1301  NAD(+)/NADH kinase family protein  34.24 
 
 
299 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00867601  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0835  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  33.78 
 
 
302 aa  72  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2339  ATP-NAD/AcoX kinase  34.42 
 
 
270 aa  72  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.185835 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16881  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  33.78 
 
 
302 aa  72  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1390  NAD(+) kinase  31.77 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3285  NAD(+)/NADH kinase family protein  33.66 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.178669  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04760  NADH kinase, putative  30.88 
 
 
390 aa  71.2  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3328  NAD(+)/NADH kinase family protein  33.66 
 
 
345 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1085  NAD(+) kinase  29.89 
 
 
284 aa  71.6  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3318  NAD(+)/NADH kinase family protein  33.66 
 
 
345 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2573  NAD(+) kinase  31.33 
 
 
285 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.108647  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0731  NAD(+)/NADH kinase family protein  34.09 
 
 
300 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.988053 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2332  NAD(+)/NADH kinase family protein  33.66 
 
 
300 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1752  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  33.84 
 
 
295 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.000623558 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2618  NAD(+) kinase  34.41 
 
 
292 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3488  NAD(+)/NADH kinase family protein  33.49 
 
 
306 aa  70.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000826356 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2213  NAD(+)/NADH kinase family protein  33.66 
 
 
344 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1903  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  27.95 
 
 
297 aa  70.5  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986122  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1106  NAD(+)/NADH kinase family protein  33.66 
 
 
320 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479863  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2471  ATP-NAD/AcoX kinase  31.77 
 
 
316 aa  70.5  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.462719 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0493  NAD(+)/NADH kinase family protein  33.66 
 
 
300 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0560  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  29.94 
 
 
569 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2681  ATP-NAD/AcoX kinase  32 
 
 
285 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0914  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.01 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1352  NAD(+) kinase  34.01 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0123507  normal  0.0209286 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1488  ATP-NAD/AcoX kinase  29.02 
 
 
301 aa  70.1  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0451  ATP-NAD kinase  32.35 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>